| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 2,262,756 | A→C | 37.1% | intergenic (‑126/+297) | yeiC ← / ← fruA | kinase/fused fructose‑specific PTS enzyme IIB'BC components |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 2,262,756 | 0 | A→C | 37.1% | 0.0 ‑2.6 ‑0.0 | 258 | intergenic (‑126/+297) | yeiC/fruA | kinase/fused fructose‑specific PTS enzyme IIB'BC components |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (40/56): ref base (87/75): total (127/131) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 7.16e-02 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.83e-01 | ||||||||||
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
CAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACAAAATGCGATTAAATGCCTGAATTACAAAAGCGAGGAATTTGTGACGGGATGCAC > NC_007779/2262656‑2262856 | cAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACgtaaagta < 1:1231985/101‑1 (MQ=255)cAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACgtaaagta < 1:2612443/101‑1 (MQ=255) ccTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAAtt > 1:686690/1‑101 (MQ=255) cTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAATACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTa > 1:3783221/1‑101 (MQ=255) cTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTCAATTa < 1:14039794/101‑1 (MQ=255) cTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTa > 1:12753822/1‑101 (MQ=255) cTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTa < 1:11859875/101‑1 (MQ=255) tGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTAc < 1:629877/101‑1 (MQ=255) tGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTAc < 1:1188323/101‑1 (MQ=255) gTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTCAATTAcc < 1:3044472/101‑1 (MQ=255) gTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTAcc < 1:9784821/101‑1 (MQ=255) tCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTCAATTACCg < 1:4231518/101‑1 (MQ=255) tCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCg < 1:13743754/101‑1 (MQ=255) cAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGc > 1:13327170/1‑101 (MQ=255) cAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGc > 1:14669805/1‑101 (MQ=255) aaTCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGcc < 1:11752515/101‑1 (MQ=255) aTCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCa > 1:2100807/1‑101 (MQ=255) aaGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAgg > 1:2587734/1‑101 (MQ=255) aaGAATATAGATACCGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAgg < 1:11383245/101‑1 (MQ=255) atatAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTCAATTACCGCCAGAGAGGCaaa < 1:10155946/101‑1 (MQ=255) atatAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCaaa > 1:1900877/1‑101 (MQ=255) atatAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCaaa < 1:5007460/101‑1 (MQ=255) ataGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAAt > 1:3568649/1‑101 (MQ=255) ataGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAAt < 1:5364187/101‑1 (MQ=255) aGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATgg > 1:2222715/1‑101 (MQ=255) aGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATCCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATgg > 1:7435427/1‑101 (MQ=255) aTACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTCAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGc < 1:10058425/101‑1 (MQ=255) tACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTCAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCa > 1:3346048/1‑101 (MQ=255) tACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCa < 1:13497028/101‑1 (MQ=255) cAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGAttt < 1:13238178/101‑1 (MQ=255) aaaGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTCAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTg > 1:12909251/1‑101 (MQ=255) aaaGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTCAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTg > 1:11415612/1‑101 (MQ=255) aaGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGa > 1:1940167/1‑101 (MQ=255) aGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAg > 1:7273137/1‑101 (MQ=255) gACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTCAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGc < 1:4402160/101‑1 (MQ=255) gACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGc < 1:9309155/101‑1 (MQ=255) aCGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCa > 1:11074862/1‑101 (MQ=255) aCGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCa > 1:5815383/1‑101 (MQ=255) cGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAg < 1:4711781/101‑1 (MQ=255) ggTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTCAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAgg > 1:7151012/1‑101 (MQ=255) gTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGc < 1:3119239/101‑1 (MQ=255) tttAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTCAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCt > 1:9380490/1‑101 (MQ=255) tAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTca > 1:10840165/1‑101 (MQ=255) aaaCATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTcac < 1:10651130/101‑1 (MQ=255) aaCATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTCAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTcaca > 1:3084730/1‑101 (MQ=255) aCATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACaa > 1:11581658/1‑101 (MQ=255) cATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACaaa > 1:7914285/1‑101 (MQ=255) aTGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTCAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACaaaa > 1:9832926/1‑101 (MQ=255) 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ttCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTCAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACAAAATGCGa < 1:9578597/101‑1 (MQ=255) ttCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTCAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACAAAATGCGa < 1:13504384/101‑1 (MQ=255) ttCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACAAAATGCGa > 1:6657964/1‑101 (MQ=255) cATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACAAAATGCGAtt < 1:3462269/101‑1 (MQ=255) atTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACAAAATGCGATTaaa > 1:12914170/1‑101 (MQ=255) atTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACAAAATGCGATTaaa > 1:1309129/1‑101 (MQ=255) ttAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACAAAATGCGATTAAATg < 1:8275972/101‑1 (MQ=255) 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taaagtaaaTTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACAAAATGCGATTAAATGCCTGAATTACAAAAGCGAGGAATTTGTGACggg > 1:4927164/1‑101 (MQ=255) aaagtaaaTTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACAAAATGCGATTAAATGCCTGAATTACAAAAGCGAGGAATTTGTGACGGGa > 1:12179758/1‑101 (MQ=255) aagtcaaTTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACAAAATGCGATTAAATGCCTGAATTACAAAAGCGAGGAATTTGTGACGGGAt < 1:2633952/101‑1 (MQ=255) | CAACCCTGTCAATCCACAAGAATATAGATACTGCAAAGACGGTTTAAACATGTGTTCATATTTAAACATGTGCTCATAGTATGCATGTTTTACGTAAAGTAAATTACCGCCAGAGAGGCAAAATGGGCAGATTTGAGCAGGCTCACAAAATGCGATTAAATGCCTGAATTACAAAAGCGAGGAATTTGTGACGGGATGCAC > NC_007779/2262656‑2262856 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |