Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 274,547 | A→G | 100% | intergenic (‑206/‑2) | insH ← / → mmuP | IS5 transposase and trans‑activator/S‑methylmethionine transporter |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 274,547 | 0 | A→G | 100.0% | 1250.8 | 294 | intergenic (‑206/‑2) | insH/mmuP | IS5 transposase and trans‑activator/S‑methylmethionine transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (142/151): ref base (0/1): total (142/152) |
Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
CATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTATATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATT > NC_007779/274449‑274643 | cTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGc > 1:7436422/1‑101 (MQ=255) cTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGc > 1:6662948/1‑101 (MQ=255) cGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCaaa < 1:325680/101‑1 (MQ=255) cTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAaacaa > 1:2099619/1‑101 (MQ=255) cTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAaacaa > 1:5195140/1‑101 (MQ=255) tGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAaacaac > 1:12177833/1‑101 (MQ=255) ggTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAacaaca < 1:14566406/101‑1 (MQ=255) ggTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAacaaca < 1:1648861/101‑1 (MQ=255) ggTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAacaaca < 1:1665657/101‑1 (MQ=255) ggTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAacaaca > 1:13745925/1‑101 (MQ=255) tGCAAGGTTGACTTTGCCTTCTGTTAACAAACGCGTTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTTTGCAAacaacaca < 1:3450921/101‑1 (MQ=255) gCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAacaacacaa > 1:2325167/1‑101 (MQ=255) gCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAacaacacaa < 1:7833797/101‑1 (MQ=255) cAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAacaacacaac < 1:14308478/101‑1 (MQ=255) gTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACaaaa < 1:9581673/101‑1 (MQ=255) ttGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAAt < 1:3393263/101‑1 (MQ=255) ttGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAAt > 1:14367488/1‑101 (MQ=255) ttaCTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATg > 1:7658313/3‑101 (MQ=255) tGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATg > 1:4255889/1‑101 (MQ=255) tGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGCCCATACCTTTAAAAGGTTGTATGCCAAAAACACAACAAAAtc > 1:6882102/1‑100 (MQ=255) tGACTTTGCATTCTGGTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATg < 1:11199208/101‑1 (MQ=255) gcttttGCATCTTGTTACCAACCGGGGTATACCAACCCTTTTTTGGATTTTTAGTTGT‑CATTCGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATgcg < 1:10498326/98‑1 (MQ=255) gaatttGCATTCTGTTAACAAGCGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATgc < 1:242785/98‑1 (MQ=255) gACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATgc < 1:6077141/101‑1 (MQ=255) gACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATgc < 1:8767763/101‑1 (MQ=255) aCTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATgcg < 1:11359113/101‑1 (MQ=255) cTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATgcg‑c < 1:198131/101‑1 (MQ=255) tttGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑cc > 1:1532060/1‑101 (MQ=255) gCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACt > 1:8568422/1‑101 (MQ=255) gCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACt < 1:3907745/101‑1 (MQ=255) aTTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGa < 1:5671348/101‑1 (MQ=255) tCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAg < 1:8514041/101‑1 (MQ=255) tCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAg > 1:6341922/1‑101 (MQ=255) tCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAg > 1:4568221/1‑101 (MQ=255) tCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAg < 1:14928269/101‑1 (MQ=255) tCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAg > 1:10729900/1‑101 (MQ=255) cTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAgc > 1:5371969/1‑101 (MQ=255) tGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAgcg > 1:7144119/1‑101 (MQ=255) gTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAgcgc > 1:1835050/1‑101 (MQ=255) ttAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGca < 1:12322341/101‑1 (MQ=255) aaaCGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATg < 1:828236/101‑1 (MQ=255) aaCGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGa < 1:10297469/101‑1 (MQ=255) cgcgGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGaaa > 1:7900884/1‑101 (MQ=255) gcgGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGaaaa > 1:8164262/1‑101 (MQ=255) gcgGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGaaaa > 1:6505183/1‑101 (MQ=255) cgGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAAc > 1:4416666/1‑101 (MQ=255) cgGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAAc < 1:11277053/101‑1 (MQ=255) ggTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAAcg > 1:5267671/1‑101 (MQ=255) ggTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTAAGAGTTCCATAGGTTTAAAAGTTGGAATGAAAACAA‑AAAAAAAAATGGGACCATTAAAGGGCAAAAAGAAAAcg > 1:17029/1‑101 (MQ=255) aaCAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCa < 1:2397364/101‑1 (MQ=255) aCAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCAc < 1:10194722/101‑1 (MQ=255) cAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCAcc > 1:7602574/1‑101 (MQ=255) cAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCAcc > 1:9215267/1‑101 (MQ=255) cAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCAcc > 1:13369730/1‑101 (MQ=255) aaaCCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCt < 1:13871988/101‑1 (MQ=255) aaaCCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCt > 1:13250124/1‑101 (MQ=255) cttcttTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGAtt < 1:10019146/101‑1 (MQ=255) cttcttTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGAtt > 1:3819924/1‑101 (MQ=255) tttGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGc > 1:5969683/1‑101 (MQ=255) tttGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGc > 1:14210466/1‑101 (MQ=255) ttGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCt < 1:9004277/101‑1 (MQ=255) ggATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCttt > 1:11778658/1‑101 (MQ=255) ggATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCttt > 1:3568725/1‑101 (MQ=255) tGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCt > 1:5165975/1‑101 (MQ=255) tGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCt > 1:497190/1‑101 (MQ=255) tGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCt > 1:14619193/1‑101 (MQ=255) gTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCtt < 1:2898877/101‑1 (MQ=255) tttAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTg > 1:9733798/1‑101 (MQ=255) tttAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTg < 1:5067202/101‑1 (MQ=255) tttAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTg < 1:4770597/101‑1 (MQ=255) tttAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTg < 1:12553042/101‑1 (MQ=255) tAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAGATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTggg > 1:12922884/1‑101 (MQ=255) aGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGggc < 1:3692988/101‑1 (MQ=255) tGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGggcggc > 1:13545125/1‑101 (MQ=255) gTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGgcggcg > 1:13200470/1‑101 (MQ=255) tCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGt > 1:3160046/1‑101 (MQ=255) tCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTGCCTTGGGCGGCGt > 1:12455585/1‑101 (MQ=255) cATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGa > 1:1151520/1‑101 (MQ=255) aTACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGAt > 1:11887004/1‑101 (MQ=255) aTACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGAt < 1:5923300/101‑1 (MQ=255) aTACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGAt > 1:9449563/1‑101 (MQ=255) cGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTgg > 1:14763661/1‑101 (MQ=255) cGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTgg < 1:10434215/101‑1 (MQ=255) cGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTgg < 1:4636310/101‑1 (MQ=255) gTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGc < 1:2643703/101‑1 (MQ=255) tttAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGca > 1:693711/1‑101 (MQ=255) tttAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGca < 1:10953621/101‑1 (MQ=255) tttAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGca < 1:13065230/101‑1 (MQ=255) ttAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGcac > 1:6217501/1‑101 (MQ=255) tAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGcaca > 1:1396564/1‑101 (MQ=255) aGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAg > 1:14002011/1‑101 (MQ=255) aGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAg < 1:10615606/101‑1 (MQ=255) gAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAgg > 1:10795357/1‑101 (MQ=255) aaGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGa > 1:8715266/1‑101 (MQ=255) aaGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGa > 1:4013809/1‑101 (MQ=255) aaGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGa > 1:10047736/1‑101 (MQ=255) aaGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGAGCACAATGAAAAGGAGTCACTTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGAGTGATTGGCACAGGa > 1:406858/1‑101 (MQ=255) aGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGat > 1:6838366/1‑101 (MQ=255) ggTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGatt < 1:397517/101‑1 (MQ=255) ggTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGata < 1:14869014/101‑2 (MQ=255) | CATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTATATGCAAACAACACAACAAAATGCG‑CCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATT > NC_007779/274449‑274643 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |