Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 4,546,535 | T→A | 100% | intergenic (+296/‑182) | fimB → / → fimE | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA/tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 4,546,535 | 0 | T→A | 100.0% | 1063.1 | 258 | intergenic (+296/‑182) | fimB/fimE | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA/tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (145/113): ref base (0/0): total (145/113) |
Only 100 of 281 total aligned reads displayed.
TACACATCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCT > NC_007779/4546437‑4546632 | tACACATCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGaatcaaaaca < 1:10461374/101‑1 (MQ=255) acacATCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAatcaaaacaa < 1:9404676/101‑1 (MQ=255) cacaTCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAAt > 1:14423726/1‑101 (MQ=255) caTCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGa < 1:7669211/101‑1 (MQ=255) tCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGaaa < 1:5639625/101‑1 (MQ=255) cACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGaaaa > 1:7924231/1‑101 (MQ=255) aCTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAAt > 1:5132030/1‑101 (MQ=255) aCTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAAt > 1:4577266/1‑101 (MQ=255) ttAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAg < 1:9759815/101‑1 (MQ=255) ttAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAg > 1:3605498/1‑101 (MQ=255) ttAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAg > 1:13083285/1‑101 (MQ=255) aaaaTCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAt < 1:2251160/101‑1 (MQ=255) aaTCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAGGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgt < 1:10100183/101‑1 (MQ=255) aaTCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgt < 1:11387227/101‑1 (MQ=255) aaTCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgt > 1:11360230/1‑101 (MQ=255) aTCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgtt > 1:1644841/1‑101 (MQ=255) aTCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgtt < 1:12741486/101‑1 (MQ=255) aTCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgtt > 1:7290487/1‑101 (MQ=255) tctcCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgttg > 1:12156645/1‑101 (MQ=255) tctcCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgttg > 1:14825408/1‑101 (MQ=255) ctcCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgttgt > 1:3804269/1‑101 (MQ=255) ctcCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgttgt < 1:1209057/101‑1 (MQ=255) ctcCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgttgt > 1:8208707/1‑101 (MQ=255) tcCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTc < 1:463821/101‑1 (MQ=255) ccTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTca > 1:7195719/1‑101 (MQ=255) ccTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTca < 1:7453030/101‑1 (MQ=255) cTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTcac > 1:13414991/1‑101 (MQ=255) tGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTcaca > 1:7833691/1‑101 (MQ=255) tGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTcaca > 1:8728134/1‑101 (MQ=255) tGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTcaca > 1:11133192/1‑101 (MQ=255) gTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACAt < 1:14299823/101‑1 (MQ=255) gTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACAt > 1:11089618/1‑101 (MQ=255) tttCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATc > 1:6894193/1‑101 (MQ=255) tttCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATc > 1:8883985/1‑101 (MQ=255) ttCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCa > 1:5930045/1‑101 (MQ=255) ttCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCa < 1:12450273/101‑1 (MQ=255) gCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGa < 1:4792985/101‑1 (MQ=255) gCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGa > 1:13208459/1‑101 (MQ=255) gCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGa < 1:13704887/101‑1 (MQ=255) gCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGa < 1:13745946/101‑1 (MQ=255) cACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGat < 1:6441558/101‑1 (MQ=255) aCTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGata < 1:13249758/101‑1 (MQ=255) aCTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGata < 1:9500277/101‑1 (MQ=255) cTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGatat > 1:5696617/1‑101 (MQ=255) cTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGatat < 1:3454768/101‑1 (MQ=255) ttttCTTTGTTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtatttt < 1:8935101/101‑1 (MQ=255) ttttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtatttt > 1:10675101/1‑101 (MQ=255) ttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtattttat < 1:7096257/101‑1 (MQ=255) cTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtattttattt > 1:6308980/1‑101 (MQ=255) tttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATCGATGTTGTCACATCAGTGATattttatttt < 1:12871963/101‑1 (MQ=255) tttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATattttatttt > 1:11023404/1‑101 (MQ=255) tttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATattttatttt < 1:4073571/101‑1 (MQ=255) tttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATattttatttt > 1:2796589/1‑101 (MQ=255) tATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTg > 1:9384374/1‑101 (MQ=255) aTTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGt < 1:4229866/101‑1 (MQ=255) aTTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGt < 1:1312861/101‑1 (MQ=255) ttttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTa > 1:9095528/1‑101 (MQ=255) tttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTAt > 1:4359121/1‑101 (MQ=255) tttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGa > 1:14933759/1‑101 (MQ=255) tttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGa > 1:10850167/1‑101 (MQ=255) ttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGat < 1:14052029/101‑1 (MQ=255) tAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGata < 1:8286528/101‑1 (MQ=255) aaGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGctat < 1:14698314/101‑1 (MQ=255) gCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATAttt < 1:1970331/101‑1 (MQ=255) cAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTa < 1:1897056/101‑1 (MQ=255) aaCTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTaa > 1:5274488/1‑101 (MQ=255) gcTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAAt > 1:9623555/2‑101 (MQ=255) aCTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAGATTTTATTTTTGTATGATATTTAAt < 1:1978863/101‑1 (MQ=255) ggAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTa > 1:8055880/1‑101 (MQ=255) ggAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTa > 1:9362820/1‑101 (MQ=255) ggAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTa > 1:338039/1‑101 (MQ=255) aaGTTAATCCACTGCACTCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAGTAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAAt > 1:12661722/1‑101 (MQ=255) aGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAAtt < 1:10956730/101‑1 (MQ=255) aGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAAtt < 1:6984804/101‑1 (MQ=255) aaTCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTCTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACt < 1:8533839/101‑1 (MQ=255) ccACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGAt > 1:12040787/1‑101 (MQ=255) cACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATa < 1:6570050/101‑1 (MQ=255) cTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGc > 1:829050/1‑101 (MQ=255) cTGCAATCTATTGTTATATTG‑ATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGcc > 1:11886563/1‑101 (MQ=255) tGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGcc > 1:300746/1‑101 (MQ=255) tGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGcc > 1:3931830/1‑101 (MQ=255) tATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCAc < 1:9215898/101‑1 (MQ=255) tATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCAc > 1:8362802/1‑101 (MQ=255) tGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTcc > 1:11438969/1‑101 (MQ=255) tGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTcc > 1:12788063/1‑101 (MQ=255) tGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTcc > 1:4693120/1‑101 (MQ=255) gTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCg > 1:802022/1‑101 (MQ=255) gTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCg > 1:11625069/1‑101 (MQ=255) tataTTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtg > 1:13667166/1‑101 (MQ=255) tataTTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtg > 1:9016442/1‑101 (MQ=255) atTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtgtgt > 1:13932760/1‑101 (MQ=255) atTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtgtgt > 1:7146055/1‑101 (MQ=255) tGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTgg > 1:6380294/1‑101 (MQ=255) gAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGt > 1:2550958/1‑101 (MQ=255) gAAACAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCAGATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGt > 1:10236841/1‑101 (MQ=255) tcaaaacaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTAt > 1:2346175/1‑101 (MQ=255) caaaacaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATc > 1:2078186/1‑101 (MQ=255) aaaacaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCt > 1:10291057/1‑101 (MQ=255) aaaacaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCt > 1:776133/1‑101 (MQ=255) aaaacaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCt < 1:12519083/101‑1 (MQ=255) | TACACATCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCT > NC_007779/4546437‑4546632 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |