New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 1909196 = | 176 (0.610) | 116 (0.400) | 76/180 | NT | 39.7% | coding (110/144 nt) | yobF | hypothetical protein |
? | NC_007779 | = 2412225 | NA (NA) | intergenic (‑55/‑782) | insA/yfbQ | IS1 element protein/aminotransferase |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TTTTCAGTAAAGAAGTCCTGAGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/1909295‑1909196 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC < NC_007779/2412225‑2412126 TTTTCAGTAAAGAAGTCCTGAGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCG < 1:8235813/101‑1 TTTCAGTAAAGAAGTCCTGAGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGG > 1:7680585/1‑101 GTAAAGAAGTCCTGAGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATG < 1:1005707/101‑1 TAAAGAAGTCCTGAGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGC < 1:2753049/101‑1 TAAAGAAGTCCTGAGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGC > 1:10489370/1‑101 TAAAGAAGTCCTGAGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCATTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGC > 1:13882037/1‑101 AAAGAAGTCCTGAGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTTCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCT < 1:10465132/101‑1 AAAGAAGTCCTGAGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCT > 1:5144287/1‑101 AAAGAAGTCCTGAGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCT > 1:3805969/1‑101 AAAGAAGTCCTGAGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCT < 1:5614960/101‑1 AAGAAGTCCTGAGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTG < 1:5749839/101‑1 AAGTCCTGAGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCA > 1:3285989/1‑101 AGTCCTGAGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAA > 1:12738138/1‑101 TCCTGAGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACT > 1:884027/1‑101 TGAGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTAC > 1:881047/1‑101 TGAGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTAC > 1:4491173/1‑101 GAGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACT < 1:10227692/101‑1 GAGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACT < 1:7815389/101‑1 AGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTG < 1:2723756/101‑1 GTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGA < 1:1141107/101‑1 AAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT > 1:4278203/1‑101 ACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT > 1:888487/1‑101 ACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:10132329/101‑1 ACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT > 1:3864183/1‑101 CGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG < 1:7077616/101‑1 CGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG < 1:10561712/101‑1 GTTGACTTTAAATCCCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:8485699/101‑1 GTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTGATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT > 1:14279667/1‑101 GTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:8575498/101‑1 GTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:1391405/101‑1 GTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:12117134/101‑1 GTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT > 1:12063591/1‑101 TTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA < 1:9365582/101‑1 TGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT < 1:10434299/101‑1 TGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT < 1:8202878/101‑1 GACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG < 1:1525225/101‑1 GTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGTTGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG > 1:111294/1‑101 GTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG > 1:4209027/1‑101 TGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCTGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT < 1:11651604/101‑1 TGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT > 1:949963/1‑101 AATTCCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAATAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT < 1:12037693/101‑1 AATACCGCTTCTGTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT > 1:2822273/1‑101 ACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT < 1:13503117/101‑1 CGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG < 1:9379938/101‑1 CGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG > 1:3035043/1‑101 CGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG > 1:1582356/1‑101 CGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG < 1:3292877/101‑1 CGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGCAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTTTGATGGTGTTTTTG < 1:8257919/101‑1 GCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA < 1:7652031/101‑1 GCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA > 1:14923202/1‑101 TTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG > 1:8039457/1‑101 CTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 1:724952/101‑1 CTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:9392471/1‑101 CTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:3627063/1‑101 TGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTC > 1:1743059/1‑101 TGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTC > 1:9224918/1‑101 GCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC < 1:455330/101‑1 GCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC < 1:7981455/101‑1 CCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA < 1:2431768/101‑1 CGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAG > 1:862504/1‑101 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TGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA < 1:10212267/101‑1 TGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA > 1:7677776/1‑101 TGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA < 1:944938/101‑1 TGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA > 1:5412383/1‑101 GCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT < 1:8839199/101‑1 CCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATC < 1:10041039/101‑1 CTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA < 1:11495140/101‑1 TCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG > 1:10829215/1‑101 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TTTTCAGTAAAGAAGTCCTGAGTAAACACGTTGACGTTGAATACCGCTTCTCTGCCGAGCCTTATATTGGTGCCTCATGCAGTAATGTGTCAGTTTTATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/1909295‑1909196 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC < NC_007779/2412225‑2412126 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |