New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 4310363 = | NA (NA) | 259 (0.900) | 119/180 | NT | 99.6% | intergenic (‑287/‑68) | yjcS/insH | alkyl sulfatase/IS5 element protein |
? | NC_007779 | 4353540 = | 1 (0.000) | intergenic (‑118/+453) | dcuB/dcuR | C4‑dicarboxylate antiporter/DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with DcuS |
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/4310446‑4310363 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATG > NC_007779/4353540‑4353639 TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACA < 1:7560742/101‑1 TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACA > 1:6831838/1‑101 TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACA > 1:4417519/1‑101 TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACA > 1:13893054/1‑101 TAAGTTGATGACTCATGATCAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACA < 1:9663924/101‑1 AAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAG > 1:8658080/1‑101 AAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAG < 1:8080750/101‑1 GTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTG < 1:10111272/101‑1 TTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGA > 1:10575043/1‑101 GATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAAT < 1:7099889/101‑1 ATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATA < 1:2597470/101‑1 ATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATA < 1:2041186/101‑1 TGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATAT > 1:1633790/1‑101 GACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATT < 1:252585/101‑1 ACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTG > 1:12321141/1‑101 CTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGG > 1:2962201/1‑101 TCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTCCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGC < 1:11824176/101‑1 CATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCT < 1:8226006/101‑1 CATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCT > 1:4322519/1‑101 CATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCT < 1:14154332/101‑1 ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTG > 1:8301966/1‑101 TGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGA > 1:6465886/1‑101 TGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGA > 1:9528233/1‑101 GATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGAT > 1:12886206/1‑101 ATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATT < 1:3341710/101‑1 TGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTA < 1:12773061/101‑1 AACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAA < 1:4512465/101‑1 CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGC > 1:6931752/1‑101 CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGC < 1:7459873/101‑1 CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATATCATATCAGGGACTTGTTCGCACATTCCTTAGCAAATAACTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGa > 1:5488308/1‑100 CTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCATCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAG < 1:1164185/101‑1 CTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAG < 1:14053694/101‑1 CTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAG < 1:12185118/101‑1 TGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGC > 1:12530982/1‑101 TGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGC > 1:12466591/1‑101 GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCG > 1:3382243/1‑101 TTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGG > 1:11242177/1‑101 TCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGC < 1:5099596/101‑1 TCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGC > 1:13496580/1‑101 TCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGC > 1:1343045/1‑101 CTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCA > 1:4839995/1‑101 CTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCA > 1:1924190/1‑101 TATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAA > 1:3288952/1‑101 TATGGCTCAAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAA > 1:6595478/1‑101 ATGGCTCCAGATGGCAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAA < 1:13205226/101‑1 ATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAA < 1:7214764/101‑1 ATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAA < 1:8799487/101‑1 GCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTT > 1:4737681/1‑101 GCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTT > 1:14780188/1‑101 GCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATAACTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTT > 1:11011386/1‑101 CTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTA > 1:3795200/1‑101 TCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTTCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTAT > 1:14285527/1‑101 CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATG > 1:11428495/1‑101 CAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGC < 1:2299900/101‑1 AGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCA > 1:2202374/1‑101 AGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCA > 1:8533156/1‑101 ATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACT > 1:11741673/1‑101 TGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTG > 1:14845856/1‑101 ATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGC < 1:4079129/101‑1 ATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGC < 1:14416664/101‑1 TCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCT > 1:3528902/1‑101 CTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTT < 1:12012911/101‑1 CTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTACCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTT < 1:10278817/101‑1 TCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTT > 1:13864188/1‑101 CATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTT > 1:7352599/1‑101 ATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTT > 1:10710905/1‑101 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCA < 1:6263948/101‑1 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCA < 1:604194/101‑1 ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCA > 1:11937367/1‑101 TCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAG > 1:5299184/1‑101 TCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAG > 1:7823967/1‑101 CAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGA < 1:9240867/101‑1 CAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGA > 1:10041761/1‑101 AGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAG < 1:14016180/101‑1 AGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAG > 1:4993248/1‑101 GACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGA > 1:6177270/1‑101 ACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAA > 1:5597679/1‑101 ACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAA < 1:3086513/101‑1 TTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAG > 1:12804014/1‑101 TTGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAG < 1:1459646/101‑1 TGTTCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGA < 1:7744850/101‑1 TCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTC > 1:6542603/1‑101 TCGCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTC < 1:2093930/101‑1 GCACCTTCCTTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTC > 1:323443/1‑101 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TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/4310446‑4310363 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAGCAAATACCTCACAGTGAATATTGGCTGATTAAAGCAGCGGCAAATTTATGCACTGTGATAAGCGGCTTTTTCAGAGAGAAAGACTCTCTGGCGATG > NC_007779/4353540‑4353639 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |