New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 1301040 | 1 (0.000) | 238 (0.900) | 130/166 | NT | 99.8% | intergenic (+218/‑90) | ychE/insC | inner membrane protein/IS2 element protein |
? | NC_007779 | 1302377 = | 0 (0.000) | intergenic (+19/‑519) | insD/oppA | IS2 element protein/oligopeptide transporter subunit |
Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
AGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATG > NC_007779/1300940‑1301139 | agttagttATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTA > 1:8079431‑M1/1‑101 (MQ=255) agttagttATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTA > 1:11609033‑M1/1‑101 (MQ=255) gttagttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAt < 1:178096‑M1/101‑2 (MQ=255) gttagttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAt < 1:10360351‑M1/101‑2 (MQ=255) gttagttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAt < 1:4264544‑M1/101‑2 (MQ=255) gttagttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAt < 1:7113597‑M1/101‑2 (MQ=255) gttagttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAt < 1:2450878‑M1/101‑2 (MQ=255) ttagttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAtt < 1:6700936‑M1/101‑3 (MQ=255) ttagttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAtt > 1:8608411‑M1/1‑99 (MQ=255) tagttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAtta < 1:10533041‑M1/101‑4 (MQ=255) gttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaat < 1:563632‑M1/101‑6 (MQ=255) ttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaatt < 1:8674080‑M1/101‑7 (MQ=255) ttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaatt < 1:5582620‑M1/101‑7 (MQ=255) ttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaatt > 1:6867667‑M1/1‑95 (MQ=255) ttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaatt < 1:12351111‑M1/101‑7 (MQ=255) ttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaatt < 1:10747895‑M1/101‑7 (MQ=255) tataAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAAAAATTGAAATGATATTAttaattc < 1:8310740‑M1/101‑8 (MQ=255) aatgattTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccac < 1:4851371‑M1/98‑11 (MQ=255) aaGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccac > 1:1014309‑M1/1‑91 (MQ=255) aaGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccac > 1:11968336‑M1/1‑91 (MQ=255) aGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccact < 1:14418794‑M1/101‑12 (MQ=255) aGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccact < 1:8405182‑M1/101‑12 (MQ=255) agaTTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactg > 1:2040198‑M1/2‑89 (MQ=255) gATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgc > 1:14203417‑M1/1‑88 (MQ=255) aTTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcc > 1:1582146‑M1/1‑87 (MQ=255) tCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgccttt > 1:7646023‑M1/1‑84 (MQ=255) tCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgccttt < 1:1156296‑M1/101‑18 (MQ=255) tCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgccttt > 1:847685‑M1/1‑84 (MQ=255) ccTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAtaaattccactgcctttg < 1:14700440‑M1/101‑19 (MQ=255) aaCTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtag < 1:4110433‑M1/101‑23 (MQ=255) aCTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtaga < 1:13808848‑M1/101‑24 (MQ=255) aCTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtaga > 1:9666696‑M1/1‑78 (MQ=255) aCTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtaga < 1:10687646‑M1/101‑24 (MQ=255) aCTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtaga < 1:14957033‑M1/101‑24 (MQ=255) tGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagagg > 1:5326783‑M1/1‑76 (MQ=255) gCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagagga < 1:3275156‑M1/101‑27 (MQ=255) ttCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaa < 1:7345836‑M1/101‑29 (MQ=255) ttCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaa < 1:7853121‑M1/101‑29 (MQ=255) ttCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaa > 1:10910166‑M1/1‑73 (MQ=255) ttCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaa > 1:14529880‑M1/1‑73 (MQ=255) ttCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaa < 1:10672492‑M1/101‑29 (MQ=255) ctcctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagt < 1:5146097‑M1/101‑31 (MQ=255) ctcctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagt > 1:3479445‑M1/1‑71 (MQ=255) ctcctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagt > 1:9781675‑M1/1‑71 (MQ=255) tcctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtg < 1:6816270‑M1/101‑32 (MQ=255) tcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgcta < 1:5508038‑M1/101‑35 (MQ=255) tcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgcta > 1:13335962‑M1/1‑67 (MQ=255) aCCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa < 1:291244‑M1/101‑37 (MQ=255) ccATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat > 1:6310477‑M1/1‑64 (MQ=255) catcatGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata < 1:600417‑M1/101‑39 (MQ=255) catcatGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata < 1:4401632‑M1/101‑39 (MQ=255) catcatGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata > 1:8259680‑M1/1‑63 (MQ=255) atcatGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa < 1:11262830‑M1/101‑40 (MQ=255) tcatGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataat < 1:9828474‑M1/101‑41 (MQ=255) tcatGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataat > 1:12211809‑M1/1‑61 (MQ=255) atGTTATTTTCGCCACATCATACTCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATCTTAttaattcctctgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa < 1:4166105‑M1/101‑43 (MQ=255) tGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataat < 1:9141514‑M1/101‑44 (MQ=255) tGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataat > 1:14211755‑M1/1‑58 (MQ=255) ttATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatca > 1:948898‑M1/1‑56 (MQ=255) ttATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatca > 1:13180964‑M1/1‑56 (MQ=255) aTTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattcccctgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaat < 1:12286323‑M1/101‑48 (MQ=255) tttCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattg < 1:12768160‑M1/101‑50 (MQ=255) ttCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgt > 1:10078008‑M1/1‑51 (MQ=255) tCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgtt > 1:2331374‑M1/1‑50 (MQ=255) cGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgtta > 1:7011904‑M1/1‑49 (MQ=255) gCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaa < 1:591669‑M1/101‑54 (MQ=255) cacaTCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaat < 1:10791251‑M1/101‑56 (MQ=255) atcatAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattat < 1:1190450‑M1/101‑59 (MQ=255) catAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattg < 1:8823694‑M1/101‑61 (MQ=255) tAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtg > 1:12081435‑M1/1‑39 (MQ=255) aaTCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgc < 1:4975432‑M1/101‑64 (MQ=255) tCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcat < 1:220280‑M1/101‑66 (MQ=255) gggCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttca < 1:1040872‑M1/101‑70 (MQ=255) gggCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttca > 1:13614482‑M1/1‑32 (MQ=255) tGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactact > 1:2138540‑M1/1‑27 (MQ=255) gCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactg > 1:5612325‑M1/1‑26 (MQ=255) cTGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactgg < 1:12658305‑M1/101‑77 (MQ=255) tGAAGAATAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactgga > 1:11387656‑M1/1‑24 (MQ=255) gaagaaTAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaa > 1:7500355‑M1/1‑23 (MQ=255) gaagaaTAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaa < 1:2669435‑M1/101‑79 (MQ=255) aagaaTAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaac < 1:4806268‑M1/101‑80 (MQ=255) aagaaTAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaac > 1:12601554‑M1/1‑22 (MQ=255) agaaTAATTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaact > 1:13462949‑M1/1‑21 (MQ=255) aataatTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgt < 1:1879375‑M1/101‑83 (MQ=255) aataagTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgt < 1:9430160‑M1/101‑83 (MQ=255) aatTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaat > 1:14042875‑M1/1‑16 (MQ=255) aatTGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaat < 1:842999‑M1/101‑86 (MQ=255) tGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcag < 1:5564928‑M1/101‑89 (MQ=255) tGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcag > 1:11836664‑M1/1‑13 (MQ=255) tGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcag < 1:4625922‑M1/101‑89 (MQ=255) tGAAATGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcag > 1:9014224‑M1/1‑13 (MQ=255) aaaTGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaa > 1:3664802‑M1/1‑11 (MQ=255) aaTGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaa > 1:7554941‑M1/1‑10 (MQ=255) aaTGATATTAttaattccactgccttcggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaa < 1:12956709‑M1/101‑92 (MQ=255) aTGATATTAttaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaa < 1:11014054‑M1/101‑93 (MQ=255) aatatTTGACCGGCCCCCCGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAgatgat < 1:12637422/100‑1 (MQ=2) tattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagata > 1:7689760‑M1/1‑5 (MQ=255) tattattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagata > 1:3925763‑M1/1‑5 (MQ=255) ttattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagataga > 1:11691247‑M1/1‑3 (MQ=255) tattaattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagac > 1:11328941‑M1/1‑2 (MQ=255) | AGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTAGACTGGCCCCCTGAATCTCCAGACAACCAATATCACTTAAATAAGTGATAGTCTTAATACTAGTTTTTAGACTAGTCATTGGAGAACAGATGATTGATG > NC_007779/1300940‑1301139 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |