New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 3987186 = | NA (NA) | 173 (0.820) | 114/178 | NT | 100% | intergenic (‑732/‑31) | slp/insH | outer membrane lipoprotein/IS5 transposase and trans‑activator |
? | NC_007779 | = 4009203 | 0 (0.000) | coding (1379/1623 nt) | yhiJ | hypothetical protein |
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
TGTTGAAAATAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGA > NC_007779/3987086‑3987278 | tGTTGAAAATAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTaagg < 1:7816992/101‑1 (MQ=255) tGTTGAAAATAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTaagg < 1:3047912/101‑1 (MQ=255) gAAAATAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTaaggaagg > 1:9194514/1‑101 (MQ=255) gAAAATAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTaaggaagg > 1:10505650/1‑101 (MQ=255) aaaaTAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAGTAGTGTCACCTAAGGAAGGt > 1:7782040/1‑101 (MQ=255) aaaaTAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGt > 1:1273543/1‑101 (MQ=255) aaaTAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTg > 1:3418863/1‑101 (MQ=255) aTAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCg > 1:4140165/1‑101 (MQ=255) tAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGa > 1:5672943/1‑101 (MQ=255) aaaCCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGaa < 1:10403229/101‑1 (MQ=255) aaaCCTTCGATTTGTGTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGaa < 1:7313539/101‑1 (MQ=255) aCCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACa > 1:6447253/1‑101 (MQ=255) aCCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACa < 1:246470/101‑1 (MQ=255) cTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAg > 1:4182372/1‑101 (MQ=255) ttCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGt > 1:4643167/1‑101 (MQ=255) tCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTc < 1:8638992/101‑1 (MQ=255) tCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTc < 1:4506929/101‑1 (MQ=255) cGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTACGGAAGGTGCGATCACGTcc > 1:6962603/1‑101 (MQ=255) cGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTcc > 1:1888021/1‑101 (MQ=255) gATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTccc > 1:4044235/1‑101 (MQ=255) aTTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCt < 1:6602449/101‑1 (MQ=255) tttgtttgTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTcccgg < 1:755043/101‑3 (MQ=255) tttgtttgTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTg > 1:8819929/1‑101 (MQ=255) tttgtttgTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTg > 1:3035726/1‑101 (MQ=255) tttgtttgTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTg > 1:10696428/1‑101 (MQ=255) ttgtttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGa < 1:3893439/101‑1 (MQ=255) ttgtttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATAGAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGa < 1:1686819/101‑1 (MQ=255) tgtttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGat < 1:6302572/101‑1 (MQ=255) gtttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGata > 1:820777/1‑101 (MQ=255) tttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGatat > 1:2201305/1‑101 (MQ=255) ttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATg > 1:7015501/1‑101 (MQ=255) tgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATga < 1:10587452/101‑1 (MQ=255) tgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATga < 1:8066925/101‑1 (MQ=255) tgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTCGGGGTAGGGTGTTCCTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATga < 1:9629374/101‑1 (MQ=255) gtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATgag > 1:6953230/1‑101 (MQ=255) gtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATgag < 1:9871554/101‑1 (MQ=255) cAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGAt > 1:10052134/1‑101 (MQ=255) cAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGAt < 1:1581535/101‑1 (MQ=255) cAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGGCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGAt > 1:5740504/1‑101 (MQ=255) aaGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATc > 1:8941478/1‑101 (MQ=255) gATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCAt < 1:4783827/101‑1 (MQ=255) gATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCAt < 1:7639139/101‑1 (MQ=255) atatTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATg < 1:6158909/101‑1 (MQ=255) atTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGtt > 1:3806306/1‑101 (MQ=255) tGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTg < 1:3375601/101‑1 (MQ=255) tGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTg < 1:6946911/101‑1 (MQ=255) tGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTg > 1:3487427/1‑101 (MQ=255) gTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAGCAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGt > 1:7395340/1‑101 (MQ=255) gTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGt < 1:1566034/101‑1 (MQ=255) ccATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑Ca < 1:823156/101‑1 (MQ=255) cATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CAt < 1:7758005/101‑1 (MQ=255) cATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CAt < 1:9044738/101‑1 (MQ=255) aTCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATc > 1:7621458/1‑101 (MQ=255) tCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCt < 1:1631777/101‑1 (MQ=255) tCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCt < 1:3995748/101‑1 (MQ=255) cTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTg < 1:4215224/101‑1 (MQ=255) tatataATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAg < 1:7091363/101‑1 (MQ=255) atataATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGc > 1:10565521/1‑101 (MQ=255) atataATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGc < 1:8965843/101‑1 (MQ=255) ataATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCa < 1:6724532/101‑1 (MQ=255) ataATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCa > 1:6408470/1‑101 (MQ=255) taATTTGGGGGGAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGACGGTGCGAACAAGTCCCTGATACGAGAT‑AAGTTTGTCCATCTGGCGCAAt > 1:355900/1‑101 (MQ=25) aaTTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATa < 1:7395194/101‑1 (MQ=255) aaTTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATa > 1:9364606/1‑101 (MQ=255) tGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAAc > 1:5944305/1‑101 (MQ=255) tGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAAc > 1:3188505/1‑101 (MQ=255) gggggTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGTGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACa > 1:5266905/1‑101 (MQ=255) gggggTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACa > 1:2196588/1‑101 (MQ=255) gggggTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACa < 1:10289293/101‑1 (MQ=255) ggggTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAg < 1:6930499/101‑1 (MQ=255) gggTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAgg > 1:7013137/1‑101 (MQ=255) gggTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAgg < 1:2690177/101‑1 (MQ=255) gggTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAgg > 1:8574527/1‑101 (MQ=255) gTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGt < 1:2941464/101‑1 (MQ=255) gTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGt > 1:770688/1‑101 (MQ=255) tAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGtt > 1:3579682/1‑101 (MQ=255) aGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTtc > 1:4079238/1‑101 (MQ=255) gggTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTtca < 1:9850534/101‑1 (MQ=255) ggTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTtcat > 1:468704/1‑101 (MQ=255) ggTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTtcat < 1:1140711/101‑1 (MQ=255) tgtTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTtcatca > 1:3097325/1‑101 (MQ=255) tgtTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTtcatca > 1:9237578/1‑101 (MQ=255) gtTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTcatcat > 1:3455712/1‑101 (MQ=255) cTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAg > 1:5646078/1‑101 (MQ=255) cTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAg < 1:5040418/101‑1 (MQ=255) tttATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGt > 1:1824095/1‑101 (MQ=255) ttATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGtc > 1:2279564/1‑101 (MQ=255) aTGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGtcat > 1:10023101/1‑101 (MQ=255) gTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGtcatca < 1:4595360/101‑1 (MQ=255) aaaaaTAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACtt > 1:1473031/1‑101 (MQ=40) aTAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCt < 1:664770/101‑1 (MQ=37) tAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCtt < 1:5433364/101‑1 (MQ=35) aGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTc > 1:5700678/1‑101 (MQ=34) aGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTc < 1:2020685/101‑1 (MQ=34) aGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCCTc < 1:8319703/101‑1 (MQ=21) gtgtCACCTCAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCg < 1:9796318/101‑1 (MQ=18) tgtCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGc > 1:7952915/1‑101 (MQ=32) gtCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGcc > 1:1411278/1‑101 (MQ=32) gtCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGcc > 1:3133023/1‑101 (MQ=32) gtCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGcc > 1:10398668/1‑101 (MQ=32) | TGTTGAAAATAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGT‑CATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGA > NC_007779/3987086‑3987278 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |