Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 1,844,073 | G→A | 100% | intergenic (‑224/‑12) | ynjH ← / → gdhA | hypothetical protein/glutamate dehydrogenase, NADP‑specific |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 1,844,073 | 0 | G→A | 100.0% | 852.3 | 212 | intergenic (‑224/‑12) | ynjH/gdhA | hypothetical protein/glutamate dehydrogenase, NADP‑specific |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (107/105): ref base (0/0): total (107/105) |
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
TTTTTTTCTTGCTTACCGTCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGGGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGAGTTCGCGCAAGCCGTTCG > NC_007779/1843975‑1844170 | ttttttCTTGCTTACCGTCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATGTAAGAGtt > 1:10140108/1‑101 (MQ=255) tttttCTTGCTTACCGTCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGttt > 1:2006755/1‑101 (MQ=255) tttCTTGCTTACCGTCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTta < 1:7356774/101‑1 (MQ=255) cTTGCTTACCGTCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTatat > 1:5763982/1‑101 (MQ=255) ttGCTTACCGTCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATc > 1:8777021/1‑101 (MQ=255) ttGCTTACCGTCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATc < 1:1123439/101‑1 (MQ=255) tGCTTACCGTCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCt < 1:10468722/101‑1 (MQ=255) gCTTACCGTCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTa > 1:5082064/1‑101 (MQ=255) ttACCGTCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATg < 1:2397819/101‑1 (MQ=255) ttACCGTCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATg < 1:10026135/101‑1 (MQ=255) ccGTCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGAt > 1:1224788/1‑101 (MQ=255) ccGTCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGAt < 1:2349686/101‑1 (MQ=255) cGTCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATc > 1:4940176/1‑101 (MQ=255) cGTCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATc > 1:2759895/1‑101 (MQ=255) gTCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCa < 1:6642899/101‑1 (MQ=255) gTCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCa < 1:8198184/101‑1 (MQ=255) gTCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCa < 1:5537758/101‑1 (MQ=255) tCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAg < 1:3025672/101‑1 (MQ=255) tCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAg < 1:2798477/101‑1 (MQ=255) tCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAg < 1:2687518/101‑1 (MQ=255) cacaTTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGa > 1:2510716/1‑101 (MQ=255) acaTTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGAc < 1:3299241/101‑1 (MQ=255) caTTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACa < 1:2252142/101‑1 (MQ=255) caTTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACa > 1:7630869/1‑101 (MQ=255) caTTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACa > 1:4135549/1‑101 (MQ=255) caTTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAACACAATCGTATTAAGATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACa > 1:7731334/1‑101 (MQ=255) aTTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACat > 1:2309546/1‑101 (MQ=255) aTTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACat > 1:6356383/1‑101 (MQ=255) aTTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACat > 1:6746999/1‑101 (MQ=255) aTTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACat < 1:9267714/101‑1 (MQ=255) ttCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACata < 1:2107453/101‑1 (MQ=255) ttCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACata < 1:4953287/101‑1 (MQ=255) cTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATAtt < 1:5857144/101‑1 (MQ=255) cTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATAtt > 1:5950088/1‑101 (MQ=255) ttGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATtc > 1:2961967/1‑101 (MQ=255) tGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATtct < 1:7146043/101‑1 (MQ=255) tGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATtct < 1:1545845/101‑1 (MQ=255) tGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATtct > 1:3200134/1‑101 (MQ=255) gATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATtctc > 1:1317996/1‑101 (MQ=255) gATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATtctc < 1:10410542/101‑1 (MQ=255) ggTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTgg < 1:7849673/101‑1 (MQ=255) ataGTTCAAAACTTCAAAATCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGt < 1:679305/101‑1 (MQ=255) taGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTc < 1:3508650/101‑1 (MQ=255) gTCGAAAACCGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCAt < 1:5386400/101‑1 (MQ=255) tCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCAtt > 1:3898310/1‑101 (MQ=255) gAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTcc < 1:3215665/101‑1 (MQ=255) gAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTcc > 1:8947641/1‑101 (MQ=255) aaaCTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTc < 1:9113211/101‑1 (MQ=255) aaaCTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTc < 1:9587942/101‑1 (MQ=255) aaCTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCa < 1:4521232/101‑1 (MQ=255) aaCTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCa < 1:5987877/101‑1 (MQ=255) aaCTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCACTGGAGTCATTCCTCa > 1:406637/1‑101 (MQ=255) aCTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCaa < 1:8913647/101‑1 (MQ=255) gCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCa > 1:161819/1‑101 (MQ=255) aaaaGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATg > 1:4656918/1‑101 (MQ=255) aaGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTc > 1:4865319/1‑101 (MQ=255) acaTGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCaaa < 1:9534218/101‑1 (MQ=255) aTGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAg < 1:10254686/101‑1 (MQ=255) aTGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAg > 1:578868/1‑101 (MQ=255) tGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAgc < 1:9427954/101‑1 (MQ=255) tGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAgc < 1:3178129/101‑1 (MQ=255) tGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAgc > 1:9618665/1‑101 (MQ=255) tGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAgc < 1:1671567/101‑1 (MQ=255) gACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAgcg > 1:7671846/1‑101 (MQ=255) aCATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAgcgc < 1:1372738/101‑1 (MQ=255) aCATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAgcgc > 1:7540610/1‑101 (MQ=255) aTAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGa > 1:5222296/1‑101 (MQ=255) tAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGAc > 1:1898720/1‑101 (MQ=255) aaaCAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGAcc > 1:10770258/1‑101 (MQ=255) acaacaTAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCg > 1:862479/1‑101 (MQ=255) acaacaTAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGCCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCg > 1:615347/1‑101 (MQ=255) caacaTAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGa > 1:7509560/1‑101 (MQ=255) aaacaTAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGa < 1:3992743/100‑1 (MQ=255) acaTAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAAt < 1:3245742/101‑1 (MQ=255) cttAAGCAAAATGGTA‑TAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCa < 1:4261498/99‑1 (MQ=255) aTAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCa > 1:10201835/1‑101 (MQ=255) tAAGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCaa < 1:5483496/101‑1 (MQ=255) aGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAAc > 1:6476750/1‑101 (MQ=255) aGCACAATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAAc < 1:5895310/101‑1 (MQ=255) cacaATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCg > 1:8441666/1‑101 (MQ=255) cacaATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCg > 1:5549953/1‑101 (MQ=255) acaATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGa > 1:3728025/1‑101 (MQ=255) caATCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGAg > 1:2355117/1‑101 (MQ=255) aaTCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGAGt < 1:10651305/101‑1 (MQ=255) aTCGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGAGtt < 1:982502/101‑1 (MQ=255) cGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGAGTTcg > 1:1777560/1‑101 (MQ=255) cGTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGAGTTcg < 1:8080187/101‑1 (MQ=255) gTATTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGAGTTcgc < 1:8731021/101‑1 (MQ=255) aTTAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGAGTTCgcgc < 1:6039896/101‑1 (MQ=255) tAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGAGTTCGCGCaa > 1:8988168/1‑101 (MQ=255) tAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGAGTTCGCGCaa > 1:4350175/1‑101 (MQ=255) tAATATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGAGTTCGCGCaa < 1:7029998/101‑1 (MQ=255) aaTATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGAGTTCGCGCAAg > 1:8287879/1‑101 (MQ=255) aaTATATAAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGAGTTCGCGCAAg > 1:6221023/1‑101 (MQ=255) tatataAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGAGTTCGCGCAAGcc > 1:6093667/1‑101 (MQ=255) tatataAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGAGTTCGCGCAAGcc < 1:6519708/101‑1 (MQ=255) atataAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGAGTTCGCGCAAGCCg > 1:2496353/1‑101 (MQ=255) atataAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGAGTTCGCGCAAGCCg < 1:6258864/101‑1 (MQ=255) tataAGATTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGAGTTCGCGCAAGCCGt < 1:5306644/101‑1 (MQ=255) taAGAGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGAGTTCGCGCAAGCCGTTc > 1:10364427/1‑101 (MQ=255) | TTTTTTTCTTGCTTACCGTCACATTCTTGATGGTATAGTCGAAAACTGCAAAAGCACATGACATAAACAACATAAGCACAATCGTATTAATATATAAGGGTTTTATATCTATGGATCAGACATATTCTCTGGAGTCATTCCTCAACCATGTCCAAAAGCGCGACCCGAATCAAACCGAGTTCGCGCAAGCCGTTCG > NC_007779/1843975‑1844170 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |