| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_007779 | 274,733 | Δ97,240 bp | 100% | [mmuP]–[mhpD] | 90 genes [mmuP], mmuM, afuC, afuB, insB, insA, ykgN, yagB, yagA, yagE, yagF, yagG, yagH, yagI, argF, insB, insA, yagJ, yagK, yagL, yagM, yagN, intF, yagP, yagQ, yagR, yagS, yagT, yagU, ykgJ, yagV, yagW, yagX, yagY, yagZ, ykgK, ykgL, Y75_p4288, Y75_p4289, eaeH, insE, insF, ykgA, ykgB, ykgI, ykgC, ykgD, ykgE, ykgF, ykgG, ykgH, betA, betB, betI, betT, yahA, yahB, yahC, yahD, yahE, yahF, yahG, yahH, yahI, yahJ, yahK, yahL, yahM, yahN, yahO, prpR, prpB, prpC, prpD, prpE, codB, codA, cynR, cynT, cynS, cynX, lacA, lacY, lacZ, lacI, mhpR, mhpA, mhpB, mhpC, [mhpD] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_007779 | 274733 | 371972 | 97240 | 330 [0] | [0] 331 | [mmuP]–[mhpD] | 90 genes [mmuP], mmuM, afuC, afuB, insB, insA, ykgN, yagB, yagA, yagE, yagF, yagG, yagH, yagI, argF, insB, insA, yagJ, yagK, yagL, yagM, yagN, intF, yagP, yagQ, yagR, yagS, yagT, yagU, ykgJ, yagV, yagW, yagX, yagY, yagZ, ykgK, ykgL, Y75_p4288, Y75_p4289, eaeH, insE, insF, ykgA, ykgB, ykgI, ykgC, ykgD, ykgE, ykgF, ykgG, ykgH, betA, betB, betI, betT, yahA, yahB, yahC, yahD, yahE, yahF, yahG, yahH, yahI, yahJ, yahK, yahL, yahM, yahN, yahO, prpR, prpB, prpC, prpD, prpE, codB, codA, cynR, cynT, cynS, cynX, lacA, lacY, lacZ, lacI, mhpR, mhpA, mhpB, mhpC, [mhpD] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 274732 | 0 (0.000) | 263 (0.980) | 128/160 | NT | 100% | coding (184/1404 nt) | mmuP | S‑methylmethionine transporter |
| ? | NC_007779 | 371973 = | 0 (0.000) | coding (635/810 nt) | mhpD | 2‑keto‑4‑pentenoate hydratase | |||||
Only 100 of 331 total aligned reads displayed.
AAAAACTGCGCCATGAAGATGACGCGTAATAACGAAGAGGTTTCTAGCGGGCGCGGCAGCGAATGCCTGGGACATCCGCTTAATGCGGCCGTCTGGCTGGCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGTTTT > NC_007779/371873‑372073 | ggcacaggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggc < 1:9728003‑M2/1‑1 (MQ=255) cacaggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCAc > 1:11981178‑M2/99‑101 (MQ=255) cacaggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCAc < 1:2184160‑M2/3‑1 (MQ=255) acaggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACg < 1:8696260‑M2/4‑1 (MQ=255) acaggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggggggctggctggCACg > 1:14357204‑M2/98‑101 (MQ=255) ggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCaa > 1:8023278‑M2/95‑101 (MQ=255) gattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCCCGCaaa > 1:3842708‑M2/94‑101 (MQ=255) gattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCaaa < 1:3720000‑M2/8‑1 (MQ=255) agtattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCaaaa > 1:15129304‑M2/93‑101 (MQ=255) ttcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGc < 1:7536140‑M2/13‑1 (MQ=255) ttcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGc < 1:8126473‑M2/13‑1 (MQ=255) tcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCCCGCAAAATGGcc > 1:4289176‑M2/88‑101 (MQ=255) tcttcaataccgggtacatcatttccaccacgggagcggcgggaacgctgctggcctagctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGcc < 1:4833765‑M2/14‑1 (MQ=255) cttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggcttgCACGCAAAATGGCCa > 1:11466652‑M2/87‑101 (MQ=255) ttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaaccctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATggcccg > 1:13543374‑M2/86‑99 (MQ=255) tcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGt > 1:13325987‑M2/85‑101 (MQ=255) aataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCCCGCAAAATGGCCCGTCt > 1:1649975‑M2/83‑101 (MQ=255) aataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCt < 1:8563318‑M2/19‑1 (MQ=255) aataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCt < 1:13976249‑M2/19‑1 (MQ=255) taccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaaagctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTgg > 1:2703388‑M2/81‑101 (MQ=255) accgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTggg < 1:9681223‑M2/22‑1 (MQ=255) ccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGt > 1:1947463‑M2/79‑101 (MQ=255) cgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTg < 1:6657177‑M2/24‑1 (MQ=255) ggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCCAAATGGCCAGTCTGGGTGaa > 1:349586‑M2/76‑101 (MQ=255) tacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAAcc < 1:8418549‑M2/28‑1 (MQ=255) acatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgcttgcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATAGCCAGTCTGGGTGAACCg > 1:6598934‑M2/73‑101 (MQ=255) acatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGGGAACCg > 1:6284688‑M2/73‑101 (MQ=255) acatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctgggggtctggttggCCCGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCg > 1:5443843‑M2/73‑101 (MQ=255) acatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatcagattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCg < 1:14767388‑M2/29‑1 (MQ=255) catcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggGACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAAACGc > 1:6972596‑M2/72‑101 (MQ=255) catcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGGGAAACGc > 1:1215662‑M2/72‑101 (MQ=255) catcacttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAAACGc > 1:6214925‑M2/72‑101 (MQ=255) atcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCt > 1:12943249‑M2/71‑101 (MQ=255) tcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTg < 1:880328‑M2/32‑1 (MQ=255) atttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggTACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTgcg > 1:10759840‑M2/68‑101 (MQ=255) atttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTgcg > 1:5812128‑M2/68‑101 (MQ=255) atttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTgcg < 1:7717095‑M2/34‑1 (MQ=255) atttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGGGAACCGCTgcg > 1:10178843‑M2/68‑101 (MQ=255) ttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCa > 1:15293932‑M2/66‑101 (MQ=255) ccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCAcc < 1:8257550‑M2/38‑1 (MQ=255) ccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGga < 1:3625254‑M2/41‑1 (MQ=255) ccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGga < 1:3416511‑M2/41‑1 (MQ=255) cactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGgag < 1:3034283‑M2/42‑1 (MQ=255) tggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGata < 1:11150129‑M2/45‑1 (MQ=255) ggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGatat < 1:11221775‑M2/46‑1 (MQ=255) ggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGatat < 1:11695169‑M2/46‑1 (MQ=255) ggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGatat < 1:11839533‑M2/46‑1 (MQ=255) agcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCa < 1:13116222‑M2/48‑1 (MQ=255) 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gattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGAtgg > 1:12454148‑M2/27‑101 (MQ=255) ttggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGAtggtg < 1:6013751‑M2/77‑1 (MQ=255) ggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGc < 1:8395678‑M2/79‑1 (MQ=255) gtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCg < 1:15101002‑M2/80‑1 (MQ=255) tggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAAt < 1:7818607‑M2/86‑1 (MQ=255) gtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCCCCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGc > 1:4568579‑M2/14‑101 (MQ=255) tggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCg < 1:10952667‑M2/89‑1 (MQ=255) ggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCgg > 1:5358306‑M2/12‑101 (MQ=255) ggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCgg > 1:13771752‑M2/12‑101 (MQ=255) gtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCggg > 1:8381065‑M2/11‑101 (MQ=255) gtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCggg > 1:916840‑M2/11‑101 (MQ=255) tctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACTGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGc < 1:10327144‑M2/92‑1 (MQ=255) gctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATc < 1:7870825‑M2/96‑1 (MQ=255) gctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATc < 1:2781771‑M2/96‑1 (MQ=255) gctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATc < 1:14545661‑M2/96‑1 (MQ=255) tggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGt > 1:6721959‑M2/4‑101 (MQ=255) tggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGt > 1:7362876‑M2/4‑101 (MQ=255) ggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGtt < 1:13253152‑M2/99‑1 (MQ=255) gCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGttt < 1:1105009‑M2/100‑1 (MQ=255) gCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGttt < 1:1046561‑M2/100‑1 (MQ=255) cACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGtttt > 1:3328851/1‑101 (MQ=255) cACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGtttt < 1:924489/101‑1 (MQ=255) cACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGtttt > 1:10237837/1‑101 (MQ=255) cACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCACACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGtttt < 1:2016666/101‑1 (MQ=255) | AAAAACTGCGCCATGAAGATGACGCGTAATAACGAAGAGGTTTCTAGCGGGCGCGGCAGCGAATGCCTGGGACATCCGCTTAATGCGGCCGTCTGGCTGGCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGTTTT > NC_007779/371873‑372073 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |