New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 1907280 = | 12 (0.040) | 246 (0.820) | 121/180 | NT | 95.3% | intergenic (+307/‑122) | yobD/yebN | inner membrane protein/inner membrane protein |
? | NC_007779 | = 2412225 | NA (NA) | intergenic (‑55/‑782) | insA/yfbQ | IS1 element protein/aminotransferase |
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
CCATAAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/1907379‑1907280 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT < NC_007779/2412225‑2412129 CCATAAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGG < 1:10458461/101‑1 ATAAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGT > 1:8347495/1‑101 ATAAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGT < 1:722556/101‑1 TAAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTG < 1:7961543/101‑1 TAAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTG > 1:5455099/1‑101 AAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGA < 1:4937853/101‑1 AACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATG > 1:6568422/1‑101 ACACATCATCGCCCCCAGCAAACATTCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGC < 1:13439400/101‑1 ACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGC > 1:15208671/1‑101 CATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGC > 1:12364893/1‑101 ATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCC > 1:5571359/1‑101 ATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCC < 1:58752/101‑1 ATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCC < 1:1556606/101‑1 CATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAA > 1:8871889/1‑101 ATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAAC < 1:12655500/101‑1 TCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACT < 1:259457/101‑1 TCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACT < 1:277679/101‑1 TCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACT < 1:12252923/101‑1 CGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTT < 1:14820867/101‑1 CGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTT < 1:13740060/101‑1 GCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTA > 1:4812/1‑101 GCCCCCAGCAAACATGAATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTA < 1:13271359/101‑1 CCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTAC < 1:2944405/101‑1 CCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACT < 1:1945382/101‑1 CCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACT < 1:6531392/101‑1 CCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA > 1:12935050/1‑101 CCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA < 1:14086878/101‑1 CAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT > 1:9018998/1‑101 AGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT > 1:11546034/1‑101 AGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:10869434/101‑1 GCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 1:441632/101‑1 GCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT > 1:5192440/1‑101 GCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 1:14346561/101‑1 CAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:4717230/101‑1 CAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 1:1666344/1‑101 CAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 1:6947612/1‑101 CAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 1:9804557/1‑101 AAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 1:10311256/101‑1 AAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 1:7898121/1‑101 AAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG > 1:13012704/1‑101 ACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 1:5669283/1‑101 CATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:10026817/101‑1 CATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:3347403/101‑1 ATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA < 1:6168861/101‑1 gGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT < 1:32082/100‑1 TGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT < 1:11841192/101‑1 TGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT < 1:1211553/101‑1 GCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG > 1:4809622/1‑101 CATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 1:8265706/1‑101 CATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 1:7338774/101‑1 ATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT < 1:14947570/101‑1 ATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT > 1:2246634/1‑101 ATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT > 1:8151673/1‑101 TACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 1:10295681/101‑1 TACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG > 1:11246603/1‑101 ACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG < 1:600893/101‑1 CATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT > 1:8565559/1‑101 AACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT > 1:14276197/1‑101 AACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT > 1:5290952/1‑101 AACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 1:14620188/101‑1 AACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 1:14007303/101‑1 ACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT < 1:915599/101‑1 CAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 1:412386/101‑1 AACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG > 1:211990/1‑101 ACAAGCCGTGATTGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA < 1:6367796/101‑1 ACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA > 1:7723855/1‑101 CGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCT > 1:13313300/1‑101 GTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTC > 1:8624559/1‑101 GATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA < 1:2735535/101‑1 GATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA > 1:2523575/1‑101 GGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTG < 1:3730941/101‑1 GTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG > 1:6717894/1‑101 TTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC < 1:4660511/101‑1 CGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCT > 1:10698006/1‑101 GCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGCTTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG > 1:1253817/1‑101 GCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG < 1:13804706/101‑1 GCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG > 1:3654490/1‑101 GCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGGGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGATCCAGTGGCTTCTG > 1:11056314/1‑101 GTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT < 1:9306653/101‑1 GTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT < 1:3452027/101‑1 GTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT > 1:3131595/1‑101 TTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT > 1:9834113/1‑101 TTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT < 1:11360132/101‑1 TCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTC > 1:5861441/1‑101 CATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT > 1:3892527/1‑101 GCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATa < 1:14183431/101‑2 GCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATC > 1:13464648/1‑101 CAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA < 1:9542645/101‑1 CAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA > 1:14794192/1‑101 CAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA < 1:4207303/101‑1 AGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG > 1:3002895/1‑101 AGGCATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG < 1:13849702/101‑1 ATAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT < 1:6123980/101‑1 TAGCGATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTC > 1:10561988/1‑101 ATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC > 1:1986481/1‑101 ATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC < 1:5595352/101‑1 ATTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC > 1:7036014/1‑101 TTGATGTGCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT > 1:13941376/1‑101 actctacctgGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT > 1:8446159/11‑101 tCATATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTCCTCCAGTGGCTTCTTTGTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGC < 1:10115944/100‑1 CCATAAAACACATCATCGCCCCCAGCAAACATGCATACATGAACAACAAGCCGTGATGGTTTTCGCGTTCATGCAGGCATAGCGATTGATGTGCATATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/1907379‑1907280 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT < NC_007779/2412225‑2412129 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |