| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 1305037 | 6 (0.020) | 278 (1.200) | 129/172 | NT | 98.0% | coding (425/921 nt) | oppB | oligopeptide transporter subunit |
| ? | NC_007779 | 2519723 = | NA (NA) | intergenic (+33/‑54) | nupC/insL | nucleoside (except guanosine) transporter/transposase | |||||
Only 100 of 624 total aligned reads displayed.
GTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTAAATTCATGATA > NC_007779/1304937‑1305137 | gTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCC > 1:1431598‑M1/1‑101 (MQ=255) aaTACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCat < 1:544432‑M1/101‑3 (MQ=255) caattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAg < 1:6739234‑M2/16‑1 (MQ=255) aTACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGCCTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGCTGTTATCCCata > 1:1940373‑M1/1‑98 (MQ=255) ttgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGttt > 1:1001238‑M2/83‑101 (MQ=255) tgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtctcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGtttt < 1:313479‑M2/20‑1 (MQ=255) gtgtTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgcta < 1:1151730‑M1/101‑11 (MQ=255) ggttAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaa < 1:6629780‑M1/100‑12 (MQ=255) gtTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaac < 1:9638343‑M1/101‑13 (MQ=255) cgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTg < 1:2374342‑M2/27‑1 (MQ=255) gcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGc < 1:6230522‑M2/28‑1 (MQ=255) aggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCAcc > 1:10208463‑M2/71‑101 (MQ=255) gcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCat > 1:4277704‑M2/69‑101 (MQ=255) tcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCattat < 1:6470813‑M2/36‑1 (MQ=255) gTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtg > 1:7820512‑M1/1‑77 (MQ=255) taacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCa < 1:10804931‑M2/42‑1 (MQ=255) taacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCa < 1:9486735‑M2/42‑1 (MQ=255) gCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtatta < 1:2088866‑M1/101‑31 (MQ=255) aacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCAt < 1:4925655‑M2/43‑1 (MQ=255) ccGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattac < 1:10712996‑M1/101‑32 (MQ=255) ccGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattac > 1:7386724‑M1/1‑70 (MQ=255) cGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacg < 1:7578087‑M1/101‑33 (MQ=255) cATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcc > 1:11333906‑M1/1‑67 (MQ=255) aggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGata < 1:10572028‑M2/47‑1 (MQ=255) aTTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcct < 1:5247237‑M1/101‑36 (MQ=255) aaaacaaaacACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgat > 1:9287274‑M1/1‑63 (MQ=255) aaaacaaaacACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgat > 1:2662985‑M1/1‑63 (MQ=255) ccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGc < 1:10505755‑M2/52‑1 (MQ=255) aacaaaacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatat > 1:9133098‑M1/1‑61 (MQ=255) acaaaacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatg < 1:8714832‑M1/101‑42 (MQ=255) acaaaacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatg > 1:5631308‑M1/1‑60 (MQ=255) caaaacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatga < 1:598337‑M1/101‑43 (MQ=255) gcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCa < 1:519147‑M2/57‑1 (MQ=255) aaacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggctgtggtattacgcctgatatgatt > 1:2570524‑M1/1‑57 (MQ=255) tcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCAttt < 1:7910703‑M2/60‑1 (MQ=255) cacCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaa > 1:11743881‑M1/1‑54 (MQ=255) cacCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaa > 1:6155442‑M1/1‑54 (MQ=255) cgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCTTGATATTTGCGATCAtttt < 1:5336470‑M2/61‑1 (MQ=255) cgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCAtttt > 1:3431047‑M2/41‑101 (MQ=255) acCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaac > 1:11979036‑M1/1‑53 (MQ=255) acCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaac < 1:4217741‑M1/101‑49 (MQ=255) gcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTg < 1:3486515‑M2/62‑1 (MQ=255) gcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTg < 1:8171227‑M2/62‑1 (MQ=255) gcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTg < 1:1466890‑M2/62‑1 (MQ=255) gcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTg > 1:4763859‑M2/40‑101 (MQ=255) ccAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacg > 1:2300729‑M1/1‑52 (MQ=255) ccAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacg > 1:486816‑M1/1‑52 (MQ=255) cAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgt > 1:10942849‑M1/1‑51 (MQ=255) ttcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCAt > 1:3260821‑M2/37‑101 (MQ=255) ttcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCAt < 1:11893389‑M2/65‑1 (MQ=255) ttcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCAt < 1:9761279‑M2/65‑1 (MQ=255) aaTGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgc > 1:7469054‑M1/1‑49 (MQ=255) agatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTg > 1:4421628‑M2/31‑101 (MQ=255) cTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaa < 1:7159683‑M1/101‑60 (MQ=255) cTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaa > 1:3708588‑M1/1‑42 (MQ=255) atggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGcc < 1:7308689‑M2/73‑1 (MQ=255) tggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCg < 1:4581985‑M2/74‑1 (MQ=255) ataCCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaatt > 1:10657155‑M1/1‑40 (MQ=255) taCCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacccctgatatgatttaacgtgccgatgaatta < 1:8298676‑M1/101‑63 (MQ=255) ggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCgg < 1:201719‑M2/75‑1 (MQ=255) ttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGc < 1:3604728‑M2/77‑1 (MQ=255) gTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactct > 1:12140089‑M1/1‑35 (MQ=255) tGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctc < 1:8577240‑M1/101‑68 (MQ=255) ggggCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatggattactctcacga < 1:10335452‑M1/101‑72 (MQ=255) cttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCt < 1:8413900‑M2/84‑1 (MQ=255) cttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCt < 1:1851124‑M2/84‑1 (MQ=255) ttaagttagcgcttatGTGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTg < 1:11095345‑M2/85‑1 (MQ=255) ttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTg < 1:2948813‑M2/85‑1 (MQ=255) ttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTg > 1:281287‑M2/17‑101 (MQ=255) gggCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgat < 1:1294312‑M1/101‑73 (MQ=255) taagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATAAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTgg > 1:11234322‑M2/16‑101 (MQ=255) ttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCGGGGCGGTGGCTGGAAtg < 1:4689637‑M2/90‑1 (MQ=255) ggCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactg < 1:6811466‑M1/101‑78 (MQ=255) aaTGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtc > 1:412574‑M1/1‑21 (MQ=255) aaTGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtc < 1:5867733‑M1/101‑81 (MQ=255) aTGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtca < 1:607420‑M1/101‑82 (MQ=255) tGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcag > 1:1694208‑M1/1‑19 (MQ=255) gcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTggg > 1:11569024‑M2/7‑101 (MQ=255) gccgGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagca < 1:1541507‑M1/100‑85 (MQ=255) tatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGgcg > 1:7712241‑M2/4‑101 (MQ=255) tGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCt > 1:5553513‑M2/2‑101 (MQ=255) ggggTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaatt < 1:8820664‑M1/101‑88 (MQ=255) ggggTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaatt > 1:5754422‑M1/1‑14 (MQ=255) GGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCtt > 1:8045664‑M2/1‑101 (MQ=255) ttgttATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTaaa < 1:898625/101‑1 (MQ=255) gttATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcc > 1:3851255‑M1/1‑8 (MQ=255) ttATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTAAATTc > 1:9829319/1‑101 (MQ=255) tATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggccca > 1:3991111‑M1/1‑6 (MQ=255) tATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTAAATTCa < 1:11021583/101‑1 (MQ=255) aTCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTAAATTCAt > 1:3349823/1‑101 (MQ=255) tCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccata > 1:4506836‑M1/1‑4 (MQ=255) cccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatat < 1:5064979‑M1/101‑99 (MQ=255) cccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatat > 1:8505263‑M1/1‑3 (MQ=255) cccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatat > 1:10063384‑M1/1‑3 (MQ=255) ccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatatt > 1:7230747‑M1/1‑2 (MQ=255) ccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatatt > 1:2226641‑M1/1‑2 (MQ=255) cataagcgctaacttaagggttgttgtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattg > 1:7070692‑M1/1‑1 (MQ=255) cataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattg < 1:11422381‑M1/101‑101 (MQ=255) cataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattg < 1:5936459‑M1/101‑101 (MQ=255) cataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattg > 1:2442251‑M1/1‑1 (MQ=255) | GTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTAAATTCATGATA > NC_007779/1304937‑1305137 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |