Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 758,440 | C→A | 100% | F110L (TTC→TTA) | sdhB → | succinate dehydrogenase, FeS subunit |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 758,440 | 0 | C→A | 100.0% | 961.0 | 235 | F110L (TTC→TTA) | sdhB | succinate dehydrogenase, FeS subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (100/135): ref base (0/0): total (100/135) |
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
CCGATTTCGGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAAC > NC_007779/758342‑758537 | cGATTTCGGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATAt < 1:861134/101‑1 (MQ=255) gATTTCGGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATg > 1:5639665/1‑101 (MQ=255) aTTTCGGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATgc < 1:7284874/101‑1 (MQ=255) tttCGGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATgcg > 1:4870536/1‑101 (MQ=255) tttCGGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATgcg < 1:12223203/101‑1 (MQ=255) tttCGGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATgcg > 1:936403/1‑101 (MQ=255) ttCGGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATgcgc > 1:8379929/1‑101 (MQ=255) cGGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCaa < 1:4283076/101‑1 (MQ=255) gCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAata > 1:5546638/1‑101 (MQ=255) gCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAata < 1:11872579/101‑1 (MQ=255) gCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAata < 1:282/101‑1 (MQ=255) aCTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATg > 1:10076142/1‑101 (MQ=255) aCTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATg > 1:9239111/1‑101 (MQ=255) tCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATgag < 1:9756983/101‑1 (MQ=255) aaCCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGaa > 1:11962211/1‑101 (MQ=255) aaCCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGaa > 1:8751390/1‑101 (MQ=255) ccAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGaaaa < 1:7093877/101‑1 (MQ=255) cAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAAt < 1:3792327/101‑1 (MQ=255) cAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAAt > 1:652608/1‑101 (MQ=255) aGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAAtt < 1:8256729/101‑1 (MQ=255) ccGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGGTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTaa < 1:442888/101‑1 (MQ=255) cGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAg > 1:7896846/1‑101 (MQ=255) cGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAg > 1:9498529/1‑101 (MQ=255) cGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAg > 1:9182575/1‑101 (MQ=255) ggCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGcc < 1:9402132/101‑1 (MQ=255) gaacaagaTTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCtt < 1:6291915/97‑1 (MQ=255) cAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCtt < 1:2038060/101‑1 (MQ=255) aagaagATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTa < 1:4640990/101‑1 (MQ=255) aagaagATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTa > 1:1822496/1‑101 (MQ=255) agaTTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTg > 1:9865922/1‑101 (MQ=255) gaTTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGt < 1:1293640/101‑1 (MQ=255) gaTTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGt < 1:8949948/101‑1 (MQ=255) gaTTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGt < 1:3888373/101‑1 (MQ=255) gaTTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGt > 1:3126423/1‑101 (MQ=255) aTTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGtt < 1:5904060/101‑1 (MQ=255) tgtgATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGa < 1:40121/101‑1 (MQ=255) tgtgATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGa > 1:10610254/1‑101 (MQ=255) tgATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGaat < 1:2304955/101‑1 (MQ=255) gATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGaata > 1:11706321/1‑101 (MQ=255) aTTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGaataa > 1:7704121/1‑101 (MQ=255) aTTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGaataa > 1:346861/1‑101 (MQ=255) ttCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGaataat < 1:10008550/101‑1 (MQ=255) ttCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGaataat < 1:11329280/101‑1 (MQ=255) ttCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGaataat < 1:159062/101‑1 (MQ=255) tCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATg < 1:11129454/101‑1 (MQ=255) tCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATg < 1:5382308/101‑1 (MQ=255) cGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTGAGCCTTACCTGTTGAATAATgg < 1:11789746/101‑1 (MQ=255) cGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATgg < 1:8918599/101‑1 (MQ=255) cGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACaa > 1:7926791/1‑101 (MQ=255) cGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACaa < 1:11953060/101‑1 (MQ=255) cGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACaa < 1:3040653/101‑1 (MQ=255) gCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACaaa > 1:11610352/1‑101 (MQ=255) gCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACaaa > 1:5972151/1‑101 (MQ=255) gCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACaaa < 1:5944860/101‑1 (MQ=255) gCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATc > 1:6987808/1‑101 (MQ=255) gCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATc > 1:1992168/1‑101 (MQ=255) ccAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATcc > 1:5253274/1‑101 (MQ=255) cAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCg < 1:6042366/101‑1 (MQ=255) aGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATGATGGACAAAATCCGc > 1:11274649/1‑101 (MQ=255) ggTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGcc > 1:4796411/1‑101 (MQ=255) ggTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGcc > 1:4509916/1‑101 (MQ=255) aCCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTc > 1:4767935/1‑101 (MQ=255) aCCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTc < 1:10939112/101‑1 (MQ=255) aCCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTc < 1:561364/101‑1 (MQ=255) cGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTcgc < 1:4199847/101‑1 (MQ=255) cGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTcgc < 1:9120575/101‑1 (MQ=255) ggTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAACTTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTcgcg < 1:7589379/101‑1 (MQ=255) ggTGATCCGCGATTTAGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTcgcg < 1:6932090/101‑1 (MQ=255) tGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTAGCGAg > 1:11522141/1‑101 (MQ=255) gATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGc > 1:1167533/1‑101 (MQ=255) gATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGc < 1:10372249/101‑1 (MQ=255) aTCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCa > 1:10843333/1‑101 (MQ=255) ccGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCAtt < 1:11808453/101‑1 (MQ=255) cgcgATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCAttt > 1:3317022/1‑101 (MQ=255) gATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACa > 1:3816169/1‑101 (MQ=255) gATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACa < 1:508515/101‑1 (MQ=255) ttGGTGGTAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGAt < 1:12030167/101‑1 (MQ=255) tggtAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCa < 1:2972922/101‑1 (MQ=255) tggtAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCa < 1:7498398/101‑1 (MQ=255) tggtAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCa < 1:2131972/101‑1 (MQ=255) tggtAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCa < 1:10480549/101‑1 (MQ=255) ggtAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGcctg < 1:7292135/101‑3 (MQ=255) ggtAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCag < 1:2414291/101‑1 (MQ=255) ggtAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCag < 1:11102278/101‑1 (MQ=255) gtAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCaga > 1:1417177/1‑101 (MQ=255) gtAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAAGCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCaga < 1:1346877/101‑1 (MQ=255) gtAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAACCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCaga < 1:3208859/101‑1 (MQ=255) tAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCagag < 1:2083299/101‑1 (MQ=255) tAGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCagag > 1:8714433/1‑101 (MQ=255) aGACATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGagc > 1:10191866/1‑101 (MQ=255) aCATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGagcag < 1:11000765/101‑1 (MQ=255) cATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGagcagc > 1:6115303/1‑101 (MQ=255) cATGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGagcagc < 1:1489207/101‑1 (MQ=255) aTGGGACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAgcg > 1:6791397/1‑101 (MQ=255) ggACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGa < 1:351757/101‑1 (MQ=255) ggACAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGa > 1:2706000/1‑101 (MQ=255) aCAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaa < 1:2241681/101‑1 (MQ=255) cAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaaa < 1:810048/101‑1 (MQ=255) cAATTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGaaaa > 1:6426627/1‑101 (MQ=255) aTTATATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAAc < 1:5141275/101‑1 (MQ=255) | CCGATTTCGGCACTCAACCAGCCGGGCAAGAAGATTGTGATTCGCCCGCTGCCAGGTTTACCGGTGATCCGCGATTTGGTGGTAGACATGGGACAATTCTATGCGCAATATGAGAAAATTAAGCCTTACCTGTTGAATAATGGACAAAATCCGCCAGCTCGCGAGCATTTACAGATGCCAGAGCAGCGCGAAAAAC > NC_007779/758342‑758537 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |