| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 1,170,573 | C→T | 100% | intergenic (‑164/‑77) | ycfQ ← / → ycfR | DNA‑binding transcriptional regulator/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 1,170,573 | 0 | C→T | 100.0% | 1092.7 | 272 | intergenic (‑164/‑77) | ycfQ/ycfR | DNA‑binding transcriptional regulator/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (169/103): ref base (0/0): total (169/103) | ||||||||||
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
GTCCAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCCAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCTC > NC_007779/1170475‑1170670 | gTCCAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAg < 1:2396535/101‑1 (MQ=255) tCCAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGa < 1:3387417/101‑1 (MQ=255) ccAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGAt > 1:9478179/1‑101 (MQ=255) ccAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGAt < 1:6382813/101‑1 (MQ=255) ccAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGAt > 1:11587130/1‑101 (MQ=255) aTCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATcaca > 1:10650013/1‑101 (MQ=255) aTCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATcaca < 1:874549/101‑1 (MQ=255) tCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACAt < 1:5038332/101‑1 (MQ=255) cccATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATc > 1:4234650/1‑101 (MQ=255) cccATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATc > 1:8528041/1‑101 (MQ=255) cccATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGAGATCTAGATCACATc > 1:9070752/1‑101 (MQ=255) cATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTa > 1:162691/1‑101 (MQ=255) tAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATc < 1:3079084/101‑1 (MQ=255) tAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATc > 1:11419260/1‑101 (MQ=255) aaaaTAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCAt > 1:4083957/1‑101 (MQ=255) aaaTAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCAtt > 1:8253858/1‑101 (MQ=255) aataatTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCAttt > 1:5628452/1‑101 (MQ=255) taatTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAg > 1:1966466/1‑101 (MQ=255) taatTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAg < 1:1678398/101‑1 (MQ=255) taatTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAg < 1:11934346/101‑1 (MQ=255) aatTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGt > 1:5529217/1‑101 (MQ=255) atTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGtt < 1:6717783/101‑1 (MQ=255) atTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGtt > 1:5162579/1‑101 (MQ=255) ttGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTa < 1:8618848/101‑1 (MQ=255) ttGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTa > 1:1711565/1‑101 (MQ=255) cTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatcg > 1:2105591/1‑101 (MQ=255) tCTATTTAACTGACATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatcgatc < 1:7960834/101‑1 (MQ=255) tCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatcgatc < 1:5375938/101‑1 (MQ=255) tCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatcgatc > 1:11812034/1‑101 (MQ=255) tATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGt > 1:7102811/1‑101 (MQ=255) aTTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGtt > 1:9370705/1‑101 (MQ=255) tttAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTa > 1:10925159/1‑101 (MQ=255) ttAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTaa > 1:1253535/1‑101 (MQ=255) tAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAg > 1:8860133/1‑101 (MQ=255) aaCTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGt < 1:760265/101‑1 (MQ=255) cTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTaa > 1:5339748/1‑101 (MQ=255) gAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAtt > 1:7418955/1‑101 (MQ=255) gAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAtt > 1:11503461/1‑101 (MQ=255) aaaTTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAttg > 1:9544704/1‑101 (MQ=255) aaaTTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAttg < 1:4464025/101‑1 (MQ=255) aaTTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAttgc > 1:10621418/1‑101 (MQ=255) aTTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAttgct > 1:9300136/1‑101 (MQ=255) tttAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAttgctt < 1:12039885/101‑1 (MQ=255) tAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAttgcttgc > 1:3569942/1‑101 (MQ=255) aaaGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCg > 1:4344619/1‑101 (MQ=255) gATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACg > 1:10497611/1‑101 (MQ=255) tttttAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtc > 1:9137390/1‑101 (MQ=255) tttttAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtc > 1:3650114/1‑101 (MQ=255) tttttAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtc < 1:12119494/101‑1 (MQ=255) tttAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGCTCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtcat > 1:7183056/1‑101 (MQ=255) tttAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtcat > 1:10417878/1‑101 (MQ=255) tttAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtcat > 1:2154476/1‑101 (MQ=255) tAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtcattc > 1:2552479/1‑101 (MQ=255) aaaTTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtcattca > 1:224048/1‑101 (MQ=255) aaaTTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtcattca > 1:1558908/1‑101 (MQ=255) attaattaATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATc > 1:836908/1‑101 (MQ=255) ttaattaaTGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCt > 1:2651226/1‑101 (MQ=255) ttaattaaTGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCt < 1:9600404/101‑1 (MQ=255) ttaattaaTGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCt > 1:5970904/1‑101 (MQ=255) ttaattaaTGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCt > 1:3804998/1‑101 (MQ=255) taattaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTg > 1:676329/1‑101 (MQ=255) attaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCa < 1:11078751/101‑1 (MQ=255) ttaatGATTGTTATAACAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCAt > 1:10274822/1‑101 (MQ=255) ttaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCAt < 1:4980913/101‑1 (MQ=255) ttaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCAt < 1:4911930/101‑1 (MQ=255) ttaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCAt < 1:3621664/101‑1 (MQ=255) ttaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCAt < 1:4168986/101‑1 (MQ=255) ttaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCAt < 1:6464727/101‑1 (MQ=255) taatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATa > 1:6312992/1‑101 (MQ=255) aatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATaa > 1:453264/1‑101 (MQ=255) atGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAg > 1:11797224/1‑101 (MQ=255) atGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAg > 1:610483/1‑101 (MQ=255) tGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAgg > 1:12047365/1‑101 (MQ=255) gATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGc > 1:8045461/1‑101 (MQ=255) gATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGc > 1:4815777/1‑101 (MQ=255) gATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGc > 1:8975441/1‑101 (MQ=255) ttGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCa > 1:5636942/1‑101 (MQ=255) tGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCAc < 1:5823146/101‑1 (MQ=255) tttATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACt < 1:7777894/100‑1 (MQ=255) ataAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtatt > 1:2929174/1‑101 (MQ=255) ataAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtatt < 1:6189990/101‑1 (MQ=255) aaaaaaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtattat > 1:7295563/1‑101 (MQ=255) aaaaaaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtattat < 1:10147195/101‑1 (MQ=255) aaaaaaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtattat < 1:10010003/101‑1 (MQ=255) aaaaaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATg < 1:9651137/101‑1 (MQ=255) aaaaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGa < 1:5336889/101‑1 (MQ=255) aaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGaaa > 1:2487876/1‑101 (MQ=255) tatCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGaaaaa < 1:7351358/101‑1 (MQ=255) atCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAAc < 1:6537560/101‑1 (MQ=255) atCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAAc < 1:4720631/101‑1 (MQ=255) atCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAAc > 1:9422553/1‑101 (MQ=255) cTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGt > 1:9451511/1‑101 (MQ=255) cTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGt > 1:1422302/1‑101 (MQ=255) tATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaaa > 1:3235565/1‑101 (MQ=255) aTGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAAGGTaaaaa > 1:6453405/1‑101 (MQ=255) aTGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaaaa > 1:3538971/1‑101 (MQ=255) tgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAccc < 1:11098307/101‑1 (MQ=255) aTCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCTc > 1:694026/1‑101 (MQ=255) aTCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCTc > 1:11982911/1‑101 (MQ=255) aTCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCTc > 1:11326965/1‑101 (MQ=255) | GTCCAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCCAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCTC > NC_007779/1170475‑1170670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |