Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 274,547 | A→G | 100% | intergenic (‑206/‑2) | insH ← / → mmuP | IS5 transposase and trans‑activator/S‑methylmethionine transporter |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 274,547 | 0 | A→G | 100.0% | 1165.9 | 269 | intergenic (‑206/‑2) | insH/mmuP | IS5 transposase and trans‑activator/S‑methylmethionine transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (136/133): ref base (0/0): total (136/133) |
Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
CATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTATATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATT > NC_007779/274449‑274643 | aTCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTgtat > 1:10089750/1‑101 (MQ=255) aTCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTgtat < 1:9809148/101‑1 (MQ=255) aTCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTgtat > 1:10378395/1‑101 (MQ=255) aTCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTgtat < 1:11353289/101‑1 (MQ=255) aTCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTgtat > 1:10853723/1‑101 (MQ=255) aTCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTgtat < 1:11035092/101‑1 (MQ=255) tCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATg < 1:11784027/101‑1 (MQ=255) tCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATg > 1:9758106/1‑101 (MQ=255) cTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGc < 1:11219794/101‑1 (MQ=255) tGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCa < 1:6916025/101‑1 (MQ=255) gCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCaa < 1:2908362/101‑1 (MQ=255) gCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCaa < 1:9027017/101‑1 (MQ=255) cGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCaaa < 1:2221555/101‑1 (MQ=255) gTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAaac > 1:9695276/1‑101 (MQ=255) gTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAaac < 1:5459393/101‑1 (MQ=255) gTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAaac < 1:3899532/101‑1 (MQ=255) gTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAaac < 1:1277737/101‑1 (MQ=255) tCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAaaca > 1:6472452/1‑101 (MQ=255) tCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAaaca > 1:1168059/1‑101 (MQ=255) cTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAaacaa < 1:10031467/101‑1 (MQ=255) cTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAAAAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAaacaa > 1:10516624/1‑101 (MQ=255) gTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAacaacac > 1:8446485/1‑101 (MQ=255) gTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAacaacac < 1:6302392/101‑1 (MQ=255) gCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAacaacacaa < 1:7461937/101‑1 (MQ=255) gCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAacaacacaa > 1:4069150/1‑101 (MQ=255) aGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAAcaacacaaca > 1:613403/1‑101 (MQ=255) aGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAAcaacacaaca < 1:9923319/101‑1 (MQ=255) ggTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACaaa > 1:1350723/1‑101 (MQ=255) ttGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAAt < 1:9649766/101‑1 (MQ=255) cTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATgcgc > 1:5017167/1‑101 (MQ=255) ttGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCa < 1:799224/101‑1 (MQ=255) ttGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCa > 1:5675733/1‑101 (MQ=255) gCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACt < 1:6727778/101‑1 (MQ=255) aaTTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTg > 1:11833260/2‑101 (MQ=255) ttCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGaa < 1:1718080/101‑1 (MQ=255) tCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAg < 1:1064373/101‑1 (MQ=255) cTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAgc < 1:8870288/101‑1 (MQ=255) tGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAgcg < 1:8086554/101‑1 (MQ=255) tAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGcac > 1:9322270/1‑101 (MQ=255) tAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCAGACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGcac < 1:8159293/101‑1 (MQ=255) aaaCGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATg < 1:1160312/101‑1 (MQ=255) aaCGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGa > 1:1562729/1‑101 (MQ=255) aCGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGat < 1:12121963/101‑2 (MQ=255) cgcgGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGaaa > 1:11157741/1‑101 (MQ=255) gcgGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGaaaa > 1:11100700/1‑101 (MQ=255) cgGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAAc < 1:1857928/101‑1 (MQ=255) ggTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAAcg > 1:2930992/1‑101 (MQ=255) ggTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAAcg > 1:4704409/1‑101 (MQ=255) ggTATAACAAACCTTATTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAAcg < 1:11279006/101‑1 (MQ=255) gTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAAcgc < 1:3143375/101‑1 (MQ=255) gTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAAcgc < 1:8547388/101‑1 (MQ=255) ataACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGt > 1:8333053/1‑101 (MQ=255) aCAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACTATGAAAACGCGTCAc > 1:9087503/1‑101 (MQ=255) aCAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCAc > 1:5471841/1‑101 (MQ=255) cAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCAcc < 1:2638713/101‑1 (MQ=255) cAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCAcc > 1:4918332/1‑101 (MQ=255) cAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCAcc > 1:3557459/1‑101 (MQ=255) aaaCCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCt < 1:11704709/101‑1 (MQ=255) aaaCCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCt > 1:3229971/1‑101 (MQ=255) aaCCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTg < 1:7245337/101‑1 (MQ=255) cttcttTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGAtt > 1:11733698/1‑101 (MQ=255) cttcttTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGAtt > 1:3444272/1‑101 (MQ=255) ttcttTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTa > 1:2764498/1‑101 (MQ=255) tttGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACATCACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGc > 1:8936971/1‑101 (MQ=255) ttGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCt > 1:3051268/1‑101 (MQ=255) ttGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCt > 1:9419060/1‑101 (MQ=255) tGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCtt > 1:580036/1‑101 (MQ=255) ggATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCttt > 1:10104716/1‑101 (MQ=255) tGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCt < 1:7041864/101‑1 (MQ=255) gTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCtt > 1:457407/1‑101 (MQ=255) gTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAAAACAACAAAATGAGCCACTGAAGCACACAATGAAAACGCGTAACCTGATTATGCTGGCCtt > 1:16034/1‑101 (MQ=255) tttAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTg < 1:9118682/101‑1 (MQ=255) tttAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTg > 1:3494093/1‑101 (MQ=255) tttAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTg < 1:5381348/101‑1 (MQ=255) tttAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTg > 1:6633522/1‑101 (MQ=255) tAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTggg < 1:7806446/101‑1 (MQ=255) tAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTggg < 1:10269620/101‑1 (MQ=255) aGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGggc < 1:8464000/101‑1 (MQ=255) gATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGggcg > 1:7918742/1‑101 (MQ=255) gATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGggcg > 1:6000459/1‑101 (MQ=255) gATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGggcg < 1:12048814/101‑1 (MQ=255) gATGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAAGGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGggcg < 1:762012/101‑1 (MQ=255) aTGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGggcgg > 1:1657851/1‑101 (MQ=255) aTGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGggcgg > 1:2022787/1‑101 (MQ=255) aTGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGggcgg > 1:11515420/1‑101 (MQ=255) aTGTCCATACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGggcgg < 1:615749/101‑1 (MQ=255) tACGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGAtt > 1:4446899/1‑101 (MQ=255) aCGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTg < 1:8661251/101‑1 (MQ=255) aCGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTg > 1:7124653/1‑101 (MQ=255) cGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTgg < 1:4472395/101‑1 (MQ=255) cGTTTAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTgc > 1:8766968/1‑100 (MQ=255) tttAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGca > 1:10764943/1‑101 (MQ=255) ttAGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGcac > 1:10700224/1‑101 (MQ=255) aGAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAg > 1:8689033/1‑101 (MQ=255) gAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAgg > 1:3379670/1‑101 (MQ=255) gAAGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAgg > 1:2308699/1‑101 (MQ=255) aGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGat > 1:4225184/1‑101 (MQ=255) aGGTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGat > 1:7574551/1‑101 (MQ=255) ggTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGatt < 1:5089255/101‑1 (MQ=255) ggTTGTATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGatt < 1:9458252/101‑1 (MQ=255) | CATCTGCGTCTGGTGCAGGGTTGACTTTGCATTCTGTTAACAAACGCGGTATAACAAACCTTCTTTGGATGTTTAGATGTCCATACGTTTAGAAGGTTATATGCAAACAACACAACAAAATGCGCCACTGAAGCGCACAATGAAAACGCGTCACCTGATTATGCTTTCCTTGGGCGGCGTGATTGGCACAGGATT > NC_007779/274449‑274643 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |