| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 1,170,573 | C→T | 100% | intergenic (‑164/‑77) | ycfQ ← / → ycfR | DNA‑binding transcriptional regulator/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 1,170,573 | 0 | C→T | 100.0% | 1080.1 | 264 | intergenic (‑164/‑77) | ycfQ/ycfR | DNA‑binding transcriptional regulator/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (150/114): ref base (0/0): total (150/114) | ||||||||||
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
GTCCAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCCAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCTC > NC_007779/1170475‑1170670 | ccAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGAt < 1:11343666/101‑1 (MQ=255) cccATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATc > 1:1390323/1‑101 (MQ=255) cccATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATc < 1:5144875/101‑1 (MQ=255) cccATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATc < 1:9328767/101‑1 (MQ=255) cATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTa > 1:9414961/1‑101 (MQ=255) aaaaaTAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCa > 1:11948804/1‑101 (MQ=255) aaaaTAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCAt < 1:11878799/101‑1 (MQ=255) aaaaTAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCAt > 1:7222956/1‑101 (MQ=255) aaaTAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCAtt > 1:7378800/1‑101 (MQ=255) aataatTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCAttt > 1:3809047/1‑101 (MQ=255) aataatTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCAttt < 1:11849111/101‑1 (MQ=255) ttGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTa > 1:5802092/1‑101 (MQ=255) ttGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTa < 1:6042049/101‑1 (MQ=255) gCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatc < 1:3889064/101‑1 (MQ=255) gCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatc < 1:5200408/101‑1 (MQ=255) cTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatcg < 1:4660840/101‑1 (MQ=255) cTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTAACATTTAGTTatcg > 1:2517597/1‑101 (MQ=255) tttCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatcga > 1:7105575/1‑101 (MQ=255) tCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatcgatc < 1:8282856/101‑1 (MQ=255) tCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatcgatc < 1:4213894/101‑1 (MQ=255) cTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatcgatcg < 1:2880012/101‑1 (MQ=255) tATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGt > 1:5897543/1‑101 (MQ=255) attAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGATATCGATCGTTa > 1:8010722/2‑101 (MQ=255) ttAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTaa > 1:5008611/1‑101 (MQ=255) ttAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTaa > 1:10006515/1‑101 (MQ=255) tAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAg > 1:5640379/1‑101 (MQ=255) tAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAg < 1:11927542/101‑1 (MQ=255) aaCTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGt > 1:3149122/1‑101 (MQ=255) aCTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTa > 1:1615376/1‑101 (MQ=255) cTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTaa < 1:1038089/101‑1 (MQ=255) ttAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAttgcttg < 1:12013021/101‑1 (MQ=255) tAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAttgcttgc < 1:7922844/101‑1 (MQ=255) tAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAttgcttgc < 1:2414026/101‑1 (MQ=255) aaaGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCg > 1:4387491/1‑101 (MQ=255) aGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGAc < 1:2362886/101‑1 (MQ=255) gATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTCTAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACg < 1:10537733/101‑1 (MQ=255) gATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACg > 1:2056210/1‑101 (MQ=255) gATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACg < 1:810680/101‑1 (MQ=255) tttttAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtc > 1:7410926/1‑101 (MQ=255) tttttAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtc > 1:10214305/1‑101 (MQ=255) ttttAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtca > 1:12230883/1‑101 (MQ=255) ttttAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtaa > 1:11507462/1‑99 (MQ=255) tttAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtcat > 1:8943352/1‑101 (MQ=255) tAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtcattc < 1:8620001/101‑1 (MQ=255) aaaTTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtcattca > 1:9544646/1‑101 (MQ=255) aattaattAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtcattcat < 1:4316551/101‑1 (MQ=255) attaattaATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATc > 1:6502602/1‑101 (MQ=255) attaattaATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATc < 1:11780496/101‑1 (MQ=255) ttaattaaTGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCt > 1:10622704/1‑101 (MQ=255) ttaattaaTGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCt > 1:7669961/1‑101 (MQ=255) taattaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTg > 1:617247/1‑101 (MQ=255) taattaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTg > 1:9890110/1‑101 (MQ=255) attaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCa > 1:9762793/1‑101 (MQ=255) attaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCa > 1:629293/1‑101 (MQ=255) ttaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGCTCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCAt < 1:7165355/101‑1 (MQ=255) taatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATa > 1:7062889/1‑101 (MQ=255) atGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAg > 1:3396900/1‑101 (MQ=255) tGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAgg > 1:680810/1‑101 (MQ=255) gATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGc < 1:9824363/101‑1 (MQ=255) gATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGc > 1:1757802/1‑101 (MQ=255) tGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCAc > 1:2186200/1‑101 (MQ=255) gTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACt < 1:10889991/101‑1 (MQ=255) ttATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGGCGTCATTCATCTGCATAAGGCCACta > 1:8365677/1‑101 (MQ=255) tataAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtat > 1:2020338/1‑101 (MQ=255) tataAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtat > 1:1097395/1‑101 (MQ=255) tataAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtat < 1:1003696/101‑1 (MQ=255) ataAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtatt < 1:4847659/101‑1 (MQ=255) taAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtatta > 1:1116294/1‑101 (MQ=255) aaaaaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATg < 1:6534788/101‑1 (MQ=255) aaaaaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATAGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATg > 1:9478559/1‑101 (MQ=255) aaaaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGa > 1:121240/1‑101 (MQ=255) aaaaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGa < 1:1889931/101‑1 (MQ=255) aaaaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGa < 1:3714147/101‑1 (MQ=255) aaaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGaa > 1:4633829/1‑101 (MQ=255) aaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGaaa > 1:10781719/1‑101 (MQ=255) atatCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGaaaa > 1:9664232/1‑101 (MQ=255) atatCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGaaaa < 1:8470913/101‑1 (MQ=255) tatCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGaaaca > 1:8729498/1‑99 (MQ=255) tatCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGaaaaa < 1:4915355/101‑1 (MQ=255) tatCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGaaaaa > 1:11049506/1‑101 (MQ=255) tatCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGaaaaa > 1:2750565/1‑101 (MQ=255) atCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAAc < 1:11410583/101‑1 (MQ=255) atCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAAc < 1:3220053/101‑1 (MQ=255) atCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAAc > 1:4786202/1‑101 (MQ=255) tCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACg > 1:12041808/1‑101 (MQ=255) tCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACg > 1:8885947/1‑101 (MQ=255) tGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaa > 1:8952613/1‑101 (MQ=255) gTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaa < 1:2478047/101‑1 (MQ=255) gTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaa > 1:6636709/1‑101 (MQ=255) gTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaa > 1:6616873/1‑101 (MQ=255) gTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaa < 1:9367468/101‑1 (MQ=255) gTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaa > 1:777357/1‑101 (MQ=255) tATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaaa > 1:4018651/1‑101 (MQ=255) aTGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaaaa > 1:5668947/1‑101 (MQ=255) aTGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaaaa < 1:11710600/101‑1 (MQ=255) tgtgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAc < 1:927624/101‑1 (MQ=255) tgtgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAc > 1:5391761/1‑101 (MQ=255) tgtgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAc > 1:6140227/1‑101 (MQ=255) gATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCt > 1:6354585/1‑101 (MQ=255) aTCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCTc > 1:3041793/1‑101 (MQ=255) | GTCCAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCCAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCTC > NC_007779/1170475‑1170670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |