| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 4,546,535 | T→A | 100% | intergenic (+296/‑182) | fimB → / → fimE | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA/tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 4,546,535 | 0 | T→A | 100.0% | 974.5 | 234 | intergenic (+296/‑182) | fimB/fimE | tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA/tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (131/103): ref base (0/0): total (131/103) | ||||||||||
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
TACACATCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCT > NC_007779/4546437‑4546632 | acacATCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAatcaaaacaa < 1:11707026/101‑1 (MQ=255) cACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGaaaa < 1:9452285/101‑1 (MQ=255) cACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGaaaa > 1:7839001/1‑101 (MQ=255) aCTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAAt > 1:4183715/1‑101 (MQ=255) aCTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAAt < 1:10915946/101‑1 (MQ=255) cTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATa < 1:4652846/101‑1 (MQ=255) cTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATa < 1:10847674/101‑1 (MQ=255) ttAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAg > 1:3663432/1‑101 (MQ=255) tAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGa < 1:6805997/101‑1 (MQ=255) aaaTCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtg > 1:9797859/1‑101 (MQ=255) aaTCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgt < 1:1897368/101‑1 (MQ=255) tctcCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgttg > 1:9010398/1‑101 (MQ=255) tctcCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgttg > 1:11825893/1‑101 (MQ=255) tctcCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgttg < 1:5784908/101‑1 (MQ=255) tctcCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGAtgttg < 1:3803740/101‑1 (MQ=255) tcCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTc < 1:11963793/101‑1 (MQ=255) tcCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTc < 1:9678450/101‑1 (MQ=255) cTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTcac > 1:1973022/1‑101 (MQ=255) gTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACAt > 1:6652396/1‑101 (MQ=255) tttCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATc > 1:10009174/1‑101 (MQ=255) ttCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCa < 1:6871234/101‑1 (MQ=255) ttCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCa < 1:9568971/101‑1 (MQ=255) tCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAg > 1:3534900/1‑101 (MQ=255) tCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAg > 1:13766442/1‑101 (MQ=255) tCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTCGTCACATCAg < 1:10264983/101‑1 (MQ=255) ccGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGt < 1:934863/101‑1 (MQ=255) gCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGa < 1:1566220/101‑1 (MQ=255) cACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGat > 1:5494544/1‑101 (MQ=255) aCTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGata > 1:10501094/1‑101 (MQ=255) aCTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGata > 1:5951369/1‑101 (MQ=255) cTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGatat > 1:4511067/1‑101 (MQ=255) ttttttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtatt > 1:2839432/1‑101 (MQ=255) ttttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtatttt > 1:825203/1‑101 (MQ=255) ttttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtatttt > 1:15196378/1‑101 (MQ=255) tttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtatttta > 1:13479265/1‑101 (MQ=255) tttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtatttta < 1:1760994/101‑1 (MQ=255) ttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtattttat > 1:9193361/1‑101 (MQ=255) ttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtattttat > 1:13420043/1‑101 (MQ=255) ttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtattttat < 1:13590627/101‑1 (MQ=255) ttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtattttat < 1:1489014/101‑1 (MQ=255) ttCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtattttat < 1:13905266/101‑1 (MQ=255) tCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtattttatt < 1:9832701/101‑1 (MQ=255) tCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTG‑TATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGAtattttattt > 1:14468862/1‑101 (MQ=255) ttATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTAttttt > 1:8889194/1‑101 (MQ=255) tATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTg < 1:8415326/101‑1 (MQ=255) aTTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGt > 1:6426931/1‑101 (MQ=255) ttttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTa > 1:5303220/1‑101 (MQ=255) tttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCACAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTAt > 1:4334421/1‑101 (MQ=255) tttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTAt > 1:7872004/1‑101 (MQ=255) ttttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATg < 1:7064344/101‑1 (MQ=255) tttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGa < 1:9062357/101‑1 (MQ=255) tttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGa > 1:14428626/1‑101 (MQ=255) ttAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGat < 1:8708815/101‑1 (MQ=255) tAAGCAACTGGAAGTTAATCCATTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGata > 1:13848666/1‑101 (MQ=255) tAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGata > 1:3362499/1‑101 (MQ=255) tAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGata > 1:3278742/1‑101 (MQ=255) aaGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGatat < 1:2052828/101‑1 (MQ=255) aaGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGatat > 1:5527982/1‑101 (MQ=255) aacAAATGGAAATTAAACCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATAtt < 1:8312554/99‑1 (MQ=255) aaCTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTaa > 1:4093162/1‑101 (MQ=255) aCTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAAt < 1:8087503/101‑1 (MQ=255) aCTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAAt > 1:5068226/1‑101 (MQ=255) cTGGAAGTTAATCCACTGCATTCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATg > 1:9287329/1‑101 (MQ=255) tGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGt > 1:14202591/1‑101 (MQ=255) ggAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTa < 1:13208966/101‑1 (MQ=255) ggAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTa > 1:12500623/1‑101 (MQ=255) aGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAAtt < 1:12182367/101‑1 (MQ=255) aGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAAtt < 1:10382312/101‑1 (MQ=255) aGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAAtt < 1:11954304/101‑1 (MQ=255) ttAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGa < 1:12036136/101‑1 (MQ=255) ttAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGa < 1:11394992/101‑1 (MQ=255) tAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGAc < 1:7483529/101‑1 (MQ=255) tAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGAc < 1:6558849/101‑1 (MQ=255) tAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGAc < 1:3906916/101‑1 (MQ=255) aTCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTg > 1:2311334/1‑101 (MQ=255) aCTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAg < 1:14661082/101‑1 (MQ=255) tGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGcc < 1:6193094/101‑1 (MQ=255) tGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGcc > 1:7979259/1‑101 (MQ=255) tGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTCATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGcc > 1:15102068/1‑101 (MQ=255) gCAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCca < 1:7257007/101‑1 (MQ=255) cAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAGTGTAATTGACTGATAGCcac > 1:9527449/1‑101 (MQ=255) cAATCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCcac > 1:2185290/1‑101 (MQ=255) aaTCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCcaca < 1:11860574/101‑1 (MQ=255) tCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATc > 1:12292459/1‑101 (MQ=255) tCTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATc < 1:4789213/101‑1 (MQ=255) cTATTGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCa > 1:13086420/1‑101 (MQ=255) tGTTATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTcc < 1:7037684/101‑1 (MQ=255) ttATATTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgt > 1:14607962/1‑101 (MQ=255) tataTTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtg > 1:10624818/1‑101 (MQ=255) tataTTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtg > 1:8758233/1‑101 (MQ=255) tataTTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtg > 1:2356106/1‑101 (MQ=255) tataTTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtg > 1:3250468/1‑101 (MQ=255) tatTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtgtg < 1:11043619/101‑1 (MQ=255) tatTGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCgtgtg > 1:11570997/1‑101 (MQ=255) ttGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGtgtgtg < 1:6092455/101‑1 (MQ=255) ttGAATCAAAACAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGtgtgtg > 1:7655706/1‑101 (MQ=255) aatcaaaacaATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGtt > 1:8572791/1‑101 (MQ=255) atcaaaacaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTa < 1:14924267/101‑1 (MQ=255) tcaaaacaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTAt > 1:1553874/1‑101 (MQ=255) caaaacaaTGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATc < 1:12737257/101‑1 (MQ=255) | TACACATCACTTAAAATCTCCTGTTTCCGCACTTTTTTCTTTATTTTTTAAGCAACTGGAAGTTAATCCACTGCAATCTATTGTTATATTGAATCAAATCAATGAAAATAGATGTTGTCACATCAGTGATATTTTATTTTTGTATGATATTTAATGTAATTGACTGATAGCCACATCACTCCGTGTGTGGTTATCT > NC_007779/4546437‑4546632 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |