| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 608570 | NA (NA) | 230 (0.970) | 127/174 | NT | 97.5% | intergenic (+170/+112) | insL/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex |
| ? | NC_007779 | 1305025 = | 6 (0.020) | coding (413/921 nt) | oppB | oligopeptide transporter subunit | |||||
Only 100 of 518 total aligned reads displayed.
TTTTTCCTTGCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTT > NC_007779/1304925‑1305125 | acagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatg < 1:10196045‑M2/1‑1 (MQ=255)acagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatg < 1:6951851‑M2/1‑1 (MQ=255)acagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatg < 1:3480747‑M2/1‑1 (MQ=255) cagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgg > 1:2221135‑M2/100‑101 (MQ=255) cagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgg > 1:7500729‑M2/100‑101 (MQ=255) agcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatggg < 1:5240137‑M2/3‑1 (MQ=255) agcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatggg < 1:7661312‑M2/3‑1 (MQ=255) ttCCTTGCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGgt < 1:2682612/101‑1 (MQ=255) gcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGgt < 1:4642985‑M2/4‑1 (MQ=255) acaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGgttgtt > 1:9636336‑M2/94‑101 (MQ=255) tGCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTa < 1:4333171/101‑1 (MQ=255) gTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCC < 1:506964‑M1/101‑1 (MQ=255) gTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCC > 1:9288142‑M1/1‑101 (MQ=255) gcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCa > 1:71794‑M2/87‑101 (MQ=255) ttgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGttt < 1:2736877‑M2/19‑1 (MQ=255) ttgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGttt < 1:9164728‑M2/19‑1 (MQ=255) tgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGtttt < 1:461196‑M2/20‑1 (MQ=255) gggTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgc > 1:8621975‑M1/1‑93 (MQ=255) tgtTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaa < 1:2130912‑M1/101‑12 (MQ=255) tgtTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaa < 1:2874695‑M1/101‑12 (MQ=255) ttAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaact > 1:7374190‑M1/1‑88 (MQ=255) acgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGtt < 1:6138346‑M2/26‑1 (MQ=255) acacgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGtt > 1:10542024‑M2/76‑101 (MQ=255) cgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTg < 1:11095956‑M2/27‑1 (MQ=255) cgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTg < 1:10832284‑M2/27‑1 (MQ=255) gcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGc > 1:2543688‑M2/74‑101 (MQ=255) cgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCa < 1:803015‑M2/29‑1 (MQ=255) cgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCa < 1:4869089‑M2/29‑1 (MQ=255) tGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaag < 1:2384330‑M1/101‑18 (MQ=255) tGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaag < 1:11351492‑M1/101‑18 (MQ=255) gaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCAc > 1:1576165‑M2/72‑101 (MQ=255) gCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagg < 1:3147410‑M1/101‑19 (MQ=255) gCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagg > 1:4459760‑M1/1‑83 (MQ=255) cTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaaggg > 1:8120478‑M1/1‑82 (MQ=255) cTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaaggg < 1:3921584‑M1/101‑20 (MQ=255) gCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttg > 1:10410198‑M1/1‑79 (MQ=255) atcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCatta > 1:3821444‑M2/67‑101 (MQ=255) gTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtg > 1:6428132‑M1/1‑77 (MQ=255) ttATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtgg < 1:8788327‑M1/101‑26 (MQ=255) tATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGTCTGGCAATGGCCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtgga > 1:1793567‑M1/1‑75 (MQ=255) tATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggt > 1:1357669‑M1/1‑75 (MQ=255) cttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGt > 1:3566213‑M2/62‑101 (MQ=255) aTTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggta > 1:7049295‑M1/1‑74 (MQ=255) ttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTc > 1:2812309‑M2/61‑101 (MQ=255) ttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTc < 1:687635‑M2/41‑1 (MQ=255) ttGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtat > 1:11592488‑M1/1‑73 (MQ=255) tGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtatt < 1:10088653‑M1/101‑30 (MQ=255) ccGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattac < 1:4723228‑M1/101‑32 (MQ=255) cGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaaggtttgtggtattacg < 1:9732550‑M1/101‑33 (MQ=255) aggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGata < 1:11277791‑M2/47‑1 (MQ=255) caccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATAttt < 1:1478286‑M2/50‑1 (MQ=255) caccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCACAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATAttt > 1:8677493‑M2/52‑101 (MQ=255) accgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTg > 1:4066788‑M2/51‑101 (MQ=255) ccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGc > 1:310676‑M2/50‑101 (MQ=255) aacaaaacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatat < 1:1992406‑M1/101‑41 (MQ=255) aacaaaacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatat < 1:2961391‑M1/101‑41 (MQ=255) gaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGa > 1:5312628‑M2/48‑101 (MQ=255) acaaaacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatg < 1:8955219‑M1/101‑42 (MQ=255) acaaaacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatg > 1:12173143‑M1/1‑60 (MQ=255) aaacaCCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatt > 1:5709377‑M1/1‑57 (MQ=255) gtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCAtt > 1:9854336‑M2/43‑101 (MQ=255) acacCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgattta > 1:9429429‑M1/1‑55 (MQ=255) acCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaac > 1:9513813‑M1/1‑53 (MQ=255) ccAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacg > 1:10274167‑M1/1‑52 (MQ=255) cAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgt < 1:12038839‑M1/101‑51 (MQ=255) cAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgt > 1:1283248‑M1/1‑51 (MQ=255) aaaTGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtg > 1:1095805‑M1/1‑50 (MQ=255) aTGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgcc < 1:8206507‑M1/101‑54 (MQ=255) gggACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccga < 1:2093873‑M1/101‑56 (MQ=255) tcagatggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGc > 1:6589347‑M2/33‑101 (MQ=255) cTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaa < 1:12268764‑M1/101‑60 (MQ=255) tataCCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaat > 1:5893874‑M1/1‑41 (MQ=255) tggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCg > 1:1660947‑M2/28‑101 (MQ=255) ataCCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaatt < 1:9611477‑M1/101‑62 (MQ=255) ataCCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaatt > 1:6724621‑M1/1‑40 (MQ=255) taCCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaatta < 1:7273664‑M1/101‑63 (MQ=255) taCCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaatta > 1:5998335‑M1/1‑39 (MQ=255) ggttcaacccttaagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCgg < 1:4417058‑M2/75‑1 (MQ=255) aCCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattac > 1:4273894‑M1/1‑38 (MQ=255) gTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactct < 1:2317331‑M1/101‑67 (MQ=255) ggggCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacga < 1:363278‑M1/101‑72 (MQ=255) gggCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgat > 1:9810533‑M1/1‑29 (MQ=255) taagttagcgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTgg < 1:11916873‑M2/86‑1 (MQ=255) 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cgcttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAAtggtgg > 1:11459676‑M2/8‑101 (MQ=255) aTGACCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtca < 1:2349418‑M1/101‑82 (MQ=255) ttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCCTTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGgc > 1:8397478‑M2/5‑101 (MQ=255) ttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGgc < 1:3361804‑M2/97‑1 (MQ=255) ttatGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGgc < 1:5517966‑M2/97‑1 (MQ=255) aCCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagca < 1:11670522‑M1/101‑85 (MQ=255) aCCGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagca < 1:10587636‑M1/101‑85 (MQ=255) ccGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaa > 1:10647175‑M1/1‑16 (MQ=255) ccGGGGTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaa > 1:2599378‑M1/1‑16 (MQ=255) ggggTTGTTATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaatt < 1:7558236‑M1/101‑88 (MQ=255) | TTTTTCCTTGCGGTAATACTGGGTGTTAGTGCTGGCGTTATTGCCGCATTAAAACAAAACACCAAATGGGACTATACCGTGATGGGGCTGGCAATGACCGGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTT > NC_007779/1304925‑1305125 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |