Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 1,496,775 | Δ1 bp | 100% | coding (11/924 nt) | ydcI ← | DNA‑binding transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 1,496,775 | 0 | T→. | 100.0% | 1100.9 | 218 | coding (11/924 nt) | ydcI | DNA‑binding transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (101/117): ref base (0/0): total (101/117) |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
CAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTATTTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTA > NC_007779/1496675‑1496871 | cAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAt > 1:7526088/1‑101 (MQ=255) cAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAt < 1:6305437/101‑1 (MQ=255) cAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAt < 1:9383377/101‑1 (MQ=255) cAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAt < 1:1864787/101‑1 (MQ=255) aaTTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTAttt > 1:3844742/1‑101 (MQ=255) ttAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGTGCTGACTAAACAGACTAttttt < 1:10565754/101‑1 (MQ=255) gTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATa < 1:355232/101‑1 (MQ=255) gTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATa < 1:3342794/101‑1 (MQ=255) ttCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACCAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAg > 1:9620366/1‑101 (MQ=255) tCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGGTGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGc < 1:10031115/101‑1 (MQ=255) tCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGc < 1:11108031/101‑1 (MQ=255) cAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCg > 1:3446781/1‑101 (MQ=255) cAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTCGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCg > 1:7716788/1‑101 (MQ=255) gCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGAt < 1:1894372/101‑1 (MQ=255) cgcgcgCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGt > 1:1447165/1‑101 (MQ=255) gcgcgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGtt > 1:11859762/1‑101 (MQ=255) gcgcgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGtt < 1:8073055/101‑1 (MQ=255) gcgcgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGtt > 1:8474634/1‑101 (MQ=255) gcgcgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGtt < 1:9888211/101‑1 (MQ=255) cgcgcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTa < 1:669350/101‑1 (MQ=255) gcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaaaa > 1:8891765/1‑101 (MQ=255) gcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaaaa > 1:1084220/1‑101 (MQ=255) gcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaaaa < 1:639581/101‑1 (MQ=255) gcCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaaaa < 1:6528273/101‑1 (MQ=255) ccccAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTaaaaa > 1:6878555/1‑101 (MQ=255) cccAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAAc > 1:4465700/1‑101 (MQ=255) cccAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAAc < 1:11649634/101‑1 (MQ=255) ccAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACg > 1:7415449/1‑101 (MQ=255) cAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGa > 1:11722773/1‑101 (MQ=255) aaaGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGaa < 1:9060123/101‑1 (MQ=255) aaGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAg < 1:4871640/101‑1 (MQ=255) gTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCg < 1:6136144/101‑1 (MQ=255) ttgttgTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTc < 1:3049559/101‑1 (MQ=255) gttgtGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGc > 1:12153569/1‑101 (MQ=255) ttgtGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCt < 1:6614848/101‑1 (MQ=255) tgtgCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTg < 1:7115901/101‑1 (MQ=255) tgtgCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTg > 1:5030481/1‑101 (MQ=255) gtgCGAGAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGa > 1:8792013/1‑101 (MQ=255) tgCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGAc < 1:11797959/101‑1 (MQ=255) gCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACa > 1:2201108/1‑101 (MQ=255) gACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAg < 1:2574632/101‑1 (MQ=255) gACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAg > 1:11513918/1‑101 (MQ=255) aCAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGTGGTGTCGCTGACAAGt > 1:9189960/1‑101 (MQ=255) gCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGaa < 1:2235687/101‑1 (MQ=255) aCGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgtt > 1:2897358/1‑101 (MQ=255) cGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgttg < 1:10239140/101‑1 (MQ=255) cGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgttg > 1:11602033/1‑101 (MQ=255) aaTGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAgttgtt > 1:1116203/1‑101 (MQ=255) aTGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGttt < 1:4572827/101‑1 (MQ=255) tGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTg < 1:9517396/101‑1 (MQ=255) gTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGa < 1:8879278/101‑1 (MQ=255) gTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGa < 1:6884943/101‑1 (MQ=255) aaGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATg < 1:2534407/101‑1 (MQ=255) aaGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATg < 1:2676132/101‑1 (MQ=255) aGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGa < 1:3406205/101‑1 (MQ=255) aGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGa > 1:1111139/1‑101 (MQ=255) aGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGa > 1:3961042/1‑101 (MQ=255) gTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATa < 1:11406110/101‑1 (MQ=255) tGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATaa < 1:12006603/101‑1 (MQ=255) tGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATaa < 1:2138844/101‑1 (MQ=255) gcgcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACt < 1:12267778/101‑1 (MQ=255) gcgcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACt < 1:11239793/101‑1 (MQ=255) cgcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACtt > 1:7350280/1‑101 (MQ=255) cgcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACtt > 1:5472703/1‑101 (MQ=255) cgcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACtt < 1:1422076/101‑1 (MQ=255) gcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTg > 1:1555272/1‑101 (MQ=255) gcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTg > 1:3525005/1‑101 (MQ=255) gcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTg < 1:10101470/101‑1 (MQ=255) gcAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTg > 1:8088978/1‑101 (MQ=255) aaaCGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGAt < 1:1618586/101‑1 (MQ=255) aaaCGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGAt > 1:12076101/1‑101 (MQ=255) aCGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTg < 1:3645425/101‑1 (MQ=255) aCGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTg < 1:9002191/101‑1 (MQ=255) aCGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTGGATTg < 1:1042073/101‑1 (MQ=255) cGGATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGc < 1:5745732/101‑1 (MQ=255) ggATGCGCTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCa > 1:3752726/1‑101 (MQ=255) gcgcTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAat < 1:1999351/101‑1 (MQ=255) gcgcTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGATGACAAGTGATGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAat < 1:7610619/101‑1 (MQ=255) cgcTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAata < 1:6993090/101‑1 (MQ=255) gcTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAatat > 1:8672014/1‑101 (MQ=255) cTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAAtatt < 1:5322654/101‑1 (MQ=255) cTGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAAtatt < 1:5134648/101‑1 (MQ=255) tGACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAAtatta > 1:5566253/1‑101 (MQ=255) gACTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAAtattat < 1:4299329/101‑1 (MQ=255) aCTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATattatt > 1:9406669/1‑101 (MQ=255) cTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATAttatta > 1:2814420/1‑101 (MQ=255) cTAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATAttatta > 1:2400812/1‑101 (MQ=255) tAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTaa > 1:3687759/1‑101 (MQ=255) tAAACAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTaa > 1:7826661/1‑101 (MQ=255) tAAACAGACTA‑TTTTGTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTaa < 1:4712146/101‑1 (MQ=255) aaaCAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAAc > 1:2320578/1‑101 (MQ=255) aaCAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACa < 1:8382936/101‑1 (MQ=255) aaCAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACa < 1:4188152/101‑1 (MQ=255) aaCAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACa < 1:10883159/101‑1 (MQ=255) aaCAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACa > 1:10003411/1‑101 (MQ=255) aCAGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACaa > 1:2780400/1‑101 (MQ=255) aGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAAtt < 1:7334404/101‑1 (MQ=255) aGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAAtt > 1:1574236/1‑101 (MQ=255) aGACTA‑TTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAAtt < 1:9983048/101‑1 (MQ=255) aGACTA‑TTATTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAAtt < 1:8204538/101‑1 (MQ=255) | CAAATTAAGGGTTTCAGCCGCGCGCCCCAAAGTTCCTTGTTGTGCGACAGCTACGAATGTATGAAGGTGGCGCAAACGGATGCGCTGACTAAACAGACTATTTTTTTCCATAAGCGATGTTAAAAACGAAGCGGTGTCGCTGACAAGTGAAGTTGTTTGATTATGATAACTTGATTGCAAAATATTATTAACAATTA > NC_007779/1496675‑1496871 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |