| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 771555 = | 166 (0.680) | 5 (0.020) | 5/178 | NT | 3.0% | intergenic (+522/‑325) | mngB/cydA | alpha‑mannosidase/cytochrome d terminal oxidase, subunit I |
| ? | NC_007779 | = 1050966 | NA (NA) | intergenic (+14/+419) | insB/cspH | IS1 transposase InsAB'/stress protein, member of the CspA‑family | |||||
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
CTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTT > NC_007779/771455‑771655 | gacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactgtcaataagttggagtcattacc < 1:11176433‑M1/1‑1 (MQ=255)gacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacc < 1:4445981‑M1/1‑1 (MQ=255)gacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacc < 1:7023899‑M1/1‑1 (MQ=255)gacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacc > 1:1210289‑M1/101‑101 (MQ=255)gacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacc > 1:7667593‑M1/101‑101 (MQ=255)gacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacc > 1:1184875‑M1/101‑101 (MQ=255)gacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacc > 1:11485223‑M1/101‑101 (MQ=255) ttATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCt > 1:6549179/1‑101 (MQ=255) ttATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCt > 1:7167565/1‑101 (MQ=255) ttATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCt > 1:10485998/1‑101 (MQ=255) ttATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCt < 1:7818427/101‑1 (MQ=255) ataACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTg < 1:7736958/101‑1 (MQ=255) taACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTgg > 1:1390792/1‑101 (MQ=255) 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acacaTTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGG > 1:9522909‑M2/1‑101 (MQ=255) acacaTTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGG < 1:11124006‑M2/101‑1 (MQ=255) cacaTTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGG < 1:2186662‑M2/101‑1 (MQ=255) aTTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCAt > 1:2109139/1‑101 (MQ=255) tttAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCa < 1:1995034/101‑1 (MQ=255) tAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCaaa > 1:8484071/1‑101 (MQ=255) tAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGACATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCaaa > 1:9167608/1‑101 (MQ=255) gaCATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCaaaaa > 1:2716755/2‑101 (MQ=255) cATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAaga > 1:4256765/1‑101 (MQ=255) aaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcatacCTTGGAAATGGGCATCAAAAagag < 1:9701252‑M1/24‑1 (MQ=255) atcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGAt > 1:5664188‑M1/76‑101 (MQ=255) aaaTGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGAt > 1:4523626/1‑101 (MQ=255) aaaTGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGAt > 1:12072741/1‑101 (MQ=255) tCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAAtt > 1:10119458/1‑101 (MQ=255) cACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTg < 1:3442132/101‑1 (MQ=255) aaaGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTtct < 1:7366324/101‑1 (MQ=255) aaGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTtctc > 1:2494593/1‑101 (MQ=255) aaGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTtctc > 1:8290603/1‑101 (MQ=255) gTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGa < 1:9900302/101‑1 (MQ=255) tACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATc > 1:1582957/1‑101 (MQ=255) ttATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAAt > 1:11627497/1‑101 (MQ=255) 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tacCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCaaa < 1:687440‑M1/98‑1 (MQ=255) gTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAAt < 1:8359012/101‑1 (MQ=255) gTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAAt < 1:7919103/101‑1 (MQ=255) | CTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGTTACCTTATTGAAACATGATTAACATAATTTGTAGGAATTGATATTTATCAATGTATAAGTCTTGGAAATGGGCATCAAAAAGAGATAAATTGTTCTCGATCAAATTGGCTGAAAGGCGGTAATTTAGCTATAAATTGATCACCGTCGAAAAATGCAAATTT > NC_007779/771455‑771655 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |