New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 4355066 | 2 (0.010) | 183 (0.780) | 119/176 | NT | 98.9% | coding (1275/1632 nt) | dcuS | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with DcuR, regulator of anaerobic fumarate respiration |
? | NC_007779 | = 4504189 | NA (NA) | intergenic (+9/‑90) | insD/yjgW | IS2 insertion element transposase InsAB'/hypothetical protein |
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
CTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/4354965‑4355066 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTA < NC_007779/4504189‑4504093 CTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCT < 1:1797325/101‑1 CTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCT < 1:11815030/101‑1 ATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGA > 1:2125745/1‑101 ATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGA < 1:5394153/101‑1 gTTCGCCTCCGGGGTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGAT < 1:2413536/100‑1 TTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGAT < 1:2542658/101‑1 TTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATT < 1:4274951/101‑1 TTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATT < 1:6701193/101‑1 TCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCGTCACTGCCGCTGGATTT < 1:3574213/101‑1 TCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTT < 1:7549283/101‑1 GCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGC > 1:8406679/1‑101 GCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGC < 1:8113516/101‑1 CCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCC > 1:2967301/1‑101 CCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCT > 1:6052707/1‑101 CGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTA > 1:9683436/1‑101 CGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTA < 1:120044/101‑1 GGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTAT > 1:11257108/1‑101 GGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTAT < 1:1227317/101‑1 GTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCAGTGCCGCTGAATTTGCCCCTATAT > 1:8885901/1‑101 TTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATT > 1:9656912/1‑101 TTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATT < 1:557219/101‑1 TCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTT > 1:4045723/1‑101 CCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTC < 1:12055121/101‑1 CCGGCCCTAATGCCTCCAGCACGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTC > 1:11448561/1‑101 CGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCC > 1:11172587/1‑101 CGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCC > 1:1758012/1‑101 GCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAG > 1:9848920/1‑101 CCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAC > 1:9084076/1‑101 CCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAC < 1:11762580/101‑1 AATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATC > 1:3445538/1‑101 ATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCT > 1:11871266/1‑101 TGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTG < 1:5824864/101‑1 TGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTG < 1:10452123/101‑1 TCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTAT > 1:1028539/1‑101 TCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTAT < 1:1600163/101‑1 TCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTAT < 1:1550384/101‑1 CAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCA < 1:5428680/101‑1 CAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGGCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCA < 1:773650/101‑1 AGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCAC > 1:5161172/1‑101 GCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT < 1:5899521/101‑1 CGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTT < 1:2667738/101‑1 GCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTA < 1:2751710/101‑1 GCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACCTA < 1:9392223/101‑1 CGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAA > 1:8577587/1‑101 GTTTTCTATAAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAC < 1:7356365/101‑1 TTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCCCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACC < 1:5151373/101‑1 TTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCC < 1:3635428/101‑1 TTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCA < 1:11032104/101‑1 TATCAGATTTCCCAATGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTA > 1:11679305/1‑101 TATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTA < 1:5524357/101‑1 TATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTA > 1:11199927/1‑101 TATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTA > 1:8500790/1‑101 TATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTAGATTTGCCCCTATAATTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTA > 1:8737819/1‑101 ATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTAC < 1:9030483/101‑1 ATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTAC > 1:12193183/1‑101 TCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACA < 1:2382163/101‑1 CAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAA > 1:6805591/1‑101 AGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG < 1:6030718/101‑1 AGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAG < 1:6178009/101‑1 TTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCG < 1:247379/101‑1 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GCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCA < 1:2140520/101‑1 GCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCA < 1:4595011/101‑1 CCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCAC < 1:7554848/101‑1 CCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCAC > 1:6537782/1‑101 CCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCAC > 1:7002230/1‑101 CGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACT > 1:1934938/1‑101 CGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACT > 1:684382/1‑101 CGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACT < 1:9512362/101‑1 CTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/4354965‑4355066 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTA < NC_007779/4504189‑4504093 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |