| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 1909276 = | 258 (0.920) | 24 (0.090) | 22/178 | NT | 8.6% | coding (30/144 nt) | yobF | hypothetical protein |
| ? | NC_007779 | 2411459 = | NA (NA) | intergenic (‑148/+14) | lrhA/insB | DNA‑binding transcriptional repressor/IS1 element protein | |||||
AAAAATGGCTTGCCATAATTAACGTTGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/1909376‑1909276‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC > NC_007779/2411459‑2411558 AAAAATGGCTTGCCATAATTAACGTTGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTG < 1:10876514/101‑1AAAAATGGCTTGCCATAATTAACGTTGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTG > 1:2559907/1‑101 TTGCCATAATTAACGTTGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACT > 1:9535267/1‑101 TGCCATAATTAACGTTGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGTGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTAAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTC < 1:13852584/101‑1 GCCATAATTAACGTTGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCC > 1:558817/1‑101 CCATAATTAACGTTGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCA > 1:12961997/1‑101 TAACGTTGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATT > 1:10842189/1‑101 TAACGTTGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATT < 1:8756053/101‑1 TAACGTTGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATT < 1:1486078/101‑1 AACGTTGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTG < 1:4907911/101‑1 CGTTGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGAT < 1:11897803/101‑1 GTTGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATA < 1:2149956/101‑1 TGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT > 1:4579856/1‑101 TGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT < 1:4529834/101‑1 GTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT < 1:8159902/101‑1 AGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG < 1:3159092/101‑1 CGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC < 1:6018995/101‑1 ACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTC < 1:9499814/101‑1 TGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGC > 1:7155686/1‑101 GTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT < 1:14002498/101‑1 TGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATT < 1:1353351/101‑1 TAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACA > 1:2740756/1‑101 TAAAGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACA > 1:3510072/1‑101 AGAAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCG > 1:808423/1‑101 AAGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAC > 1:2479140/1‑101 AGTCCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACT < 1:6502622/101‑1 CTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCG < 1:7260045/101‑1 CTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCG > 1:4306293/1‑101 TGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT < 1:10688020/101‑1 TGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > 1:4565649/1‑101 TGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > 1:8749269/1‑101 TGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > 1:12501134/1‑101 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCTACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC < 1:8044747/101‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC > 1:10672184/1‑101 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC < 1:8860973/101‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC < 1:1100400/101‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC > 1:850063/1‑101 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC > 1:12647673/1‑101 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC < 1:8042994/101‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC > 1:799766/1‑101 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC < 1:796060/101‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC < 1:7927201/101‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC > 1:13560222/1‑101 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC > 1:1661528/1‑101 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC < 1:6991899/101‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC < 1:2229005/101‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC > 1:2395113/1‑101 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC > 1:5669751/1‑101 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC < 1:562172/101‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC > 1:5333322/1‑101 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC > 1:5218056/1‑101 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC > 1:2767984/1‑101 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC > 1:3132806/1‑101 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC > 1:3178217/1‑101 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC < 1:3621417/101‑1 GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGAGACTTCCGTC > 1:2464691/1‑101 AAAAATGGCTTGCCATAATTAACGTTGTATGTGATAACAGATTTCGGGTTAAACGAGGTACAGTTCTGTTTATGTGTGGCATTTTCAGTAAAGAAGTCCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/1909376‑1909276‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTC > NC_007779/2411459‑2411558 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |