| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 2178209 = | 0 (0.000) | 228 (0.810) | 117/180 | NT | 100% | intergenic (+178/+184) | insH/gatZ | IS5 element protein/D‑tagatose 1,6‑bisphosphate aldolase 2, subunit |
| ? | NC_007779 | = 2412225 | NA (NA) | intergenic (‑55/‑782) | insA/yfbQ | IS1 element protein/aminotransferase | |||||
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
ATGCTCGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/2178308‑2178209‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCA < NC_007779/2412225‑2412135 GCTCGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGT < 1:4274765/101‑1 GCTCGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGT > 1:6150091/1‑101 TCGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGA > 1:5255527/1‑101 CGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGAT < 1:7411797/101‑1 GCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATG < 1:92988/101‑1 GCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATG > 1:7661830/1‑101 GCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATG > 1:12640732/1‑101 CCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGC > 1:2341659/1‑101 CAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCT < 1:5336236/101‑1 CAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCT > 1:6404923/1‑101 CAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCT < 1:12395053/101‑1 CAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCT > 1:9911724/1‑101 AAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTG > 1:3183756/1‑101 AAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTG > 1:10088038/1‑101 AAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTG > 1:10515128/1‑101 AAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTG < 1:782860/101‑1 AAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGC > 1:1012709/1‑101 TGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCGCGCTATTGGGTGATGCTGCCAAC < 1:7287238/101‑1 TGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTT < 1:792289/101‑1 TTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACT > 1:13492462/1‑101 CATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCAGCCAACTTACTGA > 1:9318088/1‑101 ATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT > 1:3872372/1‑101 ATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT < 1:11086480/101‑1 ATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:3369950/101‑1 ATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:10823648/101‑1 ATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 1:12026443/1‑101 TACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 1:5658795/101‑1 ACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:8366244/101‑1 CCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 1:793966/1‑101 CCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 1:246456/1‑101 CTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGGTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:2384490/101‑1 GGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT > 1:3499539/1‑101 GGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT < 1:3707747/101‑1 GGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT > 1:8605919/1‑101 GGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT < 1:7563571/101‑1 CCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCTGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 1:5764505/101‑1 CACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT > 1:8437169/1‑101 ACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 1:12076069/101‑1 ACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG > 1:5390755/1‑101 ACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG > 1:11870753/1‑101 ACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 1:109688/101‑1 AGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT > 1:144071/1‑101 GGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG < 1:10467174/101‑1 CATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT < 1:8055670/101‑1 CATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT < 1:10057877/101‑1 TTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT < 1:295508/101‑1 TAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 1:8988730/101‑1 TAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 1:11853302/101‑1 AATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG < 1:10411723/101‑1 ATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA < 1:13682528/101‑1 TGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG > 1:8914118/1‑101 TGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 1:13180484/101‑1 TGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 1:6025617/101‑1 GCCAGAGAAGCAGCATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 1:6817445/101‑1 GCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 1:2182693/101‑1 CCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 1:13975812/101‑1 CAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 1:6624095/1‑101 CAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:6347541/101‑1 GAGAAGCAGAATTCCCTAGCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTC < 1:9858219/101‑1 GAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTC > 1:1579733/1‑101 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TCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG < 1:2900128/101‑1 CCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGT > 1:12240417/1‑101 CCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGT > 1:12960379/1‑101 CCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT < 1:1134698/101‑1 CCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT > 1:14061779/1‑101 CTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT > 1:4608056/1‑101 CTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT > 1:2715480/1‑101 ACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT < 1:11131537/101‑1 ACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT < 1:7666550/101‑1 CCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA > 1:4029189/1‑101 CGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTAT > 1:5473277/1‑101 GGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATC > 1:4956366/1‑101 GGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA < 1:560277/101‑1 GGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA < 1:393585/101‑1 GGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA < 1:6051006/101‑1 ATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC > 1:6984508/1‑101 TAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTGCTGTTTCTATCAGCT > 1:10593779/1‑101 TAATGCTTGAGCAGCAAGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT < 1:6230639/101‑1 AATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTG < 1:8279932/101‑1 AATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTG < 1:13232000/101‑1 ATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT < 1:4397351/101‑1 ATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT < 1:11553764/101‑1 ATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT > 1:9616546/1‑101 TGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTC > 1:7779266/1‑101 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ATGCTCGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/2178308‑2178209‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCA < NC_007779/2412225‑2412135 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |