New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 693388 | 276 (0.980) | 29 (0.100) | 22/180 | NT | 9.5% | coding (452/1080 nt) | ybeZ | hypothetical protein |
? | NC_007779 | = 1050967 | NA (NA) | intergenic (+15/+418) | insB/cspH | IS1 transposase InsAB'/stress protein, member of the CspA‑family |
Only 100 of 340 total aligned reads displayed.
AGTCAGCAGAATACGGCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCG‑TTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTA > NC_007779/693288‑693488 | tCAGCAGAATACGGCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTa < 1:6832285/101‑1 (MQ=255) agcagAATACGGCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGggta < 1:199247‑M1/101‑5 (MQ=255) agcagAATACGGCGAATTTCCTGACGCTCAAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGGAGGTTTTACCTGTACCCGCCGGGCAAACGCAGAAggggaa > 1:500978/1‑97 (MQ=255) gcagAATACGGCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATg < 1:8984907/101‑1 (MQ=255) agAATACGGCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTc > 1:10306535/1‑101 (MQ=255) gAATGCGGAAAATTCCCTGTGCCTCCAGGGCATAGTCTGCGCCAGCCCCTGCCAGGAAGGTTTAACCCTTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAggggtaatga < 1:3113789/101‑9 (MQ=255) aTACGGCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATg > 1:6639537/1‑101 (MQ=255) tACGGCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATgg < 1:9111808/101‑1 (MQ=255) tACGGCGAATTTCCTGACGCCCCAGGGCTTCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGGACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATgg < 1:3925649/101‑1 (MQ=255) cGGCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTc < 1:5659378/101‑1 (MQ=255) gCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGggtaatgactccaac > 1:1934080‑M1/1‑86 (MQ=255) aTTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCGGCCACTGCCAGGTAGTTTTTACCGGTGCCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAat < 1:2510523/101‑1 (MQ=255) tttCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAata > 1:9370705/1‑101 (MQ=255) ttCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAatat < 1:1155883/101‑1 (MQ=255) tCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTCCCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATAtt < 1:13637686/101‑1 (MQ=255) ccTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTg < 1:12774956/101‑1 (MQ=255) cTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGggtaatgactccaacttattgata < 1:1109911‑M1/101‑25 (MQ=255) cTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTgg > 1:13927011/1‑101 (MQ=255) tGACGGACCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGc < 1:6456519/101‑1 (MQ=255) aCGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGa < 1:14241398/101‑1 (MQ=255) cGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGAt < 1:7372210/101‑1 (MQ=255) cGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGAt > 1:9257371/1‑101 (MQ=255) gCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGggtaatgactccaacttattgatagtgtt > 1:10845399‑M1/1‑72 (MQ=255) gCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGggtaatgactccaacttattgatagtgtt > 1:8592571‑M1/1‑72 (MQ=255) gCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATg < 1:8281595/101‑1 (MQ=255) gCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATg > 1:13553320/1‑101 (MQ=255) tCCCGGGGATCAACCGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTa < 1:2110259/101‑1 (MQ=255) tCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTa > 1:13162446/1‑101 (MQ=255) ccAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTAc > 1:4952874/1‑101 (MQ=255) cAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACt < 1:6709422/101‑1 (MQ=255) aGGGCATCTACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTg > 1:8435405/1‑101 (MQ=255) aGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTg > 1:12983956/1‑101 (MQ=255) aGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTg > 1:2312500/1‑101 (MQ=255) gggCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTgc < 1:12197653/101‑1 (MQ=255) cATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGcc < 1:6193038/101‑1 (MQ=255) cATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGcc > 1:4159505/1‑101 (MQ=255) aTCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCt > 1:5493164/1‑101 (MQ=255) tCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcaga < 1:8721293‑M1/101‑41 (MQ=255) tCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTg < 1:761303/101‑1 (MQ=255) cAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGCATATTGGCGCTGTACTGCGCCTgt > 1:11695022/1‑100 (MQ=255) aaCTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGt < 1:11483803/101‑1 (MQ=255) aaCTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGt < 1:3425089/101‑1 (MQ=255) aCTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGtt > 1:1614410/1‑101 (MQ=255) ccGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGc < 1:4297534/101‑1 (MQ=255) ccGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGc < 1:10238285/101‑1 (MQ=255) cGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCg < 1:9592670/101‑1 (MQ=255) gCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGt > 1:6569987/1‑101 (MQ=255) cAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTg > 1:7855394/1‑101 (MQ=255) gCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTgcg > 1:7453395/1‑101 (MQ=255) ccACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTgcgc < 1:6311010/101‑1 (MQ=255) ccACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTgcgc < 1:12696465/101‑1 (MQ=255) cACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGcgcg < 1:10512051/101‑1 (MQ=255) cACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGcgcg > 1:13380103/1‑101 (MQ=255) aCTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGCGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGttggcgc > 1:2620223/1‑95 (MQ=255) aCTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGATAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGGGTGCGCgg > 1:9739317/1‑101 (MQ=255) tGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCt > 1:8809112/1‑101 (MQ=255) tGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCt < 1:3190163/101‑1 (MQ=255) gCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCtt < 1:13327669/101‑1 (MQ=255) ccAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTa < 1:2426433/101‑1 (MQ=255) ccAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTa > 1:2087338/1‑101 (MQ=255) cAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCGTat > 1:4540472/1‑100 (MQ=255) aggtaggtTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAAt < 1:5770967/101‑1 (MQ=255) ggtaggtTTTCCCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcat < 1:4827138‑M1/101‑63 (MQ=255) ggtaggtTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAAtt < 1:11942886/101‑1 (MQ=255) ggtaggtTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAAtt > 1:8120963/1‑101 (MQ=255) aggtTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTAcg < 1:11301576/101‑1 (MQ=255) ggtTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTAcgc > 1:2243339/1‑101 (MQ=255) ttttACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCCGGTCAATTActccg > 1:3308088/1‑101 (MQ=255) ttACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCcgcg < 1:13689242/101‑1 (MQ=255) ttACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCcgcg < 1:361444/101‑1 (MQ=255) ttACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCcccg > 1:1492647/1‑101 (MQ=255) acccgtacccgCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCG‑tt < 1:1200939/101‑1 (MQ=255) ccgtacccgCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCG‑TTTg < 1:12429320/101‑1 (MQ=255) cgtacccgCCGGGCCAACGCCGAAGGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccga < 1:383496‑M1/101‑76 (MQ=255) tacccgCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCCCG‑TTTGGtt > 1:8352131/1‑101 (MQ=255) tcccgCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCG‑TTTGGttt < 1:11005953/100‑1 (MQ=255) acccgCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGGGCGGCTTTATTACGCCGCG‑GTTGGgtt > 1:11207567/1‑101 (MQ=255) acccgCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCG‑TTTGGttt < 1:7095165/101‑1 (MQ=255) cccgCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCG‑TTTGGtttt < 1:4444268/101‑1 (MQ=255) cccgCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCG‑TTTGGtttt > 1:12810518/1‑101 (MQ=255) ccgccgGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGGGGGGGCTTATTGCCCCGCG‑GTTGGttttt > 1:12305713/1‑100 (MQ=255) ccgccgGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGGGCGGCTTAATTACGCCCCG‑TTTGGttttt > 1:2909037/1‑100 (MQ=255) ccgccgGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTTGGtttt > 1:8147548/1‑101 (MQ=255) ccgccgGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCG‑TTTGGTTTTg < 1:2745674/101‑1 (MQ=255) ccgccgGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCGTCATTACTCCGCG‑CTTTGttttt > 1:6963162/1‑100 (MQ=255) gccgGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCG‑TTTGGTTTTGat < 1:9353425/101‑1 (MQ=255) cgGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCCCG‑TTTGGTTTTTatat > 1:3052656/1‑101 (MQ=255) ggCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCG‑TTTGGTTTTGATATTg < 1:7937999/101‑1 (MQ=255) gCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGGGCGGCTTAATTACGCCGCG‑TTTGGTTTTGATATTGa > 1:14098568/1‑101 (MQ=255) gCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCG‑TATGGTTTTTATATTGa > 1:10606080/1‑101 (MQ=255) 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ccGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCG‑TTTGGTTTTGATATTGACCGCttt < 1:4861940/101‑1 (MQ=255) cGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCG‑TTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTg < 1:13862750/101‑1 (MQ=255) cGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCG‑TTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTg < 1:10434663/101‑1 (MQ=255) | AGTCAGCAGAATACGGCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCG‑TTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTA > NC_007779/693288‑693488 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |