Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 1,170,573 | C→T | 100% | intergenic (‑164/‑77) | ycfQ ← / → ycfR | DNA‑binding transcriptional regulator/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 1,170,573 | 0 | C→T | 100.0% | 1289.2 | 311 | intergenic (‑164/‑77) | ycfQ/ycfR | DNA‑binding transcriptional regulator/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (192/119): ref base (0/0): total (192/119) |
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
GTCCAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCCAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCTC > NC_007779/1170475‑1170670 | gTCCAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAg > 1:6501957/1‑101 (MQ=255) gTCCAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCAATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAg < 1:1244445/101‑1 (MQ=255) tCCAGATCTCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGa < 1:3726245/101‑1 (MQ=255) tCCAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGa < 1:8671823/101‑1 (MQ=255) tCCAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGa < 1:13191076/101‑1 (MQ=255) tCCAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGa > 1:10396433/1‑101 (MQ=255) tCCAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGa < 1:13861750/101‑1 (MQ=255) tCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACAt > 1:11123570/1‑101 (MQ=255) tCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACAt < 1:3214709/101‑1 (MQ=255) ccATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCt > 1:12323238/1‑101 (MQ=255) ccATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCt > 1:10896183/1‑101 (MQ=255) cATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTa > 1:12516409/1‑101 (MQ=255) aTAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTAt > 1:10307124/1‑101 (MQ=255) aTAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTAt < 1:12683651/101‑1 (MQ=255) tAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATc < 1:5077899/101‑1 (MQ=255) tAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATc < 1:11306847/101‑1 (MQ=255) tAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATc > 1:8475714/1‑101 (MQ=255) aaaaaTAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCa < 1:9765712/101‑1 (MQ=255) aaaaaTAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATAACATCTATCa > 1:5377054/1‑101 (MQ=255) aaaaTAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCAt > 1:3998109/1‑101 (MQ=255) aaaaTAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCAt > 1:4409905/1‑101 (MQ=255) aaaTAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCAtt < 1:12590270/101‑1 (MQ=255) aaaTAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCAtt < 1:14010642/101‑1 (MQ=255) aaaTAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCAtt > 1:13569198/1‑101 (MQ=255) aataatTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCAttt > 1:12842396/1‑101 (MQ=255) aatTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGt > 1:4800071/1‑101 (MQ=255) aatTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGt < 1:6764753/101‑1 (MQ=255) aatTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACACCTATCATTTAGt < 1:7580732/101‑1 (MQ=255) tGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTat < 1:8518490/101‑1 (MQ=255) tGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTat > 1:8308768/1‑101 (MQ=255) gCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatc < 1:1465443/101‑1 (MQ=255) cTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatcg < 1:3390960/101‑1 (MQ=255) tttCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatcga < 1:10485869/101‑1 (MQ=255) tttCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatcga > 1:9604843/1‑101 (MQ=255) ttCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatcgat > 1:11539761/1‑101 (MQ=255) ttCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatcgat < 1:1102875/101‑1 (MQ=255) tCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatcgatc > 1:8359188/1‑101 (MQ=255) tATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCACTTAGTTATCGATCGt > 1:10620119/1‑101 (MQ=255) tttAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTa > 1:4662130/1‑101 (MQ=255) ttAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTaa > 1:794728/1‑101 (MQ=255) tGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAt > 1:9553997/1‑101 (MQ=255) gAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAtt < 1:6674906/101‑1 (MQ=255) gAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAtt < 1:13978761/101‑1 (MQ=255) gAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAtt < 1:12932219/101‑1 (MQ=255) gAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAtt > 1:2171698/1‑101 (MQ=255) aaaTTTAAAGATTTTTAAATTAATTCATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAttg > 1:6920277/1‑101 (MQ=255) aaaTTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAttg < 1:7278997/101‑1 (MQ=255) aaaTTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAttg > 1:12145134/1‑101 (MQ=255) tttAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAttgctt > 1:5309705/1‑101 (MQ=255) tAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAttgcttgc > 1:6361506/1‑101 (MQ=255) aaaGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTAAAGTAATTGCTTGCg > 1:13112669/1‑101 (MQ=255) aaGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGa > 1:5618406/1‑101 (MQ=255) aGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGAc > 1:1330916/1‑101 (MQ=255) gATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATTTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACg > 1:4057245/1‑101 (MQ=255) aTTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGt > 1:10238545/1‑101 (MQ=255) ttttAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtca < 1:8987800/101‑1 (MQ=255) tAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtcattc < 1:10696909/101‑1 (MQ=255) aattaattAATGATTGTTATAAAAAATCTCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtcattcat > 1:13040042/1‑101 (MQ=255) aattaattAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtcattcat > 1:7730570/1‑101 (MQ=255) attaattaATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATc > 1:6308478/1‑101 (MQ=255) attaattaATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATc < 1:14253946/101‑1 (MQ=255) attaattaATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATc > 1:8072984/1‑101 (MQ=255) ttaattaaTGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCt > 1:5726041/1‑101 (MQ=255) taattaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTg > 1:8195487/1‑101 (MQ=255) aattaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGc > 1:13124297/1‑101 (MQ=255) aattaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGc > 1:1134155/1‑101 (MQ=255) aattaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGc < 1:3655836/101‑1 (MQ=255) attaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAGGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCa > 1:7972792/1‑101 (MQ=255) attaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCa > 1:7092266/1‑101 (MQ=255) taatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATa > 1:242231/1‑101 (MQ=255) aatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAGGAAATTGCTTGCGACGCAATTCATTTGCATaa > 1:6935802/1‑101 (MQ=255) aatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATaa > 1:10029827/1‑101 (MQ=255) atGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAg > 1:7013703/1‑101 (MQ=255) atGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAg < 1:11179584/101‑1 (MQ=255) atGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAg > 1:2491616/1‑101 (MQ=255) gATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGc < 1:11858332/101‑1 (MQ=255) ttGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCa < 1:7528640/101‑1 (MQ=255) tGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCAc > 1:7153702/1‑101 (MQ=255) tGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCAc < 1:1874753/101‑1 (MQ=255) gTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACt > 1:125609/1‑101 (MQ=255) ttATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACta > 1:10102258/1‑101 (MQ=255) tataAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtat > 1:8890847/1‑101 (MQ=255) ataAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtatt < 1:13458062/101‑1 (MQ=255) ataAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtatt > 1:14168518/1‑101 (MQ=255) taAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtatta > 1:6117015/1‑101 (MQ=255) aaaaaaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtattat > 1:2771946/1‑101 (MQ=255) aaaaaaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtattat > 1:3574735/1‑101 (MQ=255) aaaaaaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTAATCTGAATAAGGCCACtattat > 1:5972151/1‑101 (MQ=255) aaaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGaa > 1:1636021/1‑101 (MQ=255) aaaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGaa < 1:937952/101‑1 (MQ=255) cTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGt > 1:4157387/1‑101 (MQ=255) cTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGt > 1:2292624/1‑101 (MQ=255) cTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGt < 1:3780947/101‑1 (MQ=255) tGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaa > 1:823026/1‑101 (MQ=255) gTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaa > 1:13812754/1‑101 (MQ=255) tATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaaa > 1:910727/1‑101 (MQ=255) gtgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAcc < 1:4267502/101‑1 (MQ=255) gtgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAcc < 1:8740230/101‑1 (MQ=255) gtgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAcc > 1:6299460/1‑101 (MQ=255) aTCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCTc > 1:7556335/1‑101 (MQ=255) | GTCCAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCCAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCTC > NC_007779/1170475‑1170670 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |