| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 380484 = | NA (NA) | 236 (0.840) | 121/180 | NT | NA | intergenic (‑418/‑46) | yaiO/insC | hypothetical protein/IS2 insertion element repressor InsA |
| ? | NC_007779 | = 381407 | NA (NA) | coding (510/906 nt) | insD | IS2 insertion element transposase InsAB' | |||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
TGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/380573‑380484‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATCACAGCAGTCCAGCGCGAACGTGACACGCAGTCTCTCTCCGTTATCACAG < NC_007779/381407‑381308 TGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGA > 1:13165673/1‑101 GTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAA < 1:12394591/101‑1 TTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAG < 1:284140/101‑1 TCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGC < 1:8438662/101‑1 CTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCC > 1:12911572/1‑101 CTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCC < 1:7692729/101‑1 CTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCC > 1:515314/1‑101 TCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCG > 1:2214687/1‑101 AATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCG < 1:6955659/101‑1 TGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGT > 1:7283640/1‑101 TAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTG < 1:4033894/101‑1 AGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGA > 1:4375572/1‑101 AGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGA < 1:960093/101‑1 AGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGA > 1:3489685/1‑101 AGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCT‑GAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGAC < 1:3374519/101‑1 TCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACC > 1:6777537/1‑101 TCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACC > 1:13993323/1‑101 CTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCG < 1:11955718/101‑1 TAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGC > 1:2513640/1‑101 AAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCC > 1:3864327/1‑101 AAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCC > 1:688209/1‑101 AAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCC < 1:13309651/101‑1 AAACTAGTATTAAGACTATCCCTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCA < 1:5272920/101‑1 AACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAG > 1:972671/1‑101 TAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGCTTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGC < 1:10355332/101‑1 TAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGC > 1:6996147/1‑101 TAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGC > 1:8734128/1‑101 AGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCA > 1:12476394/1‑101 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CTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACG > 1:11263201/1‑101 TATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGA > 1:9537338/1‑101 TATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGA > 1:5611445/1‑101 TATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGA > 1:5676700/1‑101 ATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGAT < 1:11415561/101‑1 TCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATC < 1:425001/101‑1 ACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATCAC > 1:9311759/1‑101 CTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATCACA > 1:12319981/1‑101 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |