New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 3987186 = | NA (NA) | 238 (0.950) | 125/178 | NT | 100% | intergenic (‑732/‑31) | slp/insH | outer membrane lipoprotein/IS5 transposase and trans‑activator |
? | NC_007779 | = 4009203 | 0 (0.000) | coding (1379/1623 nt) | yhiJ | hypothetical protein |
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
TGTTGAAAATAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGA > NC_007779/3987086‑3987278 | tGTTGAAAATAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTaa‑gg > 1:5099273/1‑101 (MQ=255) tGTTGAAAATAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTaa‑gg > 1:5197818/1‑101 (MQ=255) tGTTGAAAATAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTaa‑gg > 1:11394543/1‑101 (MQ=255) ttGAAAATAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTaa‑ggaa < 1:3379846/101‑1 (MQ=255) aaaaTAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGt > 1:3798878/1‑101 (MQ=255) tAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGa < 1:10800759/101‑1 (MQ=255) tAAACCTTCGATTTGCTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGa < 1:9540974/101‑1 (MQ=255) aaaCCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGaa < 1:3289150/101‑1 (MQ=255) aaCCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAAc > 1:5336414/1‑101 (MQ=255) aaCCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAAc < 1:7655557/101‑1 (MQ=255) aaCCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAAc > 1:7873201/1‑101 (MQ=255) aCCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACa < 1:9616426/101‑1 (MQ=255) ccTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACaa > 1:9035280/1‑101 (MQ=255) cTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAg < 1:8907518/101‑1 (MQ=255) cTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAg > 1:5753275/1‑101 (MQ=255) gATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTccc > 1:2260826/1‑101 (MQ=255) gATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTccc > 1:8801994/1‑101 (MQ=255) gATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTccc > 1:7436964/1‑101 (MQ=255) gATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTccc > 1:9104336/1‑101 (MQ=255) gtttgtttgGCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCt < 1:1324807/100‑1 (MQ=255) aTTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCt < 1:10789778/101‑1 (MQ=255) aTTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCt < 1:8634988/101‑1 (MQ=255) tttgtttgTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTg > 1:5634446/1‑101 (MQ=255) tttgtttgTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTg > 1:4858859/1‑101 (MQ=255) ttgtttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGa < 1:9387033/101‑1 (MQ=255) tgtttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTGACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGat < 1:6914697/101‑1 (MQ=255) tgtttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGat > 1:8592996/1‑101 (MQ=255) tgtttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGat < 1:3829933/101‑1 (MQ=255) tgtttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGat > 1:1206478/1‑101 (MQ=255) gtttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGata < 1:4154925/101‑1 (MQ=255) ttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATg > 1:6231507/1‑101 (MQ=255) tgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTAGGGGTAGGGGGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATga > 1:7236584/1‑101 (MQ=255) gtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATgag > 1:10264447/1‑101 (MQ=255) tCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATgaga < 1:1930802/101‑1 (MQ=255) tCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATgaga > 1:6738550/1‑101 (MQ=255) tCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATgaga < 1:5835180/101‑1 (MQ=255) cAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGTGAt < 1:12393575/101‑1 (MQ=255) aaGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATc > 1:1354141/1‑101 (MQ=255) aaGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATc < 1:12669630/101‑1 (MQ=255) gATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCAt > 1:5419030/1‑101 (MQ=255) gATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCAt < 1:286422/101‑1 (MQ=255) gATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCAt < 1:10028164/101‑1 (MQ=255) tGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTg > 1:1425394/1‑101 (MQ=255) tGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTg > 1:7932513/1‑101 (MQ=255) gTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGt > 1:695040/1‑101 (MQ=255) gTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGt < 1:2159209/101‑1 (MQ=255) ccATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCa < 1:824908/101‑1 (MQ=255) ccATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCa < 1:11946489/101‑1 (MQ=255) ccATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCa > 1:7272885/1‑101 (MQ=255) ccATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTGTGTCa > 1:11161069/1‑101 (MQ=255) cATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCAt > 1:12392535/1‑101 (MQ=255) aTCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATc < 1:12387873/101‑1 (MQ=255) tCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCt < 1:8079252/101‑1 (MQ=255) tttATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTgg > 1:3957323/1‑101 (MQ=255) tatataATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTGA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAg < 1:760495/101‑1 (MQ=255) tatataATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAg < 1:11523313/101‑1 (MQ=255) tataATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGcc < 1:7036409/101‑1 (MQ=255) taATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCAt > 1:11606705/1‑101 (MQ=255) aaTTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATa > 1:10291471/1‑101 (MQ=255) aaTTTGGGGGTAGGGCGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATa < 1:11735116/101‑1 (MQ=255) aTTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGGGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAg < 1:1807950/101‑1 (MQ=255) tttGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGa < 1:1490177/101‑1 (MQ=255) ttGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGaa < 1:11465528/101‑1 (MQ=255) ttGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGaa < 1:3079385/101‑1 (MQ=255) tGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAAc < 1:3679453/101‑1 (MQ=255) tGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAAc > 1:2709634/1‑101 (MQ=255) gggggTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACa < 1:10538327/101‑1 (MQ=255) gggggTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACa > 1:9816897/1‑101 (MQ=255) gggTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAgg < 1:1696079/101‑1 (MQ=255) gggTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAgg < 1:814214/101‑1 (MQ=255) gggTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAgg < 1:1262395/101‑1 (MQ=255) gaGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGGCCCCTAAGGGAGGGTGC‑AAAAAGGTCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGtt < 1:7162345/100‑1 (MQ=18) aGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTtc > 1:4735937/1‑101 (MQ=255) gggTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTtca > 1:9708929/1‑101 (MQ=255) gtTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAAGAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTcatcat > 1:3604276/1‑101 (MQ=255) tCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGa > 1:201377/1‑101 (MQ=255) cTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAg > 1:3037863/1‑101 (MQ=255) cTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAg < 1:12273907/101‑1 (MQ=255) cTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAg < 1:6097912/101‑1 (MQ=255) tttATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGt < 1:2020958/101‑1 (MQ=255) tttATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGt < 1:12226888/101‑1 (MQ=255) tATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGtca > 1:4473938/1‑101 (MQ=255) tATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGtca > 1:6604479/1‑101 (MQ=255) aTGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGtcat > 1:10195875/1‑101 (MQ=255) aTGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGtcat < 1:9361082/101‑1 (MQ=255) gTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGtcatca > 1:1878278/1‑101 (MQ=255) gTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGtcatca > 1:4490348/1‑101 (MQ=255) aaaaTAGTGTCACGTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTa < 1:10597563/101‑1 (MQ=255) aaaTAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTAc > 1:11085677/1‑101 (MQ=39) aTAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCt > 1:4269118/1‑101 (MQ=37) aTAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCt < 1:7969365/101‑1 (MQ=37) aGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTc < 1:1740275/101‑1 (MQ=34) gtgtCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCg > 1:6515072/1‑101 (MQ=33) tgtCACCTAA‑GGAAGATGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGc < 1:4066889/101‑1 (MQ=17) gtCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGcc < 1:6166605/101‑1 (MQ=32) gtCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGcc > 1:2537582/1‑101 (MQ=32) cACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGa > 1:8484815/1‑101 (MQ=11) cACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGa > 1:8428295/1‑101 (MQ=11) cACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGa > 1:7063738/1‑101 (MQ=11) cACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAAAAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGa > 1:4651604/1‑101 (MQ=11) | TGTTGAAAATAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAA‑GGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGA > NC_007779/3987086‑3987278 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |