| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 608570 | NA (NA) | 243 (1.000) | 125/174 | NT | 97.7% | intergenic (+170/+112) | insL/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex |
| ? | NC_007779 | 1305025 = | 6 (0.020) | coding (413/921 nt) | oppB | oligopeptide transporter subunit | |||||
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
ACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATggg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/608471‑608570‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTA > NC_007779/1305025‑1305126 ACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 1:2659954/1‑101ACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 1:2979688/101‑1ACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 1:5637158/1‑101ACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 1:6600959/1‑101 AGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG > 1:2712840/1‑101 AGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG < 1:3307437/101‑1 AGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG < 1:11872998/101‑1 AGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG > 1:10990603/1‑101 AGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG < 1:9954116/101‑1 AGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG > 1:9125259/1‑101 GCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGT > 1:1812416/1‑101 GCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGT < 1:6412609/101‑1 CCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTT < 1:8028853/101‑1 CTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTG > 1:10206969/1‑101 CTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTG < 1:1702264/101‑1 CTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTG > 1:5249896/1‑101 CTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTG < 1:8285685/101‑1 CAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTA < 1:5283999/101‑1 AAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTAT < 1:7099463/101‑1 AAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTAT < 1:4799630/101‑1 CGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCC > 1:11276370/1‑101 GCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCA < 1:6203945/101‑1 GCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCA > 1:4918753/1‑101 CAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAG < 1:3866806/101‑1 ATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTT < 1:947821/101‑1 ATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTT < 1:1958508/101‑1 ATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTT > 1:12186899/1‑101 TGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTT < 1:4031421/101‑1 AGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTG < 1:8914591/101‑1 AGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTG < 1:9785801/101‑1 GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGG < 1:1184292/101‑1 ACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTT < 1:6332471/101‑1 CGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTG > 1:4204860/1‑101 CGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTG < 1:6002985/101‑1 GCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGGGTGGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGGGGTTGC > 1:2245600/1‑101 GAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCAC > 1:8992524/1‑101 AGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACC > 1:4755125/1‑101 GCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCAT > 1:5004253/1‑101 ATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTA < 1:3924160/101‑1 ATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCCTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTA > 1:8773929/1‑101 GTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTA > 1:12490914/1‑101 GTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTA > 1:12116365/1‑101 CTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGT < 1:10573361/101‑1 AACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCAT > 1:1235098/1‑101 AACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCAT < 1:11733169/101‑1 ACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATG < 1:2019995/101‑1 CGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGA > 1:12733467/1‑101 CGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGA < 1:7654284/101‑1 GAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGAT > 1:12292951/1‑101 GAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGAT > 1:7185640/1‑101 GAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGAT < 1:10103357/101‑1 AGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATA < 1:10821910/101‑1 GGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATAT > 1:8534186/1‑101 GCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATT < 1:9645877/101‑1 ACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTG > 1:5119882/1‑101 GAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGACATGATATTTGCGA < 1:7723851/101‑1 GGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATC < 1:1363092/101‑1 GCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCA < 1:4616837/101‑1 GCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCA > 1:9576942/1‑101 CGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCAT > 1:142952/1‑101 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CATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGC < 1:576336/101‑1 CATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGC > 1:7583975/1‑101 ATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCA < 1:6873407/101‑1 TTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATGCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCAT > 1:12094020/1‑101 TCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATT < 1:355047/101‑1 CTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTG > 1:1887088/1‑101 TTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGG < 1:10349512/101‑1 TCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGC < 1:4310018/101‑1 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ACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATggg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/608471‑608570‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGTTGTTATCCCCAGTTTTGTGGTTGCACCATTATTAGTCATGATATTTGCGATCATTTTGCATTGGCTGCCGGGCGGTGGCTGGAATGGTGGGGCGCTTA > NC_007779/1305025‑1305126 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |