New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 2178209 = | 0 (0.000) | 251 (1.000) | 139/180 | NT | 100% | intergenic (+178/+184) | insH/gatZ | IS5 element protein/D‑tagatose 1,6‑bisphosphate aldolase 2, subunit |
? | NC_007779 | = 2412225 | NA (NA) | intergenic (‑55/‑782) | insA/yfbQ | IS1 element protein/aminotransferase |
Only 100 of 341 total aligned reads displayed.
ATGCTCGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/2178308‑2178209 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC < NC_007779/2412225‑2412126 TCGCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGA > 1:8871636/1‑101 GCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATG > 1:5539741/1‑101 GCCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATG < 1:8516948/101‑1 CCAAAGGTGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGC < 1:10626442/101‑1 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TGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAAC < 1:8669045/101‑1 TGTGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAAC > 1:1977839/1‑101 TGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTT < 1:10691004/101‑1 TGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTT > 1:11821457/1‑101 TGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTT > 1:7122524/1‑101 TGGTTCATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTT > 1:3439176/1‑101 TGGTACATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTT < 1:2464085/101‑1 CATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA < 1:1817875/101‑1 CATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA < 1:5336061/101‑1 CATGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA > 1:2924787/1‑101 TGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:4130150/101‑1 TGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:6844194/101‑1 TGATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:9961241/101‑1 GATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAGTTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT > 1:11316232/1‑101 GATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT > 1:7684205/1‑101 ATACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 1:2679016/1‑101 ACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT > 1:6418008/1‑101 ACCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT > 1:4868717/1‑101 CCTGGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 1:7587962/1‑101 GGCCACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT > 1:5758632/1‑101 ACAGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 1:9416635/101‑1 AGGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT > 1:3649122/1‑101 GGCATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTAAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG > 1:9918113/1‑101 ATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 1:5291958/101‑1 ATTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT > 1:10465421/1‑101 TTAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT > 1:10783570/1‑101 TAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT > 1:5193427/1‑101 TAATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 1:1006310/101‑1 AATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG < 1:12076250/101‑1 ATTGCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA > 1:1325491/1‑101 GCCAGAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGg > 1:4308586/1‑100 GAGAAGCAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTC > 1:4789539/1‑101 CAGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG > 1:6353898/1‑101 AGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC > 1:9579406/1‑101 AGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC < 1:7330181/101‑1 AGAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC < 1:3521977/101‑1 GAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT > 1:6984980/1‑101 GAATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT < 1:5494832/101‑1 AATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT > 1:2536807/1‑101 AATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT > 1:2373417/1‑101 ATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTC < 1:1761903/101‑1 ATTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTC < 1:12627528/101‑1 TTCCCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCT < 1:12253760/101‑1 CCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT > 1:10343854/1‑101 CCTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCCCCAGTGGCTTCTGTT > 1:745982/1‑101 CTACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT < 1:10241175/101‑1 TACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTC < 1:6534383/101‑1 ACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT > 1:9112596/1‑101 ACCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT < 1:11419888/101‑1 CCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA > 1:11103023/1‑101 CCGGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA > 1:5055869/1‑101 GGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATC > 1:9728270/1‑101 GGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATC > 1:7190807/1‑101 GGGATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATC < 1:5997101/101‑1 GATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG > 1:8296235/1‑101 ATAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC > 1:861593/1‑101 TAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT < 1:809688/101‑1 TAATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT < 1:11956757/101‑1 ATGCTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT < 1:4084756/101‑1 CTTGAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC < 1:8427893/101‑1 GAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC < 1:11058755/101‑1 GAGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC < 1:12047584/101‑1 AGCAGCACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT < 1:7805185/101‑1 tgtgcaTATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTC > 1:11561067/7‑101 gtgcaTATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCA > 1:3775414/6‑101 CACGCTATTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCA > 1:10891905/1‑101 tgcaTATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAG < 1:6183897/97‑1 tgcaTATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAG > 1:3295967/5‑101 ctacctggGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAG < 1:4437746/93‑1 tacctggGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGC < 1:4014528/94‑1 caTATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCT < 1:3026784/99‑1 caTATGGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCT > 1:8344832/3‑101 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |