| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_007779 | 569,996 | G→C | 100% | intergenic (+345/‑120) | ybcK → / → ybcL | recombinase/kinase inhibitor |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 569,996 | 0 | G→C | 100.0% | 956.3 | 220 | intergenic (+345/‑120) | ybcK/ybcL | recombinase/kinase inhibitor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (112/108): ref base (0/0): total (112/108) | ||||||||||
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
TTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGAT > NC_007779/569898‑570093 | ttGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGCCa > 1:6334094/1‑101 (MQ=255) tGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGCCaa > 1:10945320/1‑101 (MQ=255) gAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGGGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGCCaaa > 1:7562163/1‑101 (MQ=255) ggTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGCCAaataat > 1:3729863/1‑101 (MQ=255) gTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGCCAAATAAttgggt > 1:5425183/1‑101 (MQ=255) ttAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGGTAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGCCAAATAAttgggtt > 1:8226145/1‑101 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |