| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_007779 | 274,733 | Δ97,240 bp | 100% | [mmuP]–[mhpD] | 90 genes [mmuP], mmuM, afuC, afuB, insB, insA, ykgN, yagB, yagA, yagE, yagF, yagG, yagH, yagI, argF, insB, insA, yagJ, yagK, yagL, yagM, yagN, intF, yagP, yagQ, yagR, yagS, yagT, yagU, ykgJ, yagV, yagW, yagX, yagY, yagZ, ykgK, ykgL, Y75_p4288, Y75_p4289, eaeH, insE, insF, ykgA, ykgB, ykgI, ykgC, ykgD, ykgE, ykgF, ykgG, ykgH, betA, betB, betI, betT, yahA, yahB, yahC, yahD, yahE, yahF, yahG, yahH, yahI, yahJ, yahK, yahL, yahM, yahN, yahO, prpR, prpB, prpC, prpD, prpE, codB, codA, cynR, cynT, cynS, cynX, lacA, lacY, lacZ, lacI, mhpR, mhpA, mhpB, mhpC, [mhpD] |
|
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_007779 | 274733 | 371972 | 97240 | 301 [0] | [0] 299 | [mmuP]–[mhpD] | 90 genes [mmuP], mmuM, afuC, afuB, insB, insA, ykgN, yagB, yagA, yagE, yagF, yagG, yagH, yagI, argF, insB, insA, yagJ, yagK, yagL, yagM, yagN, intF, yagP, yagQ, yagR, yagS, yagT, yagU, ykgJ, yagV, yagW, yagX, yagY, yagZ, ykgK, ykgL, Y75_p4288, Y75_p4289, eaeH, insE, insF, ykgA, ykgB, ykgI, ykgC, ykgD, ykgE, ykgF, ykgG, ykgH, betA, betB, betI, betT, yahA, yahB, yahC, yahD, yahE, yahF, yahG, yahH, yahI, yahJ, yahK, yahL, yahM, yahN, yahO, prpR, prpB, prpC, prpD, prpE, codB, codA, cynR, cynT, cynS, cynX, lacA, lacY, lacZ, lacI, mhpR, mhpA, mhpB, mhpC, [mhpD] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 274732 | 0 (0.000) | 227 (0.880) | 124/160 | NT | 100% | coding (184/1404 nt) | mmuP | S‑methylmethionine transporter |
| ? | NC_007779 | 371973 = | 0 (0.000) | coding (635/810 nt) | mhpD | 2‑keto‑4‑pentenoate hydratase | |||||
Only 100 of 299 total aligned reads displayed.
AAAACTGCGCCATGAAGATGACGCGTAATAACGAAGAGGTTTCTAGCGGGCGCGGCAGCGAATGCCTGGGACATCCGCTTAATGCGGCCGTCTGGCTGGCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGTTTT > NC_007779/371874‑372073 | gcacaggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggcggtctggctggCa > 1:11313397‑M2/100‑101 (MQ=255) cacaggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcggggacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCAc > 1:11398680‑M2/99‑101 (MQ=255) cacaggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCAc < 1:3923755‑M2/3‑1 (MQ=255) acaggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACg > 1:8916457‑M2/98‑101 (MQ=255) caggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGc > 1:10397196‑M2/97‑101 (MQ=255) attattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCcaaa > 1:1584739‑M2/93‑101 (MQ=255) attattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCaaaa < 1:8370014‑M2/9‑1 (MQ=255) attattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCaaaa < 1:11057182‑M2/9‑1 (MQ=255) ttattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAAt > 1:7287356‑M2/92‑101 (MQ=255) ttcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGc < 1:12636072‑M2/13‑1 (MQ=255) tcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGcc > 1:14186315‑M2/88‑101 (MQ=255) cttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaaagctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCa > 1:5962761‑M2/87‑101 (MQ=255) ttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgatggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGt < 1:10003565‑M2/17‑1 (MQ=255) tcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGt > 1:5003437‑M2/85‑101 (MQ=255) tcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGt > 1:8991483‑M2/85‑101 (MQ=255) ataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTg > 1:6785604‑M2/82‑101 (MQ=255) taccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaaccctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTgg > 1:14000433‑M2/81‑101 (MQ=255) accgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTggg < 1:8462984‑M2/22‑1 (MQ=255) accgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTggg > 1:4526429‑M2/80‑101 (MQ=255) accgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTggg > 1:13000590‑M2/80‑101 (MQ=255) accgggtacatcatttccaccactggagcggcggcaacgctgctggcctatctgattggggcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTggg > 1:9268421‑M2/80‑101 (MQ=255) cgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTg > 1:6081823‑M2/78‑101 (MQ=255) cgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTg < 1:6889957‑M2/24‑1 (MQ=255) cgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTg < 1:14216962‑M2/24‑1 (MQ=255) gggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGa > 1:9710459‑M2/77‑101 (MQ=255) tacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatttgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATAGCCAGTCTGGGGGAAcc > 1:5463131‑M2/74‑101 (MQ=255) tacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAAcc < 1:9632408‑M2/28‑1 (MQ=255) acatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCg > 1:9141600‑M2/73‑101 (MQ=255) tcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTg < 1:13617195‑M2/32‑1 (MQ=255) tcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGGGAACCCCTg > 1:5533857‑M2/70‑101 (MQ=255) catttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTgc < 1:8898508‑M2/33‑1 (MQ=255) tttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTgcgc < 1:2907101‑M2/35‑1 (MQ=255) ttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCa > 1:12168285‑M2/66‑101 (MQ=255) tccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCAc > 1:368090‑M2/65‑101 (MQ=255) caccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCg < 1:8490988‑M2/39‑1 (MQ=255) ccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGga < 1:13152051‑M2/41‑1 (MQ=255) ccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGga > 1:1158625‑M2/61‑101 (MQ=255) actggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGgaga < 1:815347‑M2/43‑1 (MQ=255) actggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGgaga > 1:5149595‑M2/59‑101 (MQ=255) actggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGgaga < 1:11980948‑M2/43‑1 (MQ=255) ctggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGat < 1:12577069‑M2/44‑1 (MQ=255) tggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGata < 1:13739026‑M2/45‑1 (MQ=255) tggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGata > 1:13452617‑M2/57‑101 (MQ=255) agcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCa < 1:4060360‑M2/48‑1 (MQ=255) agcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGGGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCa > 1:2106521‑M2/54‑101 (MQ=255) agcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtgggctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCa > 1:11240831‑M2/54‑101 (MQ=255) cggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCAtt > 1:14346561‑M2/52‑101 (MQ=255) ggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTc < 1:3549361‑M2/51‑1 (MQ=255) gcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCt > 1:2480405‑M2/50‑101 (MQ=255) gcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCt < 1:10751126‑M2/52‑1 (MQ=255) cgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCtt < 1:10961425‑M2/53‑1 (MQ=255) acgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCgg > 1:1871667‑M2/44‑101 (MQ=255) acgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCgg > 1:7684118‑M2/44‑101 (MQ=255) gctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCgggg > 1:13518194‑M2/42‑101 (MQ=255) gctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCgggg > 1:4470994‑M2/42‑101 (MQ=255) 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ggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGc < 1:3227771‑M2/79‑1 (MQ=255) cgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTg > 1:1113227‑M2/19‑101 (MQ=255) gctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGa > 1:7443863‑M2/18‑101 (MQ=255) ctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGaa > 1:3046411‑M2/17‑101 (MQ=255) ggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATg < 1:6194042‑M2/87‑1 (MQ=255) ggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATg < 1:2231629‑M2/87‑1 (MQ=255) gtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTGTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGc < 1:12762074‑M2/88‑1 (MQ=255) gtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGc < 1:2010827‑M2/88‑1 (MQ=255) tggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCGTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCg > 1:10215049‑M2/13‑101 (MQ=255) ggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCgg < 1:7184866‑M2/90‑1 (MQ=255) ggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCgg < 1:6601948‑M2/90‑1 (MQ=255) gtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGTggg < 1:13204411‑M2/91‑1 (MQ=255) tctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGc < 1:10369403‑M2/92‑1 (MQ=255) tctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGc < 1:11228917‑M2/92‑1 (MQ=255) tggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGa > 1:11536360‑M2/8‑101 (MQ=255) tggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGa < 1:9398467‑M2/94‑1 (MQ=255) gctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATc < 1:8248038‑M2/96‑1 (MQ=255) ctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCg < 1:13695841‑M2/97‑1 (MQ=255) ctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCg > 1:5780367‑M2/5‑101 (MQ=255) tggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGt > 1:9343192‑M2/4‑101 (MQ=255) ggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGtt < 1:13911883‑M2/99‑1 (MQ=255) gCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGttt < 1:7944398‑M2/100‑1 (MQ=255) gCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGttt < 1:6527237‑M2/100‑1 (MQ=255) cACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGtttt < 1:5676223/101‑1 (MQ=255) | AAAACTGCGCCATGAAGATGACGCGTAATAACGAAGAGGTTTCTAGCGGGCGCGGCAGCGAATGCCTGGGACATCCGCTTAATGCGGCCGTCTGGCTGGCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGTTTT > NC_007779/371874‑372073 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |