Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA NC_007779 1,170,573 C→T 100% intergenic (‑164/‑77) ycfQ ← / → ycfR DNA‑binding transcriptional regulator/hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position change freq score reads annotation genes product
*NC_0077791,170,5730C→T100.0% 1163.6 278intergenic (‑164/‑77)ycfQ/ycfRDNA‑binding transcriptional regulator/hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  new base (171/107):  ref base (0/0):  total (171/107)

Only 100 of 279 total aligned reads displayed.

GTCCAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCCAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCTC  >  NC_007779/1170475‑1170670
                                                                                                  |                                                                                                 
  ccAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGAt                                                                                               <  1:3871435/101‑1 (MQ=255)
   cAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATc                                                                                              >  1:9167741/1‑101 (MQ=255)
   cAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATc                                                                                              >  1:10502052/1‑101 (MQ=255)
    aGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATca                                                                                             >  1:5655749/1‑101 (MQ=255)
      aTCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATcaca                                                                                           <  1:3399542/101‑1 (MQ=255)
       tCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACAt                                                                                          <  1:471320/101‑1 (MQ=255)
        cccATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATc                                                                                         >  1:11269864/1‑101 (MQ=255)
        cccATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATc                                                                                         >  1:2085337/1‑101 (MQ=255)
           aTAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTAt                                                                                      >  1:10682296/1‑101 (MQ=255)
            tAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATc                                                                                     >  1:2242948/1‑101 (MQ=255)
            tAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATc                                                                                     <  1:6512219/101‑1 (MQ=255)
             aaaaaTAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCa                                                                                    <  1:3773073/101‑1 (MQ=255)
             aaaaaTAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCa                                                                                    >  1:4047537/1‑101 (MQ=255)
                aataatTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCAttt                                                                                 >  1:9564400/1‑101 (MQ=255)
                aataatTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCAttt                                                                                 >  1:7133706/1‑101 (MQ=255)
                aataatTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCAttt                                                                                 <  1:4266266/101‑1 (MQ=255)
                aataatTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCAttt                                                                                 >  1:7172119/1‑101 (MQ=255)
                 ataatTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTa                                                                                >  1:1294002/1‑101 (MQ=255)
                   aatTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGt                                                                              >  1:8460697/1‑101 (MQ=255)
                    atTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATGACATCTATCATTTAGtt                                                                             >  1:14270407/1‑101 (MQ=255)
                      tGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTat                                                                           >  1:3770464/1‑101 (MQ=255)
                      tGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTat                                                                           <  1:7453441/101‑1 (MQ=255)
                        cTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatcg                                                                         <  1:8643609/101‑1 (MQ=255)
                        cTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatcg                                                                         <  1:1747651/101‑1 (MQ=255)
                           tCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatcgatc                                                                      <  1:8578401/101‑1 (MQ=255)
                            cTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTatcgatcg                                                                     >  1:3477644/1‑101 (MQ=255)
                             tATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGt                                                                    >  1:2151864/1‑101 (MQ=255)
                              aTTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGtt                                                                   <  1:11477464/101‑1 (MQ=255)
                              aTTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAAATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGtt                                                                   >  1:8175447/1‑101 (MQ=255)
                               tttAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTa                                                                  <  1:13369204/101‑1 (MQ=255)
                                ttAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTaa                                                                 <  1:4573823/101‑1 (MQ=255)
                                  aaCTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGt                                                               >  1:6056540/1‑101 (MQ=255)
                                   aCTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTa                                                              <  1:10409811/101‑1 (MQ=255)
                                   aCTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTa                                                              >  1:8982086/1‑101 (MQ=255)
                                    cTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTaa                                                             <  1:8870245/101‑1 (MQ=255)
                                    cTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTaa                                                             <  1:3099945/101‑1 (MQ=255)
                                     tGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAt                                                            >  1:11765047/1‑101 (MQ=255)
                                     tGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAt                                                            >  1:12656837/1‑101 (MQ=255)
                                     tGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAt                                                            <  1:2182667/101‑1 (MQ=255)
                                       aaaTTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAttg                                                          <  1:13976334/101‑1 (MQ=255)
                                       aaaTTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAttg                                                          <  1:8378567/101‑1 (MQ=255)
                                        aaTTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAttgc                                                         >  1:11992689/1‑101 (MQ=255)
                                        aaTTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAttgc                                                         >  1:13775234/1‑101 (MQ=255)
                                            tAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAAttgcttgc                                                     >  1:6412391/1‑101 (MQ=255)
                                               aGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGAc                                                  >  1:14459480/1‑101 (MQ=255)
                                               aGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGAc                                                  >  1:13858559/1‑101 (MQ=255)
                                                gATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACg                                                 <  1:9415068/101‑1 (MQ=255)
                                                gATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACg                                                 <  1:10251408/101‑1 (MQ=255)
                                                 aTTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGt                                                >  1:8295114/1‑101 (MQ=255)
                                                   ttttAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGAACACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtca                                              >  1:11404302/1‑101 (MQ=255)
                                                     ttAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtcatt                                            >  1:1207983/1‑101 (MQ=255)
                                                      tAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtcattc                                           >  1:7815605/1‑101 (MQ=255)
                                                      tAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtcattc                                           >  1:1990867/1‑101 (MQ=255)
                                                       aaaTTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGtcattca                                          >  1:14324863/1‑101 (MQ=255)
                                                         attaattaATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATc                                        >  1:7399865/1‑101 (MQ=255)
                                                         attaattaATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATc                                        <  1:14472084/101‑1 (MQ=255)
                                                            aattaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGc                                     >  1:6993432/1‑101 (MQ=255)
                                                            aattaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGc                                     <  1:7895825/101‑1 (MQ=255)
                                                            aattaatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGc                                     >  1:9327030/1‑101 (MQ=255)
                                                               taatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATa                                  <  1:8252212/101‑1 (MQ=255)
                                                               taatGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATa                                  >  1:7305049/1‑101 (MQ=255)
                                                                aatttttGTTATAAAAAATATTTTTTATGTGATCTAGATAATATTTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATaa                                 <  1:8718984/96‑1 (MQ=255)
                                                                  tGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAgg                               >  1:2434422/1‑101 (MQ=255)
                                                                  tGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAgg                               >  1:2288361/1‑101 (MQ=255)
                                                                   gATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGc                              >  1:2715114/1‑101 (MQ=255)
                                                                   gATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGc                              >  1:9254885/1‑101 (MQ=255)
                                                                   gATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGc                              >  1:10782033/1‑101 (MQ=255)
                                                                    aTTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGcc                             >  1:9784160/1‑101 (MQ=255)
                                                                     ttGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCa                            <  1:6164223/101‑1 (MQ=255)
                                                                      tGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCAc                           <  1:10887984/101‑1 (MQ=255)
                                                                      tGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCAc                           <  1:7479433/101‑1 (MQ=255)
                                                                      tGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCAc                           >  1:4411586/1‑101 (MQ=255)
                                                                      tGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCAc                           >  1:13306123/1‑101 (MQ=255)
                                                                         tataAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtat                        >  1:6790278/1‑101 (MQ=255)
                                                                         tataAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtat                        >  1:5949728/1‑101 (MQ=255)
                                                                         tataAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtat                        >  1:12248979/1‑101 (MQ=255)
                                                                          ataAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtatt                       >  1:9716945/1‑101 (MQ=255)
                                                                          ataAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtatt                       <  1:13196532/101‑1 (MQ=255)
                                                                           taAAAAATATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtatta                      >  1:11455629/1‑101 (MQ=255)
                                                                            aaaaaaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtattat                     >  1:6005803/1‑101 (MQ=255)
                                                                            aaaaaaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACtattat                     <  1:503535/101‑1 (MQ=255)
                                                                             aaaaaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATg                    >  1:4780138/1‑101 (MQ=255)
                                                                              aaaaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGa                   <  1:6637668/101‑1 (MQ=255)
                                                                                aaTATCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGaaa                 <  1:10093988/101‑1 (MQ=255)
                                                                                 atatCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGaaaa                <  1:12302639/101‑1 (MQ=255)
                                                                                 atatCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAACTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGaaaa                >  1:13076505/1‑101 (MQ=255)
                                                                                  tatCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGaaaaa               <  1:6545790/101‑1 (MQ=255)
                                                                                   atCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAAc              >  1:13582251/1‑101 (MQ=255)
                                                                                   atCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAAc              >  1:6686058/1‑101 (MQ=255)
                                                                                    tCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACg             <  1:11558923/101‑1 (MQ=255)
                                                                                     cTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGt            >  1:1525274/1‑101 (MQ=255)
                                                                                     cTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGt            >  1:8937256/1‑101 (MQ=255)
                                                                                         tATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaaa        >  1:3353546/1‑101 (MQ=255)
                                                                                          aTGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaaaa       >  1:3562665/1‑101 (MQ=255)
                                                                                          aTGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaaaa       <  1:4453078/101‑1 (MQ=255)
                                                                                           tgtgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAc      >  1:3716173/1‑101 (MQ=255)
                                                                                           tgtgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAc      <  1:9138429/101‑1 (MQ=255)
                                                                                             tgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAccc    >  1:8111964/1‑101 (MQ=255)
                                                                                              gATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCt   >  1:5346128/1‑101 (MQ=255)
                                                                                               aTCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCTc  >  1:4367023/1‑101 (MQ=255)
                                                                                                  |                                                                                                 
GTCCAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCCAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCTC  >  NC_007779/1170475‑1170670

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.