New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 1907288 | 11 (0.040) | 223 (0.890) | 124/180 | NT | 95.3% | intergenic (+315/‑114) | yobD/yebN | inner membrane protein/inner membrane protein |
? | NC_007779 | 2411458 = | NA (NA) | intergenic (‑147/+15) | lrhA/insB | DNA‑binding transcriptional repressor/IS1 element protein |
Only 100 of 309 total aligned reads displayed.
ACACACAAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > NC_007779/2411359‑2411557 | acacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTa < 1:6057182/101‑1 (MQ=255) acacaAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTa > 1:1356473/1‑101 (MQ=255) aaacaaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGa < 1:4234148/101‑1 (MQ=255) aacaaGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGAc > 1:8498962/1‑101 (MQ=255) aGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCa < 1:2822592/101‑1 (MQ=255) aGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCa < 1:10602924/101‑1 (MQ=255) ttCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTa < 1:9678245/101‑1 (MQ=255) tttGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGAt < 1:1104301/101‑1 (MQ=255) ttGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATa > 1:2272548/1‑101 (MQ=255) gTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgt > 1:9404068/1‑101 (MQ=255) tAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgtg > 1:4604091/1‑101 (MQ=255) aaTGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAgtgt > 1:8629260/1‑101 (MQ=255) gtgCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGtttt > 1:9080007/1‑101 (MQ=255) gtgCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGtttt < 1:10694928/101‑1 (MQ=255) tgCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTa > 1:9255403/1‑101 (MQ=255) tgCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTa > 1:3047790/1‑101 (MQ=255) gCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAt < 1:4311234/101‑1 (MQ=255) ccTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATg > 1:2210323/1‑101 (MQ=255) ccTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATg < 1:1448705/101‑1 (MQ=255) tCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGtt < 1:3715351/101‑1 (MQ=255) ccTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCa > 1:12035256/1‑101 (MQ=255) cTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAg < 1:10013275/101‑1 (MQ=255) cTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAg < 1:5704712/101‑1 (MQ=255) tGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGa > 1:589373/1‑101 (MQ=255) tGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGa > 1:5578146/1‑101 (MQ=255) tGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGa < 1:4674144/101‑1 (MQ=255) ggCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt > 1:6799638/1‑101 (MQ=255) ggCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt < 1:7444172/101‑1 (MQ=255) ggCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAt > 1:11404646/1‑101 (MQ=255) gCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATa < 1:3996102/101‑1 (MQ=255) gCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATa > 1:10536659/1‑101 (MQ=255) cAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATaa < 1:9042099/101‑1 (MQ=255) aGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt < 1:5159150/101‑1 (MQ=255) aGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt < 1:6368054/101‑1 (MQ=255) aGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt < 1:12649469/101‑1 (MQ=255) aGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAt < 1:1863765/101‑1 (MQ=255) tttCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGc < 1:10661612/101‑1 (MQ=255) gttCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGc < 1:3901735/100‑1 (MQ=255) ttCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGcc < 1:6225181/101‑1 (MQ=255) tCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGccc > 1:10409334/1‑101 (MQ=255) tCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGccc > 1:11568140/1‑101 (MQ=255) cATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCg < 1:4821489/101‑1 (MQ=255) aTCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGa > 1:5267148/1‑101 (MQ=255) tCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAt > 1:2446339/1‑101 (MQ=255) tCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAt < 1:6661010/101‑1 (MQ=255) ccGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATg < 1:3361093/101‑1 (MQ=255) ccGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGCGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATg > 1:2635982/1‑101 (MQ=255) gAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACt > 1:1305345/1‑101 (MQ=255) gAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACt < 1:12277670/101‑1 (MQ=255) aCCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACttt > 1:6607852/1‑101 (MQ=255) aCCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACttt > 1:5799594/1‑101 (MQ=255) aCCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACttt > 1:40369/1‑101 (MQ=255) cccGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTg > 1:11174942/1‑101 (MQ=255) cGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTc < 1:7151024/101‑1 (MQ=255) ggACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCa > 1:11699101/1‑101 (MQ=255) gACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAt > 1:2060615/1‑101 (MQ=255) cGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGc < 1:6516037/101‑1 (MQ=255) gAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCa < 1:3293104/101‑1 (MQ=255) aaaGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAg > 1:7729342/1‑101 (MQ=255) aaaGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAg < 1:6901029/101‑1 (MQ=255) aaGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGc > 1:4155499/1‑101 (MQ=255) aaGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGc > 1:1090225/1‑101 (MQ=255) gTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTc > 1:12347516/1‑101 (MQ=255) tAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTcc > 1:7042002/1‑101 (MQ=255) tAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTcc > 1:1548097/1‑101 (MQ=255) tAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTcc > 1:4433885/1‑101 (MQ=255) aaaaaTGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCa < 1:7976006/101‑1 (MQ=255) aaaTGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAcc > 1:884505/1‑101 (MQ=255) aaTGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCg < 1:6476486/101‑1 (MQ=255) aaTGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCg < 1:5319681/101‑1 (MQ=255) aTGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGa > 1:12504981/1‑101 (MQ=255) tGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGAGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAt > 1:11311269/1‑101 (MQ=255) gCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAtt > 1:8354357/1‑101 (MQ=255) gCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAtt > 1:5386809/1‑101 (MQ=255) cATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAttt < 1:3432084/101‑1 (MQ=255) cATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAttt > 1:12414820/1‑101 (MQ=255) cATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAttt < 1:9496096/101‑1 (MQ=255) atatGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAtttt > 1:3003300/1‑101 (MQ=255) atatGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAtttt > 1:10790141/1‑101 (MQ=255) tatGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTg > 1:1996182/1‑101 (MQ=255) atGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTga > 1:10933095/1‑101 (MQ=255) atGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTga > 1:1622700/1‑101 (MQ=255) atGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTga < 1:7543025/101‑1 (MQ=255) aGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGaa > 1:8710584/1‑101 (MQ=255) aGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGaa > 1:9832906/1‑101 (MQ=255) gTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAAc > 1:2968095/1‑101 (MQ=255) tGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGa > 1:7786846/1‑101 (MQ=255) cACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACa > 1:8018871/1‑101 (MQ=40) cACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACa < 1:3224435/101‑1 (MQ=40) cACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACa > 1:11860929/1‑101 (MQ=40) cACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACa > 1:6121117/1‑101 (MQ=40) aCTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAg < 1:10199028/101‑1 (MQ=40) cTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGc < 1:11607532/101‑1 (MQ=39) cTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTCTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGc < 1:8289323/101‑1 (MQ=255) tAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCg > 1:6090033/1‑101 (MQ=38) aaaaaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGa > 1:2716742/1‑101 (MQ=37) aaaaaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGAc > 1:3484793/1‑101 (MQ=35) aaGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTc < 1:9226855/101‑1 (MQ=32) aGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTcc > 1:4979625/1‑101 (MQ=31) gCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCg < 1:2838032/101‑1 (MQ=11) | ACACACAAACAAGCAATTCCATTTGTAATGTGCCTCCCTGGCAGTTTCATCCGGAACCCGGACGAAAGTAAAAATGCATATGAGTTGCACTAAAAAAGCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT > NC_007779/2411359‑2411557 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |