New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 2412224 | NA (NA) | 5 (0.020) | 5/178 | NT | 1.6% | intergenic (‑54/‑783) | insA/yfbQ | IS1 element protein/aminotransferase |
? | NC_007779 | = 2941546 | 315 (1.140) | intergenic (‑323/+28) | gcvA/ygdI | DNA‑binding transcriptional dual regulator/hypothetical protein |
Only 100 of 373 total aligned reads displayed.
GGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTA > NC_007779/2941446‑2941646 | ggTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGG < 1:7833466‑M2/101‑1 (MQ=255) gTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGt > 1:13896710/1‑101 (MQ=255) tCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTg < 1:1229210/101‑1 (MQ=255) CTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGc > 1:6146766‑M2/1‑101 (MQ=255) tGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑t > 1:4076795/1‑101 (MQ=255) cGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑ttt < 1:12107205/101‑1 (MQ=255) gATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑tttt > 1:9196849/1‑101 (MQ=255) gATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑tttt > 1:4230948/1‑101 (MQ=255) gATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑tttt > 1:11195393/1‑101 (MQ=255) aTTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTATTGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑ttttt > 1:3290985/1‑101 (MQ=255) aTTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑ttttt > 1:13975512/1‑101 (MQ=255) aTTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑ttttt > 1:2837916/1‑101 (MQ=255) aTTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑ttttt > 1:5421431/1‑101 (MQ=255) ttCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑tttttt > 1:11522866/1‑101 (MQ=255) ttCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑tttttt > 1:5704058/1‑101 (MQ=255) tCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑ttttttt > 1:13497905/1‑101 (MQ=255) aCCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGgtgatgctgccaac > 1:13287131‑M2/1‑87 (MQ=255) aCCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑tttttttacct > 1:3491144/1‑97 (MQ=255) ccATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCt > 1:2680838/1‑101 (MQ=255) ccATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCt > 1:6872248/1‑101 (MQ=255) aTGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTg > 1:9259257/1‑101 (MQ=255) ggTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCg < 1:7650059/101‑1 (MQ=255) aGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATc < 1:8568195/101‑1 (MQ=255) aGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATc < 1:12972065/101‑1 (MQ=255) aaaGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATcgcg > 1:10652035/1‑101 (MQ=255) aaaGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATcgcg > 1:7234131/1‑101 (MQ=255) aGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGaa > 1:6296798/1‑101 (MQ=255) gCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAAt > 1:12331197/1‑101 (MQ=255) tACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTa > 1:3393918/1‑101 (MQ=255) ccTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACt > 1:3372219/1‑101 (MQ=255) cTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCAGCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTg > 1:7538616/1‑101 (MQ=255) ttttttCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTTCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGa > 1:8969365/1‑101 (MQ=255) ttttttCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGa < 1:385281/101‑1 (MQ=255) ttttCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATc > 1:4760682/1‑101 (MQ=255) tttCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATcc > 1:970744/1‑101 (MQ=255) ttCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCa > 1:5767185/1‑101 (MQ=255) tCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAg < 1:3555503/101‑1 (MQ=255) cACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGt < 1:6563455/101‑1 (MQ=255) cACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGt < 1:5108166/101‑1 (MQ=255) atcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattacCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGt > 1:12457388‑M2/51‑101 (MQ=255) aCTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGtt > 1:816721/1‑101 (MQ=255) cTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTc > 1:5050686/1‑101 (MQ=255) ttCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCg > 1:6625279/1‑101 (MQ=255) tCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGa < 1:551634/101‑1 (MQ=255) cTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGAcc < 1:770361/101‑1 (MQ=255) gTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCAt > 1:2040981/1‑101 (MQ=255) tACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCAtc > 1:5828647/1‑101 (MQ=255) aCATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCAtct > 1:12524443/1‑101 (MQ=255) aCATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑ATTTTTTTACCTTGCAATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCAtct > 1:10003132/1‑101 (MQ=255) taTTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCAtctc < 1:670335/100‑1 (MQ=255) cATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCAtctc < 1:8463280/101‑1 (MQ=255) aTTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATctct > 1:13041352/1‑101 (MQ=255) aTTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATctct > 1:2935690/1‑101 (MQ=255) tttACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTTGGATCGCGAATTACTTATCCAGTTCGACCGtctcct > 1:10930249/1‑99 (MQ=255) tACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTc < 1:8278242/101‑1 (MQ=255) ctgtctgtCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGt < 1:5194125/101‑1 (MQ=255) tgtctgtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTc > 1:6190420/1‑101 (MQ=255) gtctgtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCa < 1:11129936/101‑1 (MQ=255) gtctgtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCa > 1:13760457/1‑101 (MQ=255) ctgtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGt > 1:1731551/1‑101 (MQ=255) ctgtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGt > 1:10031082/1‑101 (MQ=255) tgtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTa < 1:7894786/101‑1 (MQ=255) tgtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTa > 1:1877233/1‑101 (MQ=255) tgtcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTa < 1:10812578/101‑1 (MQ=255) tcCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACg < 1:48946/101‑1 (MQ=255) ccATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGCTTTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACg > 1:232641/1‑101 (MQ=255) tAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTg > 1:7024136/1‑101 (MQ=255) tGATTAATGTAGCACCACCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATc > 1:3150227/1‑101 (MQ=255) gATTAATGTAGCCCCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTACGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATct < 1:8814474/101‑1 (MQ=255) aTTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATctg > 1:8089070/1‑101 (MQ=255) aTTAATGTAGCACCGCCTAATTACGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATctg < 1:11655935/101‑1 (MQ=255) aaTGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATctgctg < 1:2123099/101‑1 (MQ=255) aTGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCtgt < 1:10372196/101‑1 (MQ=255) gTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCtgttt < 1:2418505/101‑1 (MQ=255) gTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCtgttt < 1:13703202/101‑1 (MQ=255) gTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCtgttt < 1:126151/101‑1 (MQ=255) 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aaTTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACAGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGc < 1:1049274/101‑1 (MQ=255) aTTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCg > 1:11274485/1‑101 (MQ=255) aTTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCg > 1:10167275/1‑101 (MQ=255) aTTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCg > 1:12870463/1‑101 (MQ=255) ttGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGt > 1:12731838/1‑101 (MQ=255) tGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTc > 1:13574072/1‑101 (MQ=255) gCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGATTTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCt > 1:11804055/1‑101 (MQ=255) gCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCt < 1:7975235/101‑1 (MQ=255) gCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCt < 1:13175447/101‑1 (MQ=255) cGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCtt < 1:1140049/101‑1 (MQ=255) ggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacg < 1:3227111‑M2/101‑101 (MQ=255) ggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacg < 1:6391514‑M2/101‑101 (MQ=255) ggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacg < 1:599267‑M2/101‑101 (MQ=255) ggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacg > 1:9434947‑M2/1‑1 (MQ=255) ggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacg > 1:1516342‑M2/1‑1 (MQ=255) gTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTta < 1:9057676/101‑1 (MQ=255) gTGC‑TTTTTTTTACCTTGCCATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTta < 1:4536170/101‑1 (MQ=255) | GGTCTGCGATTCAGACCATGGTAGCAAAGCTACCTTTTTTCACTTCCTGTACATTTACCCTGTCTGTCCATAGTGATTAATGTAGCACCGCCTAATTGCGGTGC‑TTTTTTTTACCTTGCGATCGCGAATTACTGATCCAGTTCGACCATCTCTTTCACGTCAGTACGGTTGATCTGCTGTTTGTTGCCATTAGCGTCTTTA > NC_007779/2941446‑2941646 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |