Predicted mutation
evidence seq id position mutation freq annotation gene description
RA NC_007779 1,170,573 C→T 100% intergenic (‑164/‑77) ycfQ ← / → ycfR DNA‑binding transcriptional regulator/hypothetical protein

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  seq id position change freq score reads annotation genes product
*NC_0077791,170,5730C→T100.0% 1067.8 265intergenic (‑164/‑77)ycfQ/ycfRDNA‑binding transcriptional regulator/hypothetical protein
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                                                                                    tCTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACg             <  1:13632736/101‑1 (MQ=255)
                                                                                     cTTGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGt            >  1:9377251/1‑101 (MQ=255)
                                                                                      ttGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTa           <  1:7721566/101‑1 (MQ=255)
                                                                                      ttGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTa           >  1:8895682/1‑101 (MQ=255)
                                                                                       tGTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaa          <  1:1538833/101‑1 (MQ=255)
                                                                                        gTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaa         >  1:6970694/1‑101 (MQ=255)
                                                                                        gTATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaa         >  1:5072596/1‑101 (MQ=255)
                                                                                         tATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaaa        <  1:10190865/101‑1 (MQ=255)
                                                                                         tATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaaa        >  1:12930501/1‑101 (MQ=255)
                                                                                         tATGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaaa        <  1:11305184/101‑1 (MQ=255)
                                                                                          aTGTGATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTaaaaa       <  1:13384699/101‑1 (MQ=255)
                                                                                           tgtgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCGCTATTATGAAAAACGTAAAAAc      <  1:8850045/101‑1 (MQ=255)
                                                                                           tgtgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAc      >  1:183934/1‑101 (MQ=255)
                                                                                            gtgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAcc     <  1:3907723/101‑1 (MQ=255)
                                                                                            gtgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAcc     >  1:12775822/1‑101 (MQ=255)
                                                                                            gtgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAcc     >  1:3385408/1‑101 (MQ=255)
                                                                                             tgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAccc    >  1:452032/1‑101 (MQ=255)
                                                                                             tgATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAAccc    <  1:7201505/101‑1 (MQ=255)
                                                                                              gATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCt   >  1:10685177/1‑101 (MQ=255)
                                                                                              gATCTAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCt   >  1:5226356/1‑101 (MQ=255)
                                                                                                  |                                                                                                 
GTCCAGATCCCATAAAAATAATTGCTTTCTATTTAACTGAAATTTAAAGATTTTTAAATTAATTAATGATTGTTATAAAAAATATCTTGTATGTGATCCAGATCACATCTATCATTTAGTTATCGATCGTTAAGTAATTGCTTGCGACGTCATTCATCTGCATAAGGCCACTATTATGAAAAACGTAAAAACCCTC  >  NC_007779/1170475‑1170670

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.