New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 1624374 | 292 (0.960) | 3 (0.010) | 3/180 | NT | 1.0% | intergenic (+141/+300) | ydeE/ydeH | transporter/hypothetical protein |
? | NC_007779 | = 2412225 | NA (NA) | intergenic (‑55/‑782) | insA/yfbQ | IS1 element protein/aminotransferase |
Only 100 of 327 total aligned reads displayed.
TAGGTTACCTCTGCTAATATCTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTC > NC_007779/1624274‑1624474 | aGGTTACCTCTGCTAATATCTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGg > 1:12260087‑M1/1‑100 (MQ=255) ggTTACCTCTGCTAATATCTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGaa > 1:7541237/1‑101 (MQ=255) ttACCTCTGCTAATATCTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATg < 1:2320538/101‑1 (MQ=255) ttACCTCTGCTAATATCTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATg > 1:15267706/1‑101 (MQ=255) tACCTCTGCTAATATCTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGt > 1:11406597/1‑101 (MQ=255) tACCTCTGCTAATATCTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGt > 1:2263984/1‑101 (MQ=255) tACCTCTGCTAATATCTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGt < 1:10940997/101‑1 (MQ=255) tACCTCTGCTAATATCTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGt > 1:9374269/1‑101 (MQ=255) aCCTCTGCTAATATCTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGtt > 1:6522880/1‑101 (MQ=255) aCCTCTGCTAATATCTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGtt < 1:1286881/101‑1 (MQ=255) aCCTCTGCTAATATCTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGAAAATAATGCTGGGTAATATGAATGtt > 1:15385243/1‑101 (MQ=255) ccTCTGCTAATATCTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGttt < 1:14723216/101‑1 (MQ=255) ctctGCTAATATCTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGtttt > 1:4830756/1‑101 (MQ=255) tGCTAATATCTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTAt < 1:13358330/101‑1 (MQ=255) gCTAATATCTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATg < 1:8456784/101‑1 (MQ=255) tAATATCTTTCTCATTGAGGTGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGc < 1:14855582/101‑1 (MQ=255) tAATATCTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGc > 1:14552119/1‑101 (MQ=255) tatCTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGt > 1:5024799/1‑101 (MQ=255) cTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACt > 1:6107598/1‑101 (MQ=255) cTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACt > 1:8879646/1‑101 (MQ=255) tttCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTg < 1:11635611/101‑1 (MQ=255) tttCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTg < 1:7286839/101‑1 (MQ=255) tttCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTg > 1:10699243/1‑101 (MQ=255) tttCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTg > 1:297298/1‑101 (MQ=255) ttCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTgg < 1:6692666/101‑1 (MQ=255) ttCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTgg < 1:4594684/101‑1 (MQ=255) ctcATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGa < 1:8380276/101‑1 (MQ=255) ctcATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGa > 1:14666152/1‑101 (MQ=255) tcATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGaa < 1:6225955/101‑1 (MQ=255) tcATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGaa > 1:13242913/1‑101 (MQ=255) ttGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGggtgatgctgccaacttactgatttagt > 1:1803521‑M1/1‑73 (MQ=255) ttGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGaataa > 1:9475680/1‑101 (MQ=255) ttGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGaataa < 1:3839059/101‑1 (MQ=255) ttGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGaataa > 1:6031983/1‑101 (MQ=255) tGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGaataat > 1:12749287/1‑101 (MQ=255) tGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGaataat < 1:3354826/101‑1 (MQ=255) aTGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAatttta > 1:1589120/1‑101 (MQ=255) aaaTTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAattttatttt > 1:5364170/1‑101 (MQ=255) aaTTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTAttttc < 1:14769718/101‑1 (MQ=255) aTTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTAttttct > 1:9263256/1‑101 (MQ=255) ttAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACCCCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTAAGGCCGTACTGGGAATAATTTTAttttctg < 1:4956381/101‑1 (MQ=255) ttAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTAttttctg > 1:12218303/1‑101 (MQ=255) ttAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTAttttctg > 1:1309659/1‑101 (MQ=255) ttAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTAttttctg > 1:9293633/1‑101 (MQ=255) ttAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACCGAGCCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTAttttctg < 1:3210849/101‑1 (MQ=255) aaGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTAttttctggt > 1:4120088/1‑101 (MQ=255) aaGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTAttttctggt < 1:14209352/101‑1 (MQ=255) aaGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTAttttctggt > 1:11765402/1‑101 (MQ=255) aGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTAttttctggtt < 1:5838775/101‑1 (MQ=255) aGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTAttttctggtt < 1:7765200/101‑1 (MQ=255) ggTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTAttttctggttt > 1:1317257/1‑101 (MQ=255) aaGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTAttttctggttttct > 1:12670859/1‑101 (MQ=255) cGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGc < 1:13869575/101‑1 (MQ=255) gAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGcc < 1:8981671/101‑1 (MQ=255) gAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGcc > 1:9898960/1‑101 (MQ=255) 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acaccacaccATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTAttt > 1:10002699/1‑101 (MQ=255) caccacaccaTAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTc > 1:9028205/1‑101 (MQ=255) caccacaccaTAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTc > 1:8256781/1‑101 (MQ=255) accacaccaTAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCa > 1:6391038/1‑101 (MQ=255) ccacaccaTAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAg < 1:1008283/101‑1 (MQ=255) caccaTAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCca < 1:5719096/101‑1 (MQ=255) ccaTAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCcaca > 1:15162871/1‑101 (MQ=255) caTAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACaa < 1:3538164/101‑1 (MQ=255) aTAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACaaa < 1:10164259/101‑1 (MQ=255) aaaCGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATg > 1:13523430/1‑101 (MQ=255) aCGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATggg > 1:14350424/1‑101 (MQ=255) cGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGa > 1:977328/1‑101 (MQ=255) ggAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGAt > 1:11710257/1‑101 (MQ=255) gAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATg < 1:6951174/101‑1 (MQ=255) 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aaaTAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTaa < 1:4515058/101‑1 (MQ=255) taatGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGa > 1:11169549/1‑101 (MQ=255) gCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACgg < 1:7979085/101‑1 (MQ=255) cTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTATTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGga > 1:1969981/1‑101 (MQ=255) gggTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGgaga < 1:5056331/101‑1 (MQ=255) ggTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGAt > 1:5257717/1‑101 (MQ=255) ggTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGAt > 1:3499812/1‑101 (MQ=255) gTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATa < 1:8225931/101‑1 (MQ=255) gTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATa > 1:3991595/1‑101 (MQ=255) tAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATaa < 1:2780049/101‑1 (MQ=255) tAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATaa > 1:5573244/1‑101 (MQ=255) tAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATaa > 1:3037020/1‑101 (MQ=255) aaTATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAAt > 1:2164985/1‑101 (MQ=255) aaTATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAAt < 1:14062616/101‑1 (MQ=255) atatGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATc > 1:2671089/1‑101 (MQ=255) atatGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATc > 1:1122944/1‑101 (MQ=255) tGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCt > 1:6183266/1‑101 (MQ=255) | TAGGTTACCTCTGCTAATATCTTTCTCATTGAGATGAAAATTAAGGTAAGCGAGGAAACACACCACACCATAAACGGAGGCAAATAATGCTGGGTAATATGAATGTTTTTATGGCCGTACTGGGAATAATTTTATTTTCTGGTTTTCTGGCCGCGTATTTCAGCCACAAATGGGATGACTAATGAACGGAGATAATCCCTC > NC_007779/1624274‑1624474 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |