New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 3987186 = | NA (NA) | 279 (0.930) | 138/178 | NT | 100% | intergenic (‑732/‑31) | slp/insH | outer membrane lipoprotein/IS5 transposase and trans‑activator |
? | NC_007779 | = 4009203 | 0 (0.000) | coding (1379/1623 nt) | yhiJ | hypothetical protein |
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
TGTTGAAAATAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGA > NC_007779/3987086‑3987278 | tGTTGAAAATAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTaagg < 1:15198739/101‑1 (MQ=255) gTTGAAAATAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTaagga < 1:4409100/101‑1 (MQ=255) ttGAAAATAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTaaggaa < 1:4746416/101‑1 (MQ=255) gAAAATAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTaaggaagg > 1:13636784/1‑101 (MQ=255) aaaaTAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGt < 1:14294868/101‑1 (MQ=255) aaaaTAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGt > 1:2796189/1‑101 (MQ=255) aaaaTAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGt > 1:10422257/1‑101 (MQ=255) aaaaTAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGt < 1:11378193/101‑1 (MQ=255) aaaaTAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGt < 1:8684109/101‑1 (MQ=255) aaaTAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTg < 1:15166758/101‑1 (MQ=255) aaTAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGc < 1:13260157/101‑1 (MQ=255) aTAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCg < 1:9830236/101‑1 (MQ=255) aTAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCg > 1:8268556/1‑101 (MQ=255) tAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGa < 1:13003042/101‑1 (MQ=255) aaaCCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGaa < 1:6873778/101‑1 (MQ=255) aaCCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAAc > 1:13706924/1‑101 (MQ=255) aaCCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAAc > 1:9619344/1‑101 (MQ=255) aaCCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGGGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAAc > 1:13539838/1‑101 (MQ=255) aCCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACa < 1:9301150/101‑1 (MQ=255) ccTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACaa > 1:9363474/1‑101 (MQ=255) cTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAg > 1:11912305/1‑101 (MQ=255) cTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCATTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAg > 1:8742854/1‑101 (MQ=255) cGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTcc > 1:2211962/1‑101 (MQ=255) ttgtttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAATTTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTg < 1:208678/101‑1 (MQ=255) ttgtttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGa < 1:594909/101‑1 (MQ=255) tgtttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGat < 1:7221047/101‑1 (MQ=255) tgtttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGat > 1:13046008/1‑101 (MQ=255) tgtttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGat < 1:11236776/101‑1 (MQ=255) gtttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGata < 1:13369168/101‑1 (MQ=255) gtttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGata > 1:12530289/1‑101 (MQ=255) tttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGatat < 1:1559994/101‑1 (MQ=255) tttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGatat < 1:7831885/101‑1 (MQ=255) tttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGatat < 1:3472835/101‑1 (MQ=255) tttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGatat < 1:14203913/101‑1 (MQ=255) ttgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATg > 1:3743642/1‑101 (MQ=255) tgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATga > 1:3305723/1‑101 (MQ=255) tgtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATga < 1:9514939/101‑1 (MQ=255) gtCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATgag < 1:8024281/101‑1 (MQ=255) tCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATgaga > 1:7071704/1‑101 (MQ=255) cAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGAt > 1:11597739/1‑101 (MQ=255) cAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGAt > 1:4942858/1‑101 (MQ=255) cAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGAt > 1:9198070/1‑101 (MQ=255) cAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGAt > 1:13905585/1‑101 (MQ=255) aGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCa < 1:13982398/101‑1 (MQ=255) atatTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATg < 1:10198004/101‑1 (MQ=255) tatTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGt > 1:9429315/1‑101 (MQ=255) atTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGtt > 1:14063464/1‑101 (MQ=255) ttGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGttt < 1:4116532/101‑1 (MQ=255) tGTCCATCTTTATATGA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTg < 1:11555078/101‑1 (MQ=255) aTCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATc > 1:15225645/1‑101 (MQ=255) tCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCt < 1:12462930/101‑1 (MQ=255) cTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAGGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTg > 1:4335533/1‑101 (MQ=255) cTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTg < 1:8102924/101‑1 (MQ=255) cTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTg > 1:9922748/1‑101 (MQ=255) ttATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGa > 1:10048573/1‑101 (MQ=255) ttATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGa > 1:3062921/1‑101 (MQ=255) ttATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGa > 1:1808479/1‑101 (MQ=255) tatataA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAg < 1:1270309/101‑1 (MQ=255) atataA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGc > 1:9757282/1‑101 (MQ=255) aa‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATa < 1:6521640/101‑1 (MQ=255) aa‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATa < 1:1092667/101‑1 (MQ=255) a‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAg > 1:10829987/1‑101 (MQ=255) tttGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGa < 1:577059/101‑1 (MQ=255) tttGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGa < 1:13206476/101‑1 (MQ=255) tttGGGGGTAGGGCGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGa > 1:12952125/1‑101 (MQ=255) gggTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAgg < 1:1591489/101‑1 (MQ=255) gTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGt < 1:8967566/101‑1 (MQ=255) aGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTtc < 1:5056173/101‑1 (MQ=255) gggTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTtca > 1:4600934/1‑101 (MQ=255) gggTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTtca > 1:2311556/1‑101 (MQ=255) ggTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTtcat < 1:14102911/101‑1 (MQ=255) tgtTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTtcatca > 1:5224645/1‑101 (MQ=255) gtTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTcatcat > 1:1232458/1‑101 (MQ=255) gtTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTcatcat > 1:1849135/1‑101 (MQ=255) ttCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATg < 1:9885726/101‑1 (MQ=255) tCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGa < 1:5984656/101‑1 (MQ=255) cTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAg > 1:12096847/1‑101 (MQ=255) cTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAg < 1:3320555/101‑1 (MQ=255) cTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAg > 1:6198798/1‑101 (MQ=255) tttATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGt > 1:7366017/1‑101 (MQ=255) ttATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGtc > 1:14486377/1‑101 (MQ=255) tATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGtca > 1:15339585/1‑101 (MQ=255) tATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGtca > 1:10268799/1‑101 (MQ=255) tGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGtcatc < 1:8323359/101‑1 (MQ=255) tGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGtcatc > 1:11780250/1‑101 (MQ=255) aaaaaaaTAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAAc < 1:3950524/101‑1 (MQ=255) aaaaaaaTAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAAc > 1:8409135/1‑101 (MQ=255) aaaaaaTAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACt > 1:1967581/1‑101 (MQ=255) aaaaaTAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACtt > 1:7570796/1‑101 (MQ=40) aaaaaTAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACtt < 1:8905001/101‑1 (MQ=40) aaaaTAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTa > 1:2546596/1‑101 (MQ=40) aaaaTAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTa < 1:13412705/101‑1 (MQ=40) aaaTAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTAc > 1:4231755/1‑101 (MQ=39) aTAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCt < 1:6603596/101‑1 (MQ=37) aTAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCt < 1:14726279/101‑1 (MQ=37) aTAGTGGCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCt < 1:6322869/101‑1 (MQ=21) tAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCtt > 1:9557846/1‑101 (MQ=35) gtCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGcc < 1:10656059/101‑1 (MQ=32) tCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCg > 1:2061232/1‑101 (MQ=31) cACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGa > 1:6404326/1‑101 (MQ=11) | TGTTGAAAATAAACCTTCGATTTGTTTGTCAAGATATTGTCCATCTTTATATAA‑TTTGGGGGTAGGGTGTTCTTTATGTAAAAAAATAGTGTCACCTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGA > NC_007779/3987086‑3987278 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |