Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_007779 | 3,441,406 | T→C | 1.9% | Y275Y (TAT→TAC) | thiC → | thiamin (pyrimidine moiety) biosynthesis protein |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_007779 | 3,441,406 | 0 | T→C | 1.9% | 6.8 ‑0.4 ‑0.1 | 317 | Y275Y (TAT→TAC) | thiC | thiamin (pyrimidine moiety) biosynthesis protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (2/4): ref base (156/154): total (159/158) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 6.84e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.38e-01 |
Only 100 of 343 total aligned reads displayed.
ACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTAACGGGATCGCCGAAG > NC_007779/3441306‑3441506 | aCTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCtat < 1:4557914/101‑1 (MQ=255) cTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCtata > 1:315003/1‑101 (MQ=255) tCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTatat > 1:15104439/1‑101 (MQ=255) ggcggTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTc > 1:13252664/1‑101 (MQ=255) ggcggTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGATGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTc > 1:10403065/1‑101 (MQ=255) ggTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACg > 1:3296330/1‑101 (MQ=255) ggTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACg > 1:3377294/1‑101 (MQ=255) ggTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACg < 1:5687716/101‑1 (MQ=255) ggTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGGGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACg > 1:15336826/1‑101 (MQ=255) gTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGa > 1:8010414/1‑101 (MQ=255) gTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGa > 1:2007362/1‑101 (MQ=255) aCCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAAc > 1:12634841/1‑101 (MQ=255) tCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGa > 1:1465803/1‑101 (MQ=255) ccATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAg < 1:8638016/101‑1 (MQ=255) cATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGt > 1:14029525/1‑101 (MQ=255) cATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGt > 1:8300643/1‑101 (MQ=255) aTCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTg < 1:6957006/101‑1 (MQ=255) aTCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTg > 1:7235094/1‑101 (MQ=255) aTCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTg > 1:15467770/1‑101 (MQ=255) cGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGCATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGa > 1:14585148/1‑101 (MQ=255) gaagaagaaGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGAt > 1:11808839/1‑101 (MQ=255) aagaagaagTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGAtt > 1:13947133/1‑101 (MQ=255) gaagaagTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGAtttt < 1:14073757/101‑1 (MQ=255) aagaagTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTg > 1:3854740/1‑101 (MQ=255) agaagTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGc > 1:5432582/1‑101 (MQ=255) agaagTCGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGc < 1:9946446/101‑1 (MQ=255) agTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTa > 1:3332796/1‑101 (MQ=255) gTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTaa < 1:2512910/101‑1 (MQ=255) gTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTaa < 1:11323089/101‑1 (MQ=255) tGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAAc < 1:9788663/101‑1 (MQ=255) tGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAAc < 1:5095852/101‑1 (MQ=255) ggAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACa < 1:4335734/101‑1 (MQ=255) ggAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACa < 1:12153933/101‑1 (MQ=255) gAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAg > 1:6293937/1‑101 (MQ=255) aaaaGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGc > 1:10854013/1‑101 (MQ=255) aaaaGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGc > 1:5329142/1‑101 (MQ=255) aaaGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGcc > 1:14937058/1‑101 (MQ=255) aaGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGccc < 1:5236442/101‑1 (MQ=255) aaGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGccc > 1:11453079/1‑101 (MQ=255) aGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCg < 1:2247495/101‑1 (MQ=255) aGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCg > 1:5577867/1‑101 (MQ=255) gCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCgg > 1:10261289/1‑101 (MQ=255) tGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTg > 1:8157817/1‑101 (MQ=255) tGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTg > 1:11052352/1‑101 (MQ=255) gTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGcc < 1:5150951/101‑1 (MQ=255) aTGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGa > 1:7432712/1‑101 (MQ=255) aTGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGACCGGTGCCGa > 1:13566303/1‑101 (MQ=255) tGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGAt > 1:12379901/1‑101 (MQ=255) ggTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATc < 1:14742810/101‑1 (MQ=255) gTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCg < 1:5964574/101‑1 (MQ=255) gTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCg < 1:9569458/101‑1 (MQ=255) tCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCgg > 1:11613920/1‑101 (MQ=255) ccACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGt < 1:7580743/101‑1 (MQ=255) cACGCGCTGGGGAGCAGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTa > 1:8860861/1‑101 (MQ=255) aCGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTAc < 1:417198/101‑1 (MQ=255) aCGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGAAGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTAc < 1:15071221/101‑1 (MQ=255) cgcgCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACa < 1:2757206/101‑1 (MQ=255) gcgcTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAg > 1:1834318/1‑101 (MQ=255) gcTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTg > 1:947359/1‑101 (MQ=255) gcTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTg < 1:7324886/101‑1 (MQ=255) ggggAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCg < 1:6851293/101‑1 (MQ=255) ggAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGAt > 1:4104150/1‑101 (MQ=255) aGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATGGATACAGTGCCGATCt > 1:4915172/1‑101 (MQ=255) aGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCt < 1:8415017/101‑1 (MQ=255) gCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTa < 1:14476753/101‑1 (MQ=255) cGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTAc > 1:8560752/1‑101 (MQ=255) cGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTAc < 1:10060131/101‑1 (MQ=255) ggATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGACCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTAcc > 1:10629165/1‑101 (MQ=255) gATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCa > 1:7754023/1‑101 (MQ=255) 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gATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGaa < 1:13182870/101‑1 (MQ=255) aTCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAg > 1:12253203/1‑101 (MQ=255) ctctcCACCGGTCGCTATATTCACGAACCCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGt < 1:591261/101‑1 (MQ=255) tctcCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGtt > 1:4719281/1‑101 (MQ=255) ttcCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACATTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTa < 1:1339109/100‑1 (MQ=255) cttcaacGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTa < 1:6106719/95‑1 (MQ=255) ctcCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTa < 1:11651654/101‑1 (MQ=255) ctcCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTa < 1:4807711/101‑1 (MQ=255) ctcCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTa < 1:317473/101‑1 (MQ=255) ctcCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTa < 1:9400277/101‑1 (MQ=255) tcCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTaa < 1:3663690/101‑1 (MQ=255) cccgggTCGCTATATTCACGAACCCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTAACg < 1:4419229/97‑1 (MQ=255) aCCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTAACgg > 1:2350200/1‑101 (MQ=255) ccGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTAACggg < 1:7123297/101‑1 (MQ=255) ccGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTAACggg > 1:3069582/1‑101 (MQ=255) ccGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGACCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTAACggg > 1:8784717/1‑101 (MQ=255) cGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTAACGGGa > 1:9044545/1‑101 (MQ=255) ggTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTAACGGGAt > 1:12874437/1‑101 (MQ=255) gTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTAACGGGATc < 1:2629266/101‑1 (MQ=255) tCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTAACGGGATca < 1:2911066/101‑2 (MQ=255) tCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTAACGGGATCg > 1:7205429/1‑101 (MQ=255) gCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAAGTTAACGGGATCGcc > 1:14232185/1‑101 (MQ=255) cTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTAACGGGATCGCCg > 1:9136546/1‑101 (MQ=255) cTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTAACGGGATCGCCg < 1:4874483/101‑1 (MQ=255) | ACTCGGCGGTCACCTCTTCCATCGAAGAAGAAGTGGAAAAGCTGGTATGGTCCACGCGCTGGGGAGCGGATACGGTGATGGATCTCTCCACCGGTCGCTATATTCACGAAACCCGCGAGTGGATTTTGCGTAACAGCCCGGTGCCGATCGGTACAGTGCCGATCTACCAGGCGCTGGAGAAGGTTAACGGGATCGCCGAAG > NC_007779/3441306‑3441506 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |