| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,450,031 | A→T | 2.5% | I434N (ATC→AAC) | rpoC ← | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,450,031 | 0 | A→T | 2.5% | 19.4 0.0 ‑0.1 | 403 | I434N (ATC→AAC) | rpoC | RNA polymerase, beta prime subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (5/5): ref base (201/192): total (206/197) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 8.91e-01 | ||||||||||
Only 100 of 411 total aligned reads displayed.
AGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAAC > NC_007779/3449931‑3450131 | aGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGa > 1:2352074/1‑101 (MQ=255) gCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGAt < 1:4838333/101‑1 (MQ=255) cATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATAc > 1:6928543/1‑101 (MQ=255) aTCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATAcc > 1:13780244/1‑101 (MQ=255) aTCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATAcc > 1:5079640/1‑101 (MQ=255) tCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATAccc < 1:8751521/101‑1 (MQ=255) tCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATAccc < 1:850454/101‑1 (MQ=255) cTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCa < 1:4281753/101‑1 (MQ=255) gTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGAc < 1:3540552/101‑1 (MQ=255) gTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGAc < 1:5344357/101‑1 (MQ=255) tCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCag < 1:1281340/101‑1 (MQ=255) tCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCag > 1:5554775/1‑101 (MQ=255) cGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCaga > 1:15388967/1‑101 (MQ=255) gAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCagag > 1:7236100/1‑101 (MQ=255) gAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCagag < 1:2129277/101‑1 (MQ=255) gAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCagag > 1:3921421/1‑101 (MQ=255) tCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCgg < 1:7488421/101‑1 (MQ=255) tCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCgg < 1:3078877/101‑1 (MQ=255) gTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCAc < 1:13625193/101‑1 (MQ=255) gTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCAc > 1:1030125/1‑101 (MQ=255) ttATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACg > 1:11337216/1‑101 (MQ=255) ttATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACg < 1:7900242/101‑1 (MQ=255) tatGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGtt > 1:7442521/1‑101 (MQ=255) tatGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGtt > 1:1231924/1‑101 (MQ=255) tGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTca < 1:2380897/101‑1 (MQ=255) cGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagca < 1:9252317/101‑1 (MQ=255) cGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagca > 1:14670692/1‑101 (MQ=255) gCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTcagcag < 1:14075107/101‑1 (MQ=255) cacaAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGt < 1:4675790/101‑1 (MQ=255) cacaAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGt < 1:3636388/101‑1 (MQ=255) acaAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTa < 1:11900585/101‑1 (MQ=255) aaaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTAcc > 1:6196672/1‑101 (MQ=255) aaaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTAcc > 1:5012141/1‑101 (MQ=255) aaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCg > 1:1374958/1‑101 (MQ=255) aaCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCg > 1:2492392/1‑101 (MQ=255) aCCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCgg < 1:5623809/101‑1 (MQ=255) cAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgt > 1:9742135/1‑101 (MQ=255) cAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgt < 1:14970902/101‑1 (MQ=255) aGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgtg > 1:4543841/1‑101 (MQ=255) aGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgtg < 1:13287141/101‑1 (MQ=255) gCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGgtgt > 1:3381325/1‑101 (MQ=255) ggTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTcg > 1:11254628/1‑101 (MQ=255) gTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGTTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTcgc < 1:14834997/101‑1 (MQ=255) gTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTcgc < 1:8933603/101‑1 (MQ=255) gCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATa < 1:10105990/101‑1 (MQ=255) tGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAAc > 1:6728907/1‑101 (MQ=255) tGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAAc < 1:12494510/101‑1 (MQ=255) tGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAAc < 1:6410178/101‑1 (MQ=255) tGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAAc > 1:8268948/1‑101 (MQ=255) gATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACtt < 1:11013287/101‑1 (MQ=255) aTAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTc < 1:3143567/101‑1 (MQ=255) aTAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTc < 1:5816240/101‑1 (MQ=255) tAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCg < 1:11706286/101‑1 (MQ=255) aGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCATGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGt < 1:2910759/101‑1 (MQ=255) gCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTc < 1:3295203/101‑1 (MQ=255) gCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTc > 1:14269720/1‑101 (MQ=255) gCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTc < 1:1744193/101‑1 (MQ=255) cTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTcc > 1:9144508/1‑101 (MQ=255) tttACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCa > 1:4089292/1‑101 (MQ=255) tttACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCa > 1:4447259/1‑101 (MQ=255) ttACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAg < 1:3979042/101‑1 (MQ=255) ttACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAg < 1:10436852/101‑1 (MQ=255) ttACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAg < 1:13701157/101‑1 (MQ=255) ttACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAg > 1:14519586/1‑101 (MQ=255) aCCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGa > 1:7085657/1‑101 (MQ=255) cTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGata > 1:13490279/1‑101 (MQ=255) cTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGata > 1:9078368/1‑101 (MQ=255) ttCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGatat < 1:12998198/101‑1 (MQ=255) ttCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGatat < 1:10322223/101‑1 (MQ=255) gATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATccc > 1:7757686/1‑101 (MQ=255) aTCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCa > 1:12059317/1‑101 (MQ=255) tCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCaa > 1:9635849/1‑101 (MQ=255) cAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCaaa > 1:5462584/1‑101 (MQ=255) cAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCaaa > 1:2989370/1‑101 (MQ=255) aGTACCGGTTCAAATGCCTGGTTACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAAc > 1:13231201/1‑101 (MQ=255) aGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAAc > 1:5918672/1‑101 (MQ=255) cGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAg > 1:1960264/1‑101 (MQ=255) cGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAg < 1:2584702/101‑1 (MQ=255) ggTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGc > 1:9552457/1‑101 (MQ=255) ttCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGctt > 1:13929370/1‑101 (MQ=255) ttCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGctt < 1:838556/101‑1 (MQ=255) ttCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGctt > 1:10885722/1‑101 (MQ=255) tCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGcttc < 1:15113042/101‑1 (MQ=255) tCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGGCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGcttc < 1:14395499/101‑1 (MQ=255) cAAATGCCTGGATGCCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGcttct < 1:3750479/101‑1 (MQ=255) cAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGcttct < 1:8180232/101‑1 (MQ=255) cAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGcttct < 1:10617654/101‑1 (MQ=255) aaaTGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGcttctt > 1:6046364/1‑101 (MQ=255) aTGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTcg > 1:9400642/1‑101 (MQ=255) aTGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATACCAAACGACAGCTTCTTcg < 1:12168649/101‑1 (MQ=255) tGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTcgc < 1:10031825/101‑1 (MQ=255) gCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTcgcg < 1:8307978/101‑1 (MQ=255) ccTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCgcgc > 1:8051572/1‑101 (MQ=255) cTGGATGCCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCt < 1:8603540/101‑1 (MQ=255) cTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGGCAGCTTCTTCGCGCt > 1:11506790/1‑101 (MQ=255) cTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCt > 1:147561/1‑101 (MQ=255) tGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCTGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTc > 1:4583446/1‑101 (MQ=255) tGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTc > 1:10810941/1‑101 (MQ=255) tGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTc > 1:760934/1‑101 (MQ=255) ggATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCa < 1:10550167/101‑1 (MQ=255) | AGCCATCTGGTCACCATCGAAGTCGGCGTTATATGCCGCACAAACCAGCGGGTGCAGCTGGATAGCTTTACCTTCGATCAGTACCGGTTCAAATGCCTGGATACCCAGACGGTGCAGAGTCGGTGCACGGTTCAGCAGTACCGGGTGTTCGCGGATAACTTCGTCCAGGATATCCCAAACGACAGCTTCTTCGCGCTCAAC > NC_007779/3449931‑3450131 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |