| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 3,451,585 | T→G | 1.2% | A1284A (GCA→GCC) | rpoB ← | RNA polymerase subunit beta |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 3,451,585 | 0 | T→G | 1.2% | 2.5 0.0 ‑0.0 | 340 | A1284A (GCA→GCC) | rpoB | RNA polymerase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (2/2): ref base (152/184): total (154/186) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.82e-01 | ||||||||||
Only 100 of 376 total aligned reads displayed.
CCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGT > NC_007779/3451485‑3451685 | ccGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCTTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTAt < 1:13329856/101‑1 (MQ=255)ccGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTAt > 1:5012389/1‑101 (MQ=255) cGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTAtg < 1:8126288/101‑1 (MQ=255) cGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTAtg < 1:11274060/101‑1 (MQ=255) ggCTNCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTAtgc > 1:5957771/1‑101 (MQ=255) ggCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTAtgc > 1:12849805/1‑101 (MQ=255) ggCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTAtgc < 1:13700513/101‑1 (MQ=255) cTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTAtgctg < 1:13943314/101‑1 (MQ=255) cTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTAtgctg > 1:3831669/1‑101 (MQ=255) cATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTgcgc < 1:14143315/101‑1 (MQ=255) tCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCg < 1:4513667/101‑1 (MQ=255) tCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCg > 1:8672796/1‑101 (MQ=255) cTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGt > 1:7816723/1‑101 (MQ=255) cTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGt < 1:5285520/101‑1 (MQ=255) cTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGt > 1:6128709/1‑101 (MQ=255) tGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTa > 1:8377073/1‑101 (MQ=255) gATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTAt > 1:15038520/1‑101 (MQ=255) aTGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATg < 1:4624628/101‑1 (MQ=255) aTGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGCATGCTGCGCCGTATg < 1:14484255/101‑1 (MQ=255) ggTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCt > 1:13638048/1‑101 (MQ=255) ggTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCt > 1:4085284/1‑101 (MQ=255) gTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCtt > 1:9201067/1‑101 (MQ=255) ttGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTc > 1:6865391/1‑101 (MQ=255) tGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTcc < 1:12428543/101‑1 (MQ=255) cGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAgc < 1:415080/101‑1 (MQ=255) cACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGccc > 1:8543232/1‑101 (MQ=255) cGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCcac < 1:3173880/101‑1 (MQ=255) tGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACt > 1:6660458/1‑101 (MQ=255) tGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACt > 1:7382793/1‑101 (MQ=255) gTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACtt > 1:12553632/1‑101 (MQ=255) tttttATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTc > 1:2986845/1‑101 (MQ=255) ttttATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTcc > 1:2566334/1‑101 (MQ=255) ttttATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTcc > 1:902950/1‑101 (MQ=255) tttATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCa < 1:9798013/101‑1 (MQ=255) ttATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCAt > 1:12675239/1‑101 (MQ=255) ttATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCAt < 1:12353993/101‑1 (MQ=255) ataCATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCAtct < 1:10270381/101‑1 (MQ=255) taCATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCAtctc > 1:963796/1‑101 (MQ=255) taCATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCAtctc > 1:5418052/1‑101 (MQ=255) cATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTccc > 1:11414207/1‑101 (MQ=255) tCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCg > 1:13017466/1‑101 (MQ=255) cTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGa > 1:4823717/1‑101 (MQ=255) cTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGa < 1:5674411/101‑1 (MQ=255) tGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGaaa > 1:6360152/1‑101 (MQ=255) tGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGaaa < 1:14779503/101‑1 (MQ=255) gTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACg < 1:7674903/101‑1 (MQ=255) gTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACg < 1:8931805/101‑1 (MQ=255) gTACGACCGTTCACGACATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACg < 1:5077734/101‑1 (MQ=255) tACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGc < 1:6420435/101‑1 (MQ=255) tACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGc < 1:11499683/101‑1 (MQ=255) aCGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCt < 1:7092388/101‑1 (MQ=255) aCGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCt > 1:14604263/1‑101 (MQ=255) aCGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCt > 1:10920970/1‑101 (MQ=255) cGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTg > 1:10158021/1‑101 (MQ=255) gACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGa > 1:7194424/1‑101 (MQ=255) aCCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGac < 1:11070820/101‑1 (MQ=255) aCCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGac < 1:11622068/101‑1 (MQ=255) aCCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGac < 1:9505653/101‑1 (MQ=255) cGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGacca > 1:9117661/1‑101 (MQ=255) cGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGacca > 1:8456165/1‑101 (MQ=255) cGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGacca > 1:14258887/1‑101 (MQ=255) gTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGaccac < 1:13199030/101‑1 (MQ=255) tCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCg < 1:14019517/101‑1 (MQ=255) cACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGa < 1:8245634/101‑1 (MQ=255) tcatcaGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACtg < 1:12207908/101‑1 (MQ=255) tcatcaGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACtg > 1:1947611/1‑101 (MQ=255) catcaGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACtgt < 1:3287252/101‑1 (MQ=255) catcaGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACtgt < 1:1566919/101‑1 (MQ=255) catcaGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACtgt > 1:14651386/1‑101 (MQ=255) atcaGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACtgtg < 1:7240131/101‑1 (MQ=255) tcaGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGAGCACCGAACTGTGc > 1:6263377/1‑101 (MQ=255) aGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCt > 1:2168577/1‑101 (MQ=255) ttAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTacc > 1:7926503/1‑101 (MQ=255) tAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTacca < 1:354549/101‑1 (MQ=255) gatggTGAGCAGCTCCTGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTaccac < 1:1512143/98‑1 (MQ=255) cGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCAccc > 1:5596764/1‑101 (MQ=255) ggTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCa > 1:1678708/1‑101 (MQ=255) ggTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCa > 1:10597859/1‑101 (MQ=255) gTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAg > 1:9926822/1‑101 (MQ=255) gTGAGCATTTCATGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAg < 1:10398045/101‑1 (MQ=255) tGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGc < 1:1119771/101‑1 (MQ=255) gAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCg < 1:2887084/101‑1 (MQ=255) gCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGgc < 1:11381121/101‑1 (MQ=255) cATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGgct < 1:10693836/101‑1 (MQ=255) cATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGgct < 1:14977927/101‑1 (MQ=255) aTTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGgctg < 1:12014723/101‑1 (MQ=255) aTTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGgctg > 1:2378907/1‑101 (MQ=255) tttCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGgctgc < 1:2287062/101‑1 (MQ=255) ttCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGgctgct > 1:14895913/1‑101 (MQ=255) tCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGctgctg < 1:179875/101‑1 (MQ=255) tCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGctgctg > 1:14114827/1‑101 (MQ=255) cTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAg < 1:10034906/101‑1 (MQ=255) tGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGt < 1:4340911/101‑1 (MQ=255) tGCAGGGTGTAGGCAGCGCCGTATGCCTGCATTGCCCACACCTCCATCTCACCGAAGCGCTGACCACCGAACTGAGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGGGt < 1:6030760/101‑1 (MQ=255) gCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTa > 1:7537821/1‑101 (MQ=255) gCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTa < 1:6542162/101‑1 (MQ=255) aGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAAc < 1:12715944/101‑1 (MQ=255) ggTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCa < 1:9360754/101‑1 (MQ=255) gtATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGc < 1:7650946/101‑1 (MQ=255) aTGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTg < 1:2626614/101‑1 (MQ=255) | CCGGCTCCATCTGATGGTTGCCGTCCACGATGTTTTTATACATCTTGGTACGACCGTTCACGTCATCAGACTTAACGGTGAGCATTTCCTGCAGGGTGTATGCTGCGCCGTATGCTTCCAGCGCCCACACTTCCATCTCCCCGAAACGCTGACCACCGAACTGTGCCTTACCACCCAGCGGCTGCTGAGTAACCAGGCTGT > NC_007779/3451485‑3451685 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |