New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | 380484 = | NA (NA) | 266 (0.880) | 130/180 | NT | NA | intergenic (‑418/‑46) | yaiO/insC | hypothetical protein/IS2 insertion element repressor InsA |
? | NC_007779 | = 381407 | NA (NA) | coding (510/906 nt) | insD | IS2 insertion element transposase InsAB' |
Only 100 of 281 total aligned reads displayed.
ATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_007779/380576‑380484 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGTGCCTCACGATCACAGCAGTCCAGCGCGAACGTGACACGCAGTCTCTCTCCGTTATCACAG < NC_007779/381407‑381308 GTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAA < 1:1988618/101‑1 GTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAA < 1:8568287/101‑1 TTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAG > 1:13987340/1‑101 TCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGC > 1:4876106/1‑101 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AACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAG < 1:7855530/101‑1 ACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGT > 1:9338054/1‑101 CTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTG > 1:14037887/1‑101 CTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTG > 1:64477/1‑101 AGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCA > 1:3240049/1‑101 AGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCA < 1:3662260/101‑1 AGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCA < 1:1266475/101‑1 TATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTATTCACTGTTGAAGCCGCCGGTAGTGACCGCCCAGTGCAGT > 1:11291877/1‑101 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |