| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 4355066 | 8 (0.030) | 272 (0.920) | 134/176 | NT | 97.2% | coding (1275/1632 nt) | dcuS | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with DcuR, regulator of anaerobic fumarate respiration |
| ? | NC_007779 | = 4504189 | NA (NA) | intergenic (+9/‑90) | insD/yjgW | IS2 insertion element transposase InsAB'/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 393 total aligned reads displayed.
CTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/4354965‑4355066‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGC < NC_007779/4504189‑4504090 CTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCT < 1:12958386/101‑1CTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCT < 1:15001229/101‑1CTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCT < 1:3097204/101‑1 TAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTG < 1:10244798/101‑1 ATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGA > 1:13721/1‑101 ATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGA > 1:5402619/1‑101 ATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGA > 1:2134184/1‑101 TTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGAT > 1:3708297/1‑101 TTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATT > 1:10935871/1‑101 TTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATT < 1:7865850/101‑1 TTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCACCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATT < 1:12513908/101‑1 TCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTT < 1:14655952/101‑1 TCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTT < 1:423766/101‑1 TCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTT < 1:6201093/101‑1 CGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTG > 1:15260960/1‑101 CGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTA > 1:10648503/1‑101 CGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTA > 1:7546787/1‑101 GGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTAT < 1:11568852/101‑1 GGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATA < 1:9653011/101‑1 GTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATAT > 1:4668260/1‑101 GTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATAT < 1:12262682/101‑1 TTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCANCGTCGCGACCTGGTCCTCACNNNNGCTGGATTTGCCCCTATATT < 1:15043931/101‑1 TCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTT < 1:2883167/101‑1 TCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTT < 1:13209488/101‑1 GCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAG < 1:14062514/101‑1 CCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGA < 1:14884465/101‑1 CCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGCCCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAC < 1:5001680/101‑1 CCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAC > 1:3172700/1‑101 CTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACA < 1:15207675/101‑1 CTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGAAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACA > 1:6574994/1‑101 TAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACAT > 1:1042054/1‑101 ATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCT > 1:11707445/1‑101 TGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTTATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTG > 1:13642017/1‑101 TGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTG < 1:76042/101‑1 GCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGT < 1:12168767/101‑1 GCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGT < 1:10080100/101‑1 TCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTAT > 1:358007/1‑101 CAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCA > 1:8155470/1‑101 CAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCA > 1:6471754/1‑101 AGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCAC > 1:9111092/1‑101 CGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTT < 1:9714319/101‑1 GCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGCCATCTGTTATCACTTA < 1:7463717/101‑1 GCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTA < 1:9544066/101‑1 GTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGGAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAC > 1:4003296/1‑101 TTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCA > 1:263693/1‑101 TTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCA < 1:8506560/101‑1 TCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCAT > 1:3916797/1‑101 CTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATT > 1:9867717/1‑101 TTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCG > 1:14304358/1‑101 TTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCG < 1:11138459/101‑1 TCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGC < 1:4806307/101‑1 CCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCT < 1:7915910/101‑1 CAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGC > 1:2384510/1‑101 AACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCC < 1:4591804/101‑1 AACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCC < 1:10021099/101‑1 ACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCG > 1:333501/1‑101 ACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCG < 1:11423428/101‑1 ACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCG < 1:6337766/101‑1 TGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAG > 1:14812852/1‑101 GGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGA < 1:8883913/101‑1 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TGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGAT > 1:5239709/1‑101 TGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGAT > 1:12767288/1‑101 TGGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGAT > 1:13319197/1‑101 GGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTGACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATA > 1:11238214/1‑101 GGTCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATA > 1:12399143/1‑101 TCCTCACTGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAATCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAAC < 1:9253239/101‑1 TGCCGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGC < 1:1966063/101‑1 CGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTTTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACT > 1:10317509/1‑101 CGCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACT < 1:3829531/101‑1 GCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTA > 1:8968521/1‑101 GCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTA > 1:13435243/1‑101 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCAGTAT > 1:4332832/1‑101 CTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTAT < 1:15433829/101‑1 GGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGC < 1:9459444/101‑1 GGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGC > 1:11275563/1‑101 GGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGC < 1:8738260/101‑1 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CTAATTTCGCCTCCGGGTTCCGGCCCTAATGCCTCCAGCGCGTTTTCTATCAGATTTCCCAACGTGGTAATCAGCGTCGCGACCTGGTCCTCACTGCCGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/4354965‑4355066‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGC < NC_007779/4504189‑4504090 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |