Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
MC JC | NC_007779 | 274,733 | Δ97,240 bp | 100% | [mmuP]–[mhpD] | 90 genes [mmuP], mmuM, afuC, afuB, insB, insA, ykgN, yagB, yagA, yagE, yagF, yagG, yagH, yagI, argF, insB, insA, yagJ, yagK, yagL, yagM, yagN, intF, yagP, yagQ, yagR, yagS, yagT, yagU, ykgJ, yagV, yagW, yagX, yagY, yagZ, ykgK, ykgL, Y75_p4288, Y75_p4289, eaeH, insE, insF, ykgA, ykgB, ykgI, ykgC, ykgD, ykgE, ykgF, ykgG, ykgH, betA, betB, betI, betT, yahA, yahB, yahC, yahD, yahE, yahF, yahG, yahH, yahI, yahJ, yahK, yahL, yahM, yahN, yahO, prpR, prpB, prpC, prpD, prpE, codB, codA, cynR, cynT, cynS, cynX, lacA, lacY, lacZ, lacI, mhpR, mhpA, mhpB, mhpC, [mhpD] |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
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seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_007779 | 274733 | 371972 | 97240 | 289 [0] | [2] 287 | [mmuP]–[mhpD] | 90 genes [mmuP], mmuM, afuC, afuB, insB, insA, ykgN, yagB, yagA, yagE, yagF, yagG, yagH, yagI, argF, insB, insA, yagJ, yagK, yagL, yagM, yagN, intF, yagP, yagQ, yagR, yagS, yagT, yagU, ykgJ, yagV, yagW, yagX, yagY, yagZ, ykgK, ykgL, Y75_p4288, Y75_p4289, eaeH, insE, insF, ykgA, ykgB, ykgI, ykgC, ykgD, ykgE, ykgF, ykgG, ykgH, betA, betB, betI, betT, yahA, yahB, yahC, yahD, yahE, yahF, yahG, yahH, yahI, yahJ, yahK, yahL, yahM, yahN, yahO, prpR, prpB, prpC, prpD, prpE, codB, codA, cynR, cynT, cynS, cynX, lacA, lacY, lacZ, lacI, mhpR, mhpA, mhpB, mhpC, [mhpD] |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_007779 | = 274732 | 0 (0.000) | 225 (0.840) | 120/160 | NT | 100% | coding (184/1404 nt) | mmuP | S‑methylmethionine transporter |
? | NC_007779 | 371973 = | 0 (0.000) | coding (635/810 nt) | mhpD | 2‑keto‑4‑pentenoate hydratase |
Only 100 of 287 total aligned reads displayed.
AAAAACTGCGCCATGAAGATGACGCGTAATAACGAAGAGGTTTCTAGCGGGCGCGGCAGCGAATGCCTGGGACATCCGCTTAATGCGGCCGTCTGGCTGGCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGTTTT > NC_007779/371873‑372073 | ggcacaggattattcttcaataccgggtacatcatttccaacactgtagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggc < 1:11241756‑M2/1‑1 (MQ=255) gcacaggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCa > 1:12636418‑M2/100‑101 (MQ=255) acaggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACg < 1:3963711‑M2/4‑1 (MQ=255) acaggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggggcgctggtggtctggctggCACg > 1:9038164‑M2/98‑101 (MQ=255) aggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCa < 1:9479736‑M2/6‑1 (MQ=255) aggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCa > 1:3556442‑M2/96‑101 (MQ=255) ggattattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggggggctggctggCACGCaa > 1:564107‑M2/95‑101 (MQ=255) ttattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAAt < 1:3077170‑M2/10‑1 (MQ=255) tattcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggggcgctgggggtctggctggCACGCAAAATg > 1:15457004‑M2/91‑101 (MQ=255) ttcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtgggctggctggCACGCAAAATGGc > 1:11620049‑M2/89‑101 (MQ=255) tcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGcc < 1:7599581‑M2/14‑1 (MQ=255) tcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGcc > 1:1192356‑M2/88‑101 (MQ=255) tcttcaataccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaaagctgctggcctatctgattggtgcgctggtgggctggctggCACGCAAAATGGcc > 1:638949‑M2/88‑101 (MQ=255) 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accgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTggg > 1:6828657‑M2/80‑101 (MQ=255) ccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGt < 1:3433019‑M2/23‑1 (MQ=255) ccgggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGt < 1:7367438‑M2/23‑1 (MQ=255) cgggtacaccatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTg < 1:7952232‑M2/24‑1 (MQ=255) gggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgttgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGa < 1:6268602‑M2/25‑1 (MQ=255) gggtacatcatttccaccactggagcggcgggaaaactgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGa > 1:14802473‑M2/77‑101 (MQ=255) ggtacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGGGaa > 1:1340680‑M2/76‑101 (MQ=255) tacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAAcc < 1:9625499‑M2/28‑1 (MQ=255) tacatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGGGAAcc > 1:2270737‑M2/74‑101 (MQ=255) acatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCg > 1:4275203‑M2/73‑101 (MQ=255) acatcatttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCg < 1:7872260‑M2/29‑1 (MQ=255) catttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctgggtggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTgc < 1:4529200‑M2/33‑1 (MQ=255) ttccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAAAGGCCAGTCTGGGGGAACCGCTGCGCa > 1:10163975‑M2/66‑101 (MQ=255) tccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCAc < 1:1373374‑M2/37‑1 (MQ=255) ccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGGGAACCCCTGCGCAcc > 1:8187275‑M2/64‑101 (MQ=255) ccaccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggggcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGGACCGCTGCGCAcc > 1:8958221‑M2/64‑101 (MQ=255) caccactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAAACGCCGCGCACCg > 1:2541039‑M2/63‑101 (MQ=255) cactggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGgag < 1:6647383‑M2/42‑1 (MQ=255) ctggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGat < 1:14923382‑M2/44‑1 (MQ=255) ctggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGat < 1:2783607‑M2/44‑1 (MQ=255) tggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGata < 1:4682669‑M2/45‑1 (MQ=255) tggagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGata < 1:7561778‑M2/45‑1 (MQ=255) gagcggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATc < 1:10374118‑M2/47‑1 (MQ=255) cggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctgggggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCAtt > 1:7191892‑M2/52‑101 (MQ=255) ggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCattt < 1:12908181‑M2/51‑2 (MQ=255) ggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTc < 1:6040868‑M2/51‑1 (MQ=255) ggcgggaacgctgctggcctatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTc > 1:5214319‑M2/51‑101 (MQ=255) ggcgggaacgctgctggcccatctgattggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTc > 1:3756851‑M2/51‑101 (MQ=255) 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ttggtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGAtggtg < 1:5996095‑M2/77‑1 (MQ=255) gtgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCg > 1:8483407‑M2/22‑101 (MQ=255) tgcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCgg > 1:1891821‑M2/21‑101 (MQ=255) gcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGt < 1:6575560‑M2/82‑1 (MQ=255) gcgctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGt > 1:14213104‑M2/20‑101 (MQ=255) gctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGa < 1:12191033‑M2/84‑1 (MQ=255) gctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGa < 1:8744204‑M2/84‑1 (MQ=255) gctggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGa > 1:14515019‑M2/18‑101 (MQ=255) tggtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAAt > 1:9897798‑M2/16‑101 (MQ=255) gtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGc > 1:7456469‑M2/14‑101 (MQ=255) gtggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGc > 1:10698080‑M2/14‑101 (MQ=255) ggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCgg > 1:15101142‑M2/12‑101 (MQ=255) ggtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCgg > 1:12588009‑M2/12‑101 (MQ=255) gtctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCggg > 1:13553275‑M2/11‑101 (MQ=255) ctggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCg < 1:10030480‑M2/93‑1 (MQ=255) ctggcaggCACGTAAAAGGGCCAGCCTGGGAGTACCGCTGCGAACCGGCGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGACCGATGGTGGAGGTGAATGAAGGCg > 1:112788/1‑101 (MQ=255) ggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGAt < 1:14582860‑M2/95‑1 (MQ=255) ggctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGAt < 1:13847236‑M2/95‑1 (MQ=255) gctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATc > 1:2418540‑M2/6‑101 (MQ=255) gctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATc > 1:2045233‑M2/6‑101 (MQ=255) gctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATc < 1:1695125‑M2/96‑1 (MQ=255) gctggCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGCCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATc < 1:12932768‑M2/96‑1 (MQ=255) gCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGttt > 1:10821398‑M2/2‑101 (MQ=255) cACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGtttt > 1:4856756/1‑101 (MQ=255) | AAAAACTGCGCCATGAAGATGACGCGTAATAACGAAGAGGTTTCTAGCGGGCGCGGCAGCGAATGCCTGGGACATCCGCTTAATGCGGCCGTCTGGCTGGCACGCAAAATGGCCAGTCTGGGTGAACCGCTGCGCACCGGAGATATCATTCTTACCGGGGCATTAGGTCCGATGGTGGCGGTGAATGCGGGCGATCGTTTT > NC_007779/371873‑372073 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |