| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_007779 | 1,170,573 | C→T | 100% | intergenic (‑164/‑77) | ycfQ ← / → ycfR | DNA‑binding transcriptional regulator/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_007779 | 1,170,573 | 0 | C→T | 100.0% | 1216.5 | 301 | intergenic (‑164/‑77) | ycfQ/ycfR | DNA‑binding transcriptional regulator/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (192/109): ref base (0/0): total (192/109) | ||||||||||
Only 100 of 304 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |