| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_007779 | 3,958,123 | Δ34 bp | 100% | coding (1156‑1189/1287 nt) | dctA → | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_007779 | 3958123 | 3958156 | 34 | 251 [0] | [1] 252 | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | = 3958122 | 0 (0.000) | 215 (1.010) | 113/176 | NT | 100% | coding (1155/1287 nt) | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter |
| ? | NC_007779 | 3958157 = | 0 (0.000) | coding (1190/1287 nt) | dctA | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter | |||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
ATCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_007779/3958021‑3958122‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGACGATGTGCTGAATAATCGTGCGCCGGATGGCAAAACGCACGAATTATCCTCTTAATC > NC_007779/3958157‑3958256 TCGTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTG > 1:2129695/1‑101 GTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTC > 1:2665921/1‑101 GTGCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTC < 1:11000302/101‑1 GCTGGCGGCGACGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGT > 1:11904130/1‑101 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CGCTCTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGG < 1:11312549/101‑1 CTCTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAA > 1:5077760/1‑101 CTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAG < 1:3547449/101‑1 CTGCGGTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATACTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAG < 1:1074756/101‑1 GTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTG < 1:5787426/101‑1 GTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTG < 1:5570446/101‑1 GTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTG < 1:8198801/101‑1 GTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTG < 1:6609097/101‑1 GTGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGAGGGTGAAAGAACTG > 1:12475850/1‑101 TGGGCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGG > 1:499883/1‑101 GCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACC > 1:11173337/1‑101 GCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACC > 1:2287721/1‑101 GCCATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTAGACC < 1:9182558/101‑1 ATTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACA > 1:8903101/1‑101 TTTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAA < 1:4387968/101‑1 TTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAA < 1:1147462/101‑1 TTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAA < 1:3225686/101‑1 TTGCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAA < 1:13277169/101‑1 GCCGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAA < 1:10545503/101‑1 CGGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAAC > 1:2205208/1‑101 GGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACT > 1:4276922/1‑101 GGTAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACT < 1:10001883/101‑1 TAGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGG < 1:1358810/101‑1 AGCGGGTCTGGCGCTGATCCTCGGTATCGACCGCTTTATGTCAGAAGCTCGTGCGCTGTCGTTGCTAAGTGGGTGAAAGAACTGGACCACAAAAAACTGGA < 1:12809542/101‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |