| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_007779 | 289856 = | NA (NA) | 159 (1.160) | 86/114 | NT | 100% | intergenic (‑327/+17) | argF/insB | ornithine carbamoyltransferase 2, chain F/IS1 transposase InsAB' |
| ? | NC_007779 | = 2176982 | 0 (0.000) | intergenic (‑281/‑69) | gatB/insH | PTS system galactitol‑specific transporter subunit IIB/IS5 element protein | |||||
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
CAACGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGA > NC_007779/2176882‑2177082 | cAACGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAg < 1:3023402/101‑1 (MQ=255)cAACGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAg > 1:4101892/1‑101 (MQ=255) aaCGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGc > 1:7438527‑M2/1‑100 (MQ=255) aCGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGca < 1:1937212‑M2/101‑3 (MQ=255) aCGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGca > 1:4473130‑M2/1‑99 (MQ=255) gCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatg > 1:624515‑M2/1‑97 (MQ=255) cAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatga > 1:9856180‑M2/1‑96 (MQ=255) aaTAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaa < 1:14253175‑M2/101‑7 (MQ=255) tAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatc > 1:9824943‑M2/1‑93 (MQ=255) aCCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgc < 1:1623824‑M2/101‑11 (MQ=255) aCCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgc > 1:12172744‑M2/1‑91 (MQ=255) aCCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgc > 1:7419017‑M2/1‑91 (MQ=255) cAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcct < 1:13005275‑M2/101‑13 (MQ=255) aCGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctca < 1:13866612‑M2/101‑15 (MQ=255) cGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcac > 1:1440277‑M2/1‑86 (MQ=255) gATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcaca < 1:1954824‑M2/101‑17 (MQ=255) gATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcaca < 1:9567837‑M2/101‑17 (MQ=255) aTACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaa < 1:4165335‑M2/101‑18 (MQ=255) aTACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaa > 1:13536979‑M2/1‑84 (MQ=255) ccGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgc > 1:4646575‑M2/1‑81 (MQ=255) ccGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgc > 1:3888249‑M2/1‑81 (MQ=255) cGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcg > 1:10751463‑M2/1‑80 (MQ=255) cACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggta > 1:905643‑M2/1‑77 (MQ=255) cACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggta < 1:9146848‑M2/101‑25 (MQ=255) aCGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtat < 1:4524546‑M2/101‑26 (MQ=255) aCGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtat < 1:788172‑M2/101‑26 (MQ=255) aCGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtat > 1:9213962‑M2/1‑76 (MQ=255) aCGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtat > 1:9892268‑M2/1‑76 (MQ=255) cgtcgtTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtatt > 1:11021710‑M2/1‑75 (MQ=255) gtcgtTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattg > 1:6783691‑M2/1‑74 (MQ=255) gtcgtTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattg > 1:13710447‑M2/1‑74 (MQ=255) gtTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaa > 1:2457483‑M2/1‑71 (MQ=255) atcatcatcCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatag < 1:3212923‑M2/101‑34 (MQ=255) tcatcatcCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagc > 1:2365719‑M2/1‑67 (MQ=255) atcatcCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgg > 1:6694721‑M2/1‑65 (MQ=255) catcCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggt < 1:10591791‑M2/101‑39 (MQ=255) catcCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggt < 1:142273‑M2/101‑39 (MQ=255) tcCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaa > 1:6552371‑M2/1‑61 (MQ=255) ccGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaat > 1:12474400‑M2/1‑60 (MQ=255) ccGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaat > 1:1158855‑M2/1‑60 (MQ=255) cGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatg < 1:10678219‑M2/101‑43 (MQ=255) gCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatga > 1:9107686‑M2/1‑58 (MQ=255) gCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatga < 1:2928987‑M2/101‑44 (MQ=255) tGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactc < 1:6473042‑M2/101‑47 (MQ=255) tGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactc > 1:13369651‑M2/1‑55 (MQ=255) cTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactcca > 1:12974384‑M2/1‑53 (MQ=255) tGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaa > 1:6002081‑M2/1‑52 (MQ=255) gAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaac > 1:7780303‑M2/1‑51 (MQ=255) aaaaTGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaact > 1:8765719‑M2/1‑50 (MQ=255) aaaaTGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaact > 1:616595‑M2/1‑50 (MQ=255) aaTGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaactta < 1:184848‑M2/101‑54 (MQ=255) aTGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttat > 1:11969273‑M2/1‑47 (MQ=255) aTGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttat > 1:3955124‑M2/1‑47 (MQ=255) gAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattg < 1:7651834‑M2/101‑57 (MQ=255) gAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattg > 1:3848537‑M2/1‑45 (MQ=255) aaCTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattga < 1:3314656‑M2/101‑58 (MQ=255) aCTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgat > 1:14332279‑M2/1‑43 (MQ=255) aCTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgat > 1:11265397‑M2/1‑43 (MQ=255) cTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgata < 1:9734740‑M2/101‑60 (MQ=255) cTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgata > 1:10039249‑M2/1‑42 (MQ=255) tttATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatag > 1:3981467‑M2/1‑41 (MQ=255) tttATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatag > 1:12327381‑M2/1‑41 (MQ=255) tATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtg > 1:8138137‑M2/1‑39 (MQ=255) aTTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgt < 1:13456133‑M2/101‑64 (MQ=255) aTTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgt > 1:6114126‑M2/1‑38 (MQ=255) tttGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgtt > 1:211307‑M2/1‑37 (MQ=255) tttGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgtt < 1:7640252‑M2/101‑65 (MQ=255) ttgttgGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttt > 1:5181465‑M2/1‑36 (MQ=255) tgttgGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgtttt < 1:3657397‑M2/101‑67 (MQ=255) tgttgGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgtttt > 1:9433103‑M2/1‑35 (MQ=255) gttgGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgtttta > 1:11448311‑M2/1‑34 (MQ=255) gttgGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgtttta < 1:11849837‑M2/101‑68 (MQ=255) ttgGCCTAAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttat > 1:12264754‑M2/1‑33 (MQ=255) tgGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatg < 1:3768428‑M2/101‑70 (MQ=255) tgGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatg < 1:8310589‑M2/101‑70 (MQ=255) tgGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatg < 1:8407751‑M2/101‑70 (MQ=255) ggCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggcattgcaatagcgagtaatgactccaacttattgatagtgttttatgt > 1:8655907‑M2/1‑31 (MQ=255) ccTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttc < 1:5362415‑M2/101‑73 (MQ=255) cTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttca > 1:7310807‑M2/1‑28 (MQ=255) aaCAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagat > 1:5698142‑M2/1‑25 (MQ=255) aCAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagata > 1:225625‑M2/1‑24 (MQ=255) cAGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataa < 1:12631188‑M2/101‑79 (MQ=255) aGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataat > 1:11139067‑M2/1‑22 (MQ=255) aGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataat < 1:5639695‑M2/101‑80 (MQ=255) aGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataat > 1:4897133‑M2/1‑22 (MQ=255) aGATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataat > 1:2521906‑M2/1‑22 (MQ=255) gATAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatg > 1:13191371‑M2/1‑21 (MQ=255) tAAATGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcc > 1:5471611‑M2/1‑19 (MQ=255) aaaTGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgccc < 1:7551287‑M2/101‑84 (MQ=255) aaTGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccg < 1:1783115‑M2/101‑85 (MQ=255) aTGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccga < 1:12874692‑M2/101‑86 (MQ=255) tGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgat > 1:1817891‑M2/1‑15 (MQ=255) tGGCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgat > 1:1373512‑M2/1‑15 (MQ=255) gCTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatga > 1:5597085‑M2/1‑13 (MQ=255) cTGACGACTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaataacgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgac < 1:1000999‑M2/101‑90 (MQ=255) gacgacTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactt < 1:6350228‑M2/101‑92 (MQ=255) acgacTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgacttt > 1:4746652‑M2/1‑9 (MQ=255) acgacTTAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgacttt < 1:4435244‑M2/101‑93 (MQ=255) ttAGcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcat < 1:2741361‑M2/101‑98 (MQ=255) gcatgaatcgcctcacaatgcggtattgcaatagcgggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgca > 1:6880900‑M2/1‑1 (MQ=255) | CAACGCAATAACCAACGATACCGCCACGTCGTTATCATCATCCGCTTGCTGAAAATGAACTTTATTTGTTGGCCTTAACAGATAAATGGCTGACGACTTAGGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGA > NC_007779/2176882‑2177082 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |