| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_007779 | 13,302 | T→C | 11.9% | G380G (GGT→GGC) | dnaK → | chaperone Hsp70, co‑chaperone with DnaJ |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_007779 | 13,302 | 0 | T→C | 11.9% | 77.7 ‑0.2 ‑0.3 | 269 | G380G (GGT→GGC) | dnaK | chaperone Hsp70, co‑chaperone with DnaJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (14/18): ref base (112/125): total (126/143) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 8.51e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 5.24e-01 | ||||||||||
Only 100 of 291 total aligned reads displayed.
CAATGGTTCAGAAGAAAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGTCTCTGGGTATCGAAACCATGGGCGGTGTGATGACGACGCTGATCGCGA > NC_007779/13202‑13402 | cAATGGTTCAGAAGAAAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGggtggt > 1:4191471/1‑101 (MQ=255)cAATGGTTCAGAAGAAAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGggtggt > 1:3874617/1‑101 (MQ=255)cAATGGTTCAGAAGAAAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGggtggt < 1:8483175/101‑1 (MQ=255) gTTCAGAAGAAAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCt < 1:4386422/101‑1 (MQ=255) agaagaAAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACt < 1:6193930/101‑1 (MQ=255) agaagaAAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACt > 1:13103877/1‑101 (MQ=255) gaagaaAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTg < 1:3700933/101‑1 (MQ=255) gaagaaAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTg > 1:3028338/1‑101 (MQ=255) gaagaaAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTg > 1:1525268/1‑101 (MQ=255) gaaAGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTg > 1:6456212/1‑101 (MQ=255) aaaGTTGCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGa > 1:8828569/1‑101 (MQ=255) gCTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTaaa < 1:11037653/101‑1 (MQ=255) cTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTaaaa < 1:6065358/101‑1 (MQ=255) cTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTaaaa < 1:6429731/101‑1 (MQ=255) cTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTaaaa > 1:6595928/1‑101 (MQ=255) cTGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTaaaa < 1:7439825/101‑1 (MQ=255) tGAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAg > 1:1897617/1‑101 (MQ=255) gAGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGa < 1:3207347/101‑1 (MQ=255) aGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGAc > 1:10731437/1‑101 (MQ=255) aGTTCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGAc < 1:10437416/101‑1 (MQ=255) ttCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGt < 1:13993395/101‑1 (MQ=255) tCTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTa < 1:9723564/101‑1 (MQ=255) cTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTAc < 1:1482580/101‑1 (MQ=255) cTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTAc < 1:9579303/101‑1 (MQ=255) cTTTGGTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTAc < 1:8474643/101‑1 (MQ=255) ggTAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTActgct < 1:5114848/101‑1 (MQ=255) tAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTActgctgc > 1:2426111/1‑101 (MQ=255) tAAAGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTActgctgc > 1:12904751/1‑101 (MQ=255) aaGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTActgctgctg > 1:11430017/1‑101 (MQ=255) aaGAGCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTActgctgctg < 1:9350512/101‑1 (MQ=255) agagCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTgg > 1:2507987/1‑101 (MQ=255) agagCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTgg > 1:2214732/1‑101 (MQ=255) agagCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTgg < 1:10148818/101‑1 (MQ=255) agagCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTgg < 1:214228/101‑1 (MQ=255) agCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGAc > 1:8408930/1‑101 (MQ=255) agCCGCGTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGAc < 1:8159609/101‑1 (MQ=255) gcgTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTa > 1:9096016/1‑101 (MQ=255) gcgTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTa < 1:12994293/101‑1 (MQ=255) cgTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTAc > 1:7554889/1‑101 (MQ=255) gTAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGTTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTAcc > 1:10241378/1‑101 (MQ=255) tAAAGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTAccc > 1:12765354/1‑101 (MQ=255) aaaGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTAcccc < 1:3594981/101‑1 (MQ=255) aaaGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTAcccc < 1:7771222/101‑1 (MQ=255) aaaGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTAcccc < 1:1314605/101‑1 (MQ=255) aaaGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTAcccc > 1:10515604/1‑101 (MQ=255) aaaGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTAcccc < 1:4734563/101‑1 (MQ=255) aGACGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGc > 1:7940059/1‑101 (MQ=255) cGTTAACCCGGACGAAGCTGTAGCAATCGGTGCTGCTGTTCAGGGTGGTGTTCTGACTGGTGACGTAAAAGACGTACTGCTGCTGGACGTTACCCCGCTGt > 1:6883747/1‑101 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |