| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 457,355 | T→A | 7.5% | L236M (TTG→ATG) | clpX → | ATPase and‑specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 457,355 | 0 | T→A | 7.5% | 47.3 ‑0.2 0.0 | 252 | L236M (TTG→ATG) | clpX | ATPase and‑specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (10/9): ref base (110/123): total (120/132) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 8.12e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
TTCCGGTGAAGGCGTACAGCAGGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTG > NC_007779/457255‑457454 | tCCGGTGAAGGCGTACAGCAGGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCtt < 1:4681063/101‑1 (MQ=255) ccGGTGAAGGCGTACAGCAGGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTg > 1:234272/1‑101 (MQ=255) ccGGTGAAGGCGTACAGCAGGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTg > 1:5661546/1‑101 (MQ=255) cGGTGAAGGCGTACAGCAGGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGc < 1:339224/101‑1 (MQ=255) tGAAGGCGTACAGCAGGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAgg < 1:5144116/101‑1 (MQ=255) gAAGGCGTACAGCAGGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGt > 1:9083237/1‑101 (MQ=255) gTACAGCAGGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCTCCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATAc > 1:9051405/1‑101 (MQ=255) gTACAGCAGGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATAc < 1:5228857/101‑1 (MQ=255) gTACAGCAGGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATAc > 1:9630901/1‑101 (MQ=255) aCAGCAGGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACct < 1:7098837/101‑1 (MQ=255) gcagGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTa < 1:1385055/101‑1 (MQ=255) cagGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTaa > 1:12131860/1‑101 (MQ=255) agGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAg > 1:10615048/1‑101 (MQ=255) agGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAg > 1:4280596/1‑101 (MQ=255) agGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAg < 1:1425888/101‑1 (MQ=255) agGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAg > 1:11761995/1‑101 (MQ=255) cACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATc < 1:12823586/101‑1 (MQ=255) cTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCt > 1:10835323/1‑101 (MQ=255) cTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCt > 1:10038875/1‑101 (MQ=255) tGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTg > 1:3976922/1‑101 (MQ=255) tGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTg < 1:13398661/101‑1 (MQ=255) gTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGt > 1:4312261/1‑101 (MQ=255) gTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGt > 1:2180950/1‑101 (MQ=255) gTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGt < 1:3202653/101‑1 (MQ=255) ttGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCCAAGATCCTGtt < 1:2332861/101‑1 (MQ=255) aaaCTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTaa > 1:5295491/1‑100 (MQ=255) aaCTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTAtt > 1:11519794/1‑101 (MQ=255) aaCTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTAtt > 1:6620128/1‑101 (MQ=255) aCTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTAttt < 1:3785869/101‑1 (MQ=255) cTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTtg > 1:9724404/1‑101 (MQ=255) tGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACATCTAAGATCCTGTTTATTtgt < 1:8659744/101‑1 (MQ=255) gATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTtgtg > 1:1110834/1‑101 (MQ=255) tCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGc > 1:1266607/1‑101 (MQ=255) cGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCg > 1:2891888/1‑101 (MQ=255) gAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCgg > 1:6112505/1‑101 (MQ=255) aaGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGt < 1:11913572/101‑1 (MQ=255) aaGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGt > 1:6435874/1‑101 (MQ=255) aaGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGt > 1:2697477/1‑101 (MQ=255) aGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTg < 1:14210802/101‑1 (MQ=255) ggTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGc < 1:13689212/101‑1 (MQ=255) gTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCg < 1:3563297/101‑1 (MQ=255) gTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCg > 1:10558112/1‑101 (MQ=255) ggTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTg < 1:11012781/101‑1 (MQ=255) ggTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTg > 1:5090792/1‑101 (MQ=255) gTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGc > 1:8051939/1‑101 (MQ=255) aGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCg < 1:590385/101‑1 (MQ=255) gctgctGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCgg < 1:12368412/101‑1 (MQ=255) ctgctgTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGt < 1:4341442/101‑1 (MQ=255) tgctgTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTc > 1:2629813/1‑101 (MQ=255) tgTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTgg < 1:2068223/101‑1 (MQ=255) cgtgcccccGCAGGGTGGGCGCAAGCTGCCGAACCAGGAGTTCATTCAGTTCGACACCTCCAATGTCCTGTTCATCGTTGCCGGTGCGTTTGCCGGTCTgg > 1:8683992/8‑101 (MQ=255) cgtgcccccGCAGGGTGGGCGCAAGCTGCCGAACCAGGAGTTCATTCAGTTCGACACCTCCAATGTCCTGTTCATCGTTGCCGGTGCGTTTGCCGGTCTgg > 1:10065654/8‑101 (MQ=255) gtgcccccGCAGGGTGGGCGCAAGCTGCCGAACCAGGAGTTCATTCAGTTCGACACCTCCAATGTCCTGTTCATCGTTGCCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGa > 1:12564119/7‑101 (MQ=255) gTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTCGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGa < 1:1792042/101‑1 (MQ=255) ttCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGAt < 1:7743316/101‑1 (MQ=255) ttCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGAt > 1:9260825/1‑101 (MQ=255) tgcccccGCAGGGTGGGCGCAAGCTGCCGAACCAGGAGTTCATTCAGTTCGACACCTCCAATGTCCTGTTCATCGTTGCCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGag > 1:12225606/6‑100 (MQ=255) gcccccGCAGGGTGGGCGCAAGCTGCCGAACCAGGAGTTCATTCAGTTCGACACCTCCAATGTCCTGTTCATCGTTGCCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGaga > 1:3679688/5‑99 (MQ=255) gcccccGCAGGGTGGGCGCAAGCTGCCGAACCAGGAGTTCATTCAGTTCGACACCTCCAATGTCCTGTTCATCGTTGCCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGaga > 1:7891927/5‑99 (MQ=255) gcccccGCAGGGTGGGCGCAAGCTGCCGAACCAGGAGTTCATTCAGTTCGACACCTCCAATGTCCTGTTCATCGTTGCCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGaga > 1:12997739/5‑99 (MQ=255) cccccGCAGGGTGGGCGCAAGCTGCCGAACCAGGAGTTCATTCAGTTCGACACCTCCAATGTCCTGTTCATCGTTGCCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGAGaa < 1:12427345/98‑1 (MQ=255) cccGCAGGGTGGGCGCAAGCTGCCGAACCAGGAGTTCATTCAGTTCGACACCTCCAATGTCCTGTTCATCGTTGCCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGAGaagg < 1:7415460/100‑3 (MQ=255) aCCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAg > 1:9773908/1‑101 (MQ=255) aCCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAg > 1:1405711/1‑101 (MQ=255) ccGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGt < 1:2752409/101‑1 (MQ=255) cGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTg > 1:9429451/1‑101 (MQ=255) cagggTGGGCGCAAGCTGCCGAACCAGGAGTTCATTCAGTTCGACACCTCCAATGTCCTGTTCATCGTTGCCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGAGAAGGtcgt > 1:5749885/4‑98 (MQ=255) cAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGAt > 1:5439947/1‑101 (MQ=255) ggTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTc < 1:3019806/101‑1 (MQ=255) gTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTcc > 1:11282687/1‑101 (MQ=255) gggCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCa > 1:1141361/1‑101 (MQ=255) ggCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCAc > 1:8240247/1‑101 (MQ=255) ggCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCAc < 1:887952/101‑1 (MQ=255) gTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCgt > 1:2461654/1‑101 (MQ=255) tAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCgtg > 1:14153014/1‑101 (MQ=255) aaaCATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCgtgt < 1:3292834/101‑1 (MQ=255) aaaCATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCgtgt > 1:12057096/1‑101 (MQ=255) aCATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAg > 1:89420/1‑101 (MQ=255) aCATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAg < 1:1044438/101‑1 (MQ=255) cATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGa > 1:916442/1‑101 (MQ=255) cATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGa < 1:7674475/101‑1 (MQ=255) aTCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGaa > 1:1088235/1‑101 (MQ=255) cGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAAcc < 1:6703717/101‑1 (MQ=255) gcagcaGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCg < 1:10707023/101‑1 (MQ=255) gcagcaGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCg > 1:1618573/1‑101 (MQ=255) cagcagGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCgg < 1:2033087/101‑1 (MQ=255) agcagGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGc > 1:4941534/1‑101 (MQ=255) gAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCgg > 1:8102444/1‑101 (MQ=255) gAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCgg < 1:2435460/101‑1 (MQ=255) gAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCgg > 1:13416536/1‑101 (MQ=255) aaTTCTTGCAGGTTGATACCTGTAAGATCCTGTGTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCGCCGTGTAGAAACCGGCTCCggt < 1:5668567/101‑2 (MQ=255) aaTTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGc < 1:3921032/101‑1 (MQ=255) ttCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCAt > 1:8329010/1‑101 (MQ=255) ttCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCAt > 1:6867400/1‑101 (MQ=255) ttCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCAt < 1:451147/101‑1 (MQ=255) ttCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCAt < 1:7299475/101‑1 (MQ=255) tCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCAtt < 1:1046114/101‑1 (MQ=255) cTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTg > 1:1874455/1‑101 (MQ=255) cTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTg < 1:4239207/101‑1 (MQ=255) cTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTg < 1:5534291/101‑1 (MQ=255) | TTCCGGTGAAGGCGTACAGCAGGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTG > NC_007779/457255‑457454 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |