| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 457,375 | G→T | 7.9% | K242N (AAG→AAT) | clpX → | ATPase and‑specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 457,375 | 0 | G→T | 7.9% | 40.4 ‑0.2 ‑0.0 | 238 | K242N (AAG→AAT) | clpX | ATPase and‑specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (10/9): ref base (107/112): total (117/121) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 8.14e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 9.97e-01 | ||||||||||
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
AGGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTGGTTTTGGCGCGACGGTAAAAG > NC_007779/457275‑457475 | agGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAg < 1:139253/101‑1 (MQ=255)agGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAg < 1:1425888/101‑1 (MQ=255)agGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAg > 1:11761995/1‑101 (MQ=255)agGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAg > 1:3963147/1‑101 (MQ=255) ggCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGa < 1:5741677/101‑1 (MQ=255) cACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATc < 1:12823586/101‑1 (MQ=255) cTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCt > 1:10038875/1‑101 (MQ=255) tGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTg > 1:5171/1‑101 (MQ=255) tGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTg < 1:8583412/101‑1 (MQ=255) gTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGt > 1:2180950/1‑101 (MQ=255) gTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGt < 1:3202653/101‑1 (MQ=255) ttGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCCAAGATCCTGtt < 1:2332861/101‑1 (MQ=255) gAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTa < 1:3463811/101‑1 (MQ=255) aaaCTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTAt < 1:12403689/101‑1 (MQ=255) aCTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTAttt < 1:3785869/101‑1 (MQ=255) cTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTtg > 1:9724404/1‑101 (MQ=255) tGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTtgt < 1:2666101/101‑1 (MQ=255) aTCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTgg > 1:4270377/1‑101 (MQ=255) aTCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTgg > 1:10611322/1‑101 (MQ=255) tCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGc < 1:3091667/101‑1 (MQ=255) tCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGc < 1:2810862/101‑1 (MQ=255) cGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCg > 1:2891888/1‑101 (MQ=255) gAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCgg > 1:6112505/1‑101 (MQ=255) aaGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGt > 1:11450286/1‑101 (MQ=255) aaGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGt < 1:11913572/101‑1 (MQ=255) aaGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGt > 1:6435874/1‑101 (MQ=255) aGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTg < 1:4508293/101‑1 (MQ=255) gTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCg < 1:3563297/101‑1 (MQ=255) gTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCg < 1:3363079/101‑1 (MQ=255) tACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTTGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGt > 1:9094177/1‑101 (MQ=255) aCGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGtt > 1:10852587/1‑101 (MQ=255) ggTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTg < 1:11012781/101‑1 (MQ=255) ggTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTg > 1:5090792/1‑101 (MQ=255) aGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCg < 1:590385/101‑1 (MQ=255) gctgctGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCgg < 1:12368412/101‑1 (MQ=255) gctgctGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCgg < 1:4828640/101‑1 (MQ=255) ctgctgTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGt < 1:12607362/101‑1 (MQ=255) ctgctgTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGt < 1:4341442/101‑1 (MQ=255) ctgctgTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGt > 1:7203610/1‑101 (MQ=255) tgctgTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTc > 1:2629813/1‑101 (MQ=255) tgctgTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTc > 1:149134/1‑101 (MQ=255) cgtgcccccGCAGGGTGGGCGCAAGCTGCCGAACCAGGAGTTCATTCAGTTCGACACCTCCAATGTCCTGTTCATCGTTGCCGGTGCGTTTGCCGGTCTgg > 1:10065654/8‑101 (MQ=255) cgtgcccccGCAGGGTGGGCGCAAGCTGCCGAACCAGGAGTTCATTCAGTTCGACACCTCCAATGTCCTGTTCATCGTTGCCGGTGCGTTTGCCGGTCTgg > 1:8683992/8‑101 (MQ=255) gTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGa < 1:1763832/101‑1 (MQ=255) gTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTCGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGa < 1:1792042/101‑1 (MQ=255) tCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATa < 1:7456997/101‑1 (MQ=255) tCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATa > 1:12501717/1‑101 (MQ=255) gcccccGCAGGGTGGGCGCAAGCTGCCGAACCAGGAGTTCATTCAGTTCGACACCTCCAATGTCCTGTTCATCGTTGCCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGaga > 1:12997739/5‑99 (MQ=255) gcccccGCAGGGTGGGCGCAAGCTGCCGAACCAGGAGTTCATTCAGTTCGACACCTCCAATGTCCTGTTCATCGTTGCCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGaga > 1:3679688/5‑99 (MQ=255) ccACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGGGCGGTTGCCGGTCTGGATaa > 1:14057700/1‑101 (MQ=255) cccGCAGGGTGGGCGCAAGCTGCCGAACCAGGAGTTCATTCAGTTCGACACCTCCAATGTCCTGTTCATCGTTGCCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGAGaagg > 1:11117176/2‑99 (MQ=255) aCCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAg > 1:9773908/1‑101 (MQ=255) aCCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAg < 1:2062574/101‑1 (MQ=255) cGCAGGGTGGGCGCAAGCTGCCGAACCAGGAGTTCATTCAGTTCGACACCTCCAATGTCCTGTTCATCGTTGCCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGAGAAGGtc < 1:5264330/101‑2 (MQ=255) cGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTg > 1:9429451/1‑101 (MQ=255) gCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGa > 1:12702904/1‑101 (MQ=255) aaGGTGGGCGTAAACATCGGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGAtt > 1:8828599/1‑101 (MQ=255) ggTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTc > 1:7866054/1‑101 (MQ=255) gTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTcc > 1:5856167/1‑101 (MQ=255) gggCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCa > 1:1141361/1‑101 (MQ=255) ggCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCAc > 1:8240247/1‑101 (MQ=255) gCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCAcc < 1:13548683/101‑1 (MQ=255) gTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCgt > 1:8079408/1‑101 (MQ=255) tAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCgtg > 1:9240907/1‑101 (MQ=255) tAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCgtg > 1:14153014/1‑101 (MQ=255) tAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCgtg > 1:4289356/1‑101 (MQ=255) aaaCATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCgtgt > 1:12057096/1‑101 (MQ=255) aCATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAg < 1:1044438/101‑1 (MQ=255) aCATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAg > 1:89420/1‑101 (MQ=255) cATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGa < 1:7674475/101‑1 (MQ=255) aTCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGaa < 1:3979409/101‑1 (MQ=255) tCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGaaa < 1:13408570/101‑1 (MQ=255) cGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAAcc < 1:6703717/101‑1 (MQ=255) gcagcaGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCg > 1:5409306/1‑101 (MQ=255) gcagcaGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCg < 1:10707023/101‑1 (MQ=255) gcagcaGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCg > 1:12177280/1‑101 (MQ=255) ggAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCg > 1:7974010/1‑101 (MQ=255) gAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCgg < 1:2435460/101‑1 (MQ=255) gAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCgg > 1:8102444/1‑101 (MQ=255) aaTTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGc < 1:5668566/101‑1 (MQ=255) ttCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCAt < 1:13224905/101‑1 (MQ=255) ttCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCAt > 1:6867400/1‑101 (MQ=255) tCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCAtt < 1:1046114/101‑1 (MQ=255) cTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTg > 1:1874455/1‑101 (MQ=255) tGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTGGt > 1:11274321/1‑101 (MQ=255) gCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTGGtt < 1:8918377/101‑1 (MQ=255) gCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTGGtt > 1:3695443/1‑101 (MQ=255) gTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTGGTTTTgg > 1:7742228/1‑101 (MQ=255) tGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTGGTTTTGgcg > 1:1927247/1‑101 (MQ=255) tGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTGGTTTTGgcg < 1:4732670/101‑1 (MQ=255) gATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTGGTTTTGgcgc < 1:10896149/101‑1 (MQ=255) aTACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTGGTTTTGGcgcg > 1:2411112/1‑101 (MQ=255) ctctAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTGGTTTTGGCGCGACgg < 1:7363741/101‑1 (MQ=255) ctctAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTGGTTTTGGCGCGACgg > 1:10624072/1‑101 (MQ=255) tctAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTGGTTTTGGCGCGACGGt < 1:5495367/101‑1 (MQ=255) ctAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTGGTTTTGGCGCGACGGTa > 1:2108162/1‑101 (MQ=255) tAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTGGTTTTGGCGCGACGGTaa < 1:13979901/101‑1 (MQ=255) aGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTGGTTTTGGCGCGACGGTaaaa < 1:9039660/101‑1 (MQ=255) gATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTGGTTTTGGCGCGACGGTAAAAg > 1:7057060/1‑101 (MQ=255) gATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTGGTTTTGGCGCGACGGTAAAAg < 1:5066922/101‑1 (MQ=255) | AGGCACTGTTGAAACTGATCGAAGGTACGGTAGCTGCTGTTCCACCGCAAGGTGGGCGTAAACATCCGCAGCAGGAATTCTTGCAGGTTGATACCTCTAAGATCCTGTTTATTTGTGGCGGTGCGTTTGCCGGTCTGGATAAAGTGATTTCCCACCGTGTAGAAACCGGCTCCGGCATTGGTTTTGGCGCGACGGTAAAAG > NC_007779/457275‑457475 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |