| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 725,830 | T→C | 13.7% | K543K (AAA→AAG) | kdpB ← | potassium translocating ATPase, subunit B |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 725,830 | 0 | T→C | 13.7% | 97.5 ‑0.8 ‑0.5 | 255 | K543K (AAA→AAG) | kdpB | potassium translocating ATPase, subunit B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (19/16): ref base (103/117): total (122/133) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.68e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.22e-01 | ||||||||||
Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
TGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGAC > NC_007779/725730‑725930 | tggtCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCctct < 1:596109/101‑1 (MQ=255)tggtCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCctct < 1:7633823/101‑1 (MQ=255) ggtCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCtt < 1:9054086/101‑1 (MQ=255) gtCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCttt < 1:14203045/101‑1 (MQ=255) tCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTc < 1:10443553/101‑1 (MQ=255) tCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTc < 1:6527403/101‑1 (MQ=255) aGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTcgc > 1:325697/1‑101 (MQ=255) cGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTcgccg > 1:2180445/1‑101 (MQ=255) cGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTcgccg < 1:11209409/101‑1 (MQ=255) gAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTcgccgc < 1:5600651/101‑1 (MQ=255) gAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTcgccgc > 1:12985920/1‑101 (MQ=255) gCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCt < 1:14062473/101‑1 (MQ=255) cACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTgg < 1:1700778/101‑1 (MQ=255) cACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTgg > 1:1634268/1‑101 (MQ=255) aCGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTggg > 1:5176008/1‑101 (MQ=255) cGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCTCCGCCTGGGt > 1:10478071/1‑101 (MQ=255) gggTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTg > 1:9686556/1‑101 (MQ=255) gggTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTg > 1:1083245/1‑101 (MQ=255) ggTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGc < 1:3335046/101‑1 (MQ=255) gTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGcc < 1:948756/101‑1 (MQ=255) aGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGtt > 1:13647784/1‑101 (MQ=255) aGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGtt < 1:6667953/101‑1 (MQ=255) aGCACCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGtt < 1:6184675/101‑1 (MQ=255) cATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCa < 1:8208435/101‑1 (MQ=255) aTCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCAt < 1:1295978/101‑1 (MQ=255) cTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCg < 1:9606496/101‑1 (MQ=255) cTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCg < 1:3754056/101‑1 (MQ=255) tttGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCa > 1:809949/1‑101 (MQ=255) ttGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCAc > 1:3978539/1‑101 (MQ=255) ttGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCAc < 1:13208594/101‑1 (MQ=255) tGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCAcc < 1:13749172/101‑1 (MQ=255) ccAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACcgc < 1:6427701/101‑1 (MQ=255) ccAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACcgc > 1:7094832/1‑101 (MQ=255) cAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACcgcg < 1:1472489/101‑1 (MQ=255) aTGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGAc > 1:2501995/1‑101 (MQ=255) gtgCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACAt < 1:12164055/101‑1 (MQ=255) gtgCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACAt > 1:11750374/1‑101 (MQ=255) tgCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATc > 1:6990813/1‑101 (MQ=255) ccaccTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATctgcc < 1:5065332/101‑1 (MQ=255) ccaccTCGATCAAATTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATctgcc < 1:13885407/101‑1 (MQ=255) caccTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATctgcct > 1:8176640/1‑101 (MQ=255) accTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATctgcctg > 1:6085597/1‑101 (MQ=255) accTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATctgcctg < 1:1009459/101‑1 (MQ=255) cTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTgcg > 1:6930527/1‑101 (MQ=255) cTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTgcg < 1:4620450/101‑1 (MQ=255) cTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTgcg > 1:284359/1‑101 (MQ=255) cGACCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGcc > 1:2692742/1‑101 (MQ=255) gATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCa < 1:8705926/101‑1 (MQ=255) aTCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAg > 1:13581545/1‑101 (MQ=255) tgagcTTGGTCGGATCCGAATCCAGGTCCACCATGTTGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCaat < 1:13928059/97‑3 (MQ=255) cAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAgcg < 1:14250680/101‑1 (MQ=255) cAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAgcg < 1:2069576/101‑1 (MQ=255) aaCTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAgcgc > 1:7564048/1‑101 (MQ=255) cTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCg > 1:10948478/1‑101 (MQ=255) cTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCg > 1:12745568/1‑101 (MQ=255) cTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCg > 1:5279640/1‑101 (MQ=255) ttGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCgg < 1:3206416/101‑1 (MQ=255) ttGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCgg > 1:2382172/1‑101 (MQ=255) gTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGc < 1:9155141/101‑1 (MQ=255) cGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCAt < 1:10638616/101‑1 (MQ=255) gggTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATc > 1:4283303/1‑101 (MQ=255) ttAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCTCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGtt > 1:13309241/1‑101 (MQ=255) tAGAGCCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTg < 1:931784/101‑1 (MQ=255) gagTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGt < 1:9359395/101‑1 (MQ=255) agTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTg > 1:4122338/1‑101 (MQ=255) cGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCg < 1:9930443/101‑1 (MQ=255) gagaTCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGt < 1:4225832/101‑1 (MQ=255) gagaTCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGt > 1:11420366/1‑101 (MQ=255) agaTCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTc < 1:3639534/101‑1 (MQ=255) ggtccaCCATGTTGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTca < 1:8523707/96‑2 (MQ=255) gtccaCCATGTTGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTTATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTcac > 1:13963372/5‑99 (MQ=255) gtccaCCATGTTGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTcac < 1:2014209/97‑3 (MQ=255) gtccaCCATGTTGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTcac < 1:7417863/97‑3 (MQ=255) tccaCCATGTTGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCAcc > 1:12066657/4‑101 (MQ=255) tCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGcc < 1:5647193/101‑1 (MQ=255) tCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGcc > 1:10244077/1‑101 (MQ=255) 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aCCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGt < 1:9392918/101‑1 (MQ=255) aCCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGCTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGTCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGt > 1:8773309/1‑101 (MQ=255) ccATGTTGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTc > 1:13801970/1‑101 (MQ=255) cATGTTGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCa < 1:4535960/101‑1 (MQ=255) atgttGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCAt < 1:1933413/98‑1 (MQ=255) atgttGGCCGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGGGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCAt > 1:5472692/4‑101 (MQ=255) atatTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCAt < 1:9813006/101‑1 (MQ=255) atatTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCAt > 1:3177188/1‑101 (MQ=255) tatTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATc < 1:5789431/101‑1 (MQ=255) ttGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGc > 1:12453989/1‑101 (MQ=255) tggccGCTTCCTTCGCCGCCGACGTACCAGTGTTCATTGCCACGCCCACATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGcg > 1:6760968/4‑100 (MQ=255) tGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCt < 1:13153920/101‑1 (MQ=255) gCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCaa < 1:11537976/101‑1 (MQ=255) gCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCaa > 1:4991906/1‑101 (MQ=255) ctctTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAAc > 1:10292101/1‑101 (MQ=255) ctctTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAAc < 1:10157325/101‑1 (MQ=255) tttCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGAc < 1:3794378/101‑1 (MQ=255) | TGGTCAGCGAGCCACGGGTCATCAGCATCTGTTTGCCAATGTGCACCACCTCGATCAACTTGGTCGGGTTAGAGTCGAGATCGACCATATTGCCCGCCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGAC > NC_007779/725730‑725930 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |