| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_007779 | 725,926 | A→G | 7.2% | R511R (CGT→CGC) | kdpB ← | potassium translocating ATPase, subunit B |
| Read alignment evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_007779 | 725,926 | 0 | A→G | 7.2% | 41.1 ‑1.9 ‑0.2 | 264 | R511R (CGT→CGC) | kdpB | potassium translocating ATPase, subunit B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (14/5): ref base (132/113): total (146/118) | ||||||||||
| Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.49e-01 | ||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 6.52e-01 | ||||||||||
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
CCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCGCAGCAATCGCGGCGG > NC_007779/725826‑726026 | ccTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCaaa < 1:8602422/101‑1 (MQ=255)ccTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCaaa < 1:2108174/101‑1 (MQ=255) ctctTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAAc > 1:4324392/1‑101 (MQ=255) ctctTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAAc > 1:13630588/1‑101 (MQ=255) ctctTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAAc > 1:9176250/1‑101 (MQ=255) ctctTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAAc > 1:11307409/1‑101 (MQ=255) ctctTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAAc < 1:10157325/101‑1 (MQ=255) ctTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGa > 1:9083929/1‑101 (MQ=255) tttCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGAc < 1:3794378/101‑1 (MQ=255) tttCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGAc > 1:10890487/1‑101 (MQ=255) tttCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGAc > 1:1213894/1‑101 (MQ=255) ttCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGAcc > 1:7937050/1‑101 (MQ=255) tCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCt > 1:6265593/1‑101 (MQ=255) gccgccTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTc > 1:4617334/1‑101 (MQ=255) gccgccTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTc > 1:5443578/1‑101 (MQ=255) gccgccTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTc < 1:11767838/101‑1 (MQ=255) ccgccTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTcc < 1:10542297/101‑1 (MQ=255) cgccTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCg > 1:8834939/1‑101 (MQ=255) gccTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGc > 1:10223275/1‑101 (MQ=255) cTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCt > 1:4940334/1‑101 (MQ=255) cTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCt < 1:9317409/101‑1 (MQ=255) tGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTg > 1:6784757/1‑101 (MQ=255) ggTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGAt < 1:10817813/101‑1 (MQ=255) ggTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGAt < 1:2598764/101‑1 (MQ=255) gTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATa < 1:11453543/101‑1 (MQ=255) tGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATAc < 1:13101640/101‑1 (MQ=255) ggAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGAc > 1:187654/1‑101 (MQ=255) gAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACg > 1:9261529/1‑101 (MQ=255) gAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACg > 1:7098455/1‑101 (MQ=255) gAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACg < 1:5705097/101‑1 (MQ=255) aGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACgg > 1:383737/1‑101 (MQ=255) aGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATAGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACgg < 1:11007606/101‑1 (MQ=255) ttCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGAt > 1:13910664/1‑101 (MQ=255) aTCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCaa > 1:4240903/1‑101 (MQ=255) aTCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCaa > 1:4121416/1‑101 (MQ=255) tCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAAt < 1:7182995/101‑1 (MQ=255) cGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATg > 1:13536326/1‑101 (MQ=255) ccACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGcc > 1:899403/1‑101 (MQ=255) ccACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGcc > 1:8268880/1‑101 (MQ=255) cACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCa > 1:9488538/1‑101 (MQ=255) cACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCa > 1:9614395/1‑101 (MQ=255) gcgACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCtt < 1:13281759/101‑1 (MQ=255) gcgACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCtt > 1:6600895/1‑101 (MQ=255) cgACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTg < 1:12934040/101‑1 (MQ=255) cgACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTg > 1:12400887/1‑101 (MQ=255) aCATCTGCCTGCGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGCGACCAGGCGTCCCTTCGACTGCTCCTTGCGGATCAACTCTAGCttctg > 1:584960/1‑98 (MQ=255) ctgcctgcGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTCATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTca < 1:11233912/101‑2 (MQ=255) tgcctgcGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCg < 1:9409495/101‑1 (MQ=255) gcctgcGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGCGACCAGGCGTCCCTTCGACTGCTCCTTGCGGATCAACTCTAGCTTCTGCTCCgg > 1:14138669/1‑101 (MQ=255) gcctgcGCCAATGCCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGCGACCAGGCGTCCCTTCGACTGCTCCTTGCGGATCAACTCTAGCTTCTGCTCCgg > 1:12523249/1‑101 (MQ=255) ctgcGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGgtg < 1:8697374/101‑1 (MQ=255) cgcCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCg < 1:4449024/101‑1 (MQ=255) cgcCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCCTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGCCCTTCCGCCTGATACTGCCGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCg < 1:5963874/101‑1 (MQ=255) ccAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCt < 1:4045994/101‑1 (MQ=255) ccAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCt < 1:11069166/101‑1 (MQ=255) cAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCtt < 1:5892737/101‑1 (MQ=255) cAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCtt > 1:13492898/1‑101 (MQ=255) aatgcCGGTGCATCGTTGGTGCCGTCACCGGTCATGGCGACCAGGCGTCCCTTCGACTGCTCCTTGCGGATCAACTCTAGCTTCTGCTCCGGGGTGGCCTc > 1:4732543/4‑101 (MQ=255) cgcCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCgg > 1:576514/1‑101 (MQ=255) cgcCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCgg < 1:9352774/101‑1 (MQ=255) gcCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGc < 1:11166820/101‑1 (MQ=255) gcCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGc < 1:2504808/101‑1 (MQ=255) ccGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCg < 1:1956350/101‑1 (MQ=255) ccGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCg < 1:10718535/101‑1 (MQ=255) cGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCga > 1:11625369/1‑101 (MQ=255) cGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCga > 1:6743436/1‑101 (MQ=255) cGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCga < 1:10014155/101‑1 (MQ=255) aGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGaa > 1:5661617/1‑101 (MQ=255) gCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGaaa > 1:1697901/1‑101 (MQ=255) gCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGaaa < 1:6863214/101‑1 (MQ=255) tCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAatc < 1:3724058/101‑1 (MQ=255) cGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAatca < 1:14308916/101‑1 (MQ=255) cGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAatca > 1:7718457/1‑101 (MQ=255) gTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAatcat > 1:2259204/1‑101 (MQ=255) ttGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAatcatc < 1:3047884/101‑1 (MQ=255) cGTCGCCGGTCATCGCTGCCAAACGACCTCCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACAccc < 1:5094212/101‑1 (MQ=255) gTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCg > 1:691766/1‑101 (MQ=255) cGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCt < 1:7836056/101‑1 (MQ=255) ccGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTc < 1:9800920/101‑1 (MQ=255) cGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTcc > 1:12671210/1‑101 (MQ=255) tCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCgca < 1:8482557/101‑1 (MQ=255) tCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCgca > 1:6130698/1‑101 (MQ=255) tCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCgca < 1:3015785/101‑1 (MQ=255) cATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCgcag > 1:10494957/1‑101 (MQ=255) tCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCgcagca > 1:9593188/1‑101 (MQ=255) cGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCGCAGCaa > 1:1576977/1‑101 (MQ=255) gCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCTCTTCCGCAGCAAt > 1:6347660/1‑101 (MQ=255) cTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCGCAGCAATc < 1:13746712/101‑1 (MQ=255) cTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCGCAGCAATc < 1:13050965/101‑1 (MQ=255) cTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCGCAGCAATc < 1:5247463/101‑1 (MQ=255) tACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCGCAGCAATcg > 1:2299114/1‑101 (MQ=255) tACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCGCAGCAATcg < 1:11974034/101‑1 (MQ=255) aCCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCGCAGCAATcgc > 1:12092581/1‑101 (MQ=255) cAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCGCAGCAATCgcgg < 1:12049638/101‑1 (MQ=255) cAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCGCAGCAATCgcgg > 1:14246921/1‑101 (MQ=255) aaaCGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCGCAGCAATCgcggc > 1:353226/1‑101 (MQ=255) aaaCGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCGCAGCAATCgcggc > 1:2419713/1‑101 (MQ=255) aaaCGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCGCAGCAATCgcggc > 1:7358240/1‑101 (MQ=255) aCGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCGCAGCAATCGcggcgg > 1:217211/1‑101 (MQ=255) aCGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCGCAGCAATCGcggcgg > 1:3201953/1‑101 (MQ=255) | CCTCTTTCGCCGCCTGGGTGCCGGAGTTCATCGCCACCGCGACATCTGCCTGCGCCAGCGCCGGAGCATCGTTGGTGCCGTCGCCGGTCATCGCTACCAAACGACCTTCCGCCTGATACTGACGGATCAATGCCAGCTTGGCCTCCGGTGTCGCTTCGGCGAGAAAATCATCGACACCCGCTTCCGCAGCAATCGCGGCGG > NC_007779/725826‑726026 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |